RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565849.5

E2F4-206, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-206ENST00000565849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.12■■■■■ 8.17
E2F4-206ENST00000565849 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.96■■■■■ 7.03
E2F4-206ENST00000565849 ABCC9O60706 1549 aa58.1■■■■■ 6.89
E2F4-206ENST00000565849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.67■■■■■ 6.5
E2F4-206ENST00000565849 NACADO15069 1562 aa55.49■■■■■ 6.47
E2F4-206ENST00000565849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.44■■■■■ 6.47
E2F4-206ENST00000565849 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55■■■■■ 6.4
E2F4-206ENST00000565849 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.98■■■■■ 6.39
E2F4-206ENST00000565849 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.64■■■■■ 6.34
E2F4-206ENST00000565849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.49■■■■■ 6.31
E2F4-206ENST00000565849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.22■■■■■ 6.27
E2F4-206ENST00000565849 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.03■■■■■ 6.24
E2F4-206ENST00000565849 SCRIBQ14160 1630 aa53.83■■■■■ 6.21
E2F4-206ENST00000565849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.65■■■■■ 6.18
E2F4-206ENST00000565849 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.33■■■■■ 6.13
E2F4-206ENST00000565849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.63■■■■■ 6.02
E2F4-206ENST00000565849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.53■■■■■ 6
E2F4-206ENST00000565849 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.22■■■■■ 5.95
E2F4-206ENST00000565849 SMARCA4P51532 1647 aa51.42■■■■■ 5.82
E2F4-206ENST00000565849 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.27■■■■■ 5.8
E2F4-206ENST00000565849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.2■■■■■ 5.79
E2F4-206ENST00000565849 NCAPD3P42695 1498 aa51.19■■■■■ 5.79
E2F4-206ENST00000565849 SMARCA2P51531 1590 aa51.11■■■■■ 5.77
E2F4-206ENST00000565849 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.98■■■■■ 5.75
E2F4-206ENST00000565849 HMGXB3Q12766 1538 aa50.93■■■■■ 5.74
E2F4-206ENST00000565849 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.87■■■■■ 5.73
E2F4-206ENST00000565849 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
E2F4-206ENST00000565849 WIZO95785 1651 aa50.44■■■■■ 5.67
E2F4-206ENST00000565849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.23■■■■■ 5.63
E2F4-206ENST00000565849 NESP48681 1621 aa50.18■■■■■ 5.62
E2F4-206ENST00000565849 ERCC6Q03468 1493 aa50.09■■■■■ 5.61
E2F4-206ENST00000565849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.93■■■■■ 5.58
E2F4-206ENST00000565849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
E2F4-206ENST00000565849 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.69■■■■■ 5.55
E2F4-206ENST00000565849 CUX2O14529 1486 aa49.65■■■■■ 5.54
E2F4-206ENST00000565849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.6■■■■■ 5.53
E2F4-206ENST00000565849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.59■■■■■ 5.53
E2F4-206ENST00000565849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
E2F4-206ENST00000565849 CFTRP13569 1480 aa49.32■■■■■ 5.49
E2F4-206ENST00000565849 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.25■■■■■ 5.48
E2F4-206ENST00000565849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.17■■■■■ 5.46
E2F4-206ENST00000565849 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.14■■■■■ 5.46
E2F4-206ENST00000565849 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.13■■■■■ 5.46
E2F4-206ENST00000565849 PRDM2Q13029 1718 aa49■■■■■ 5.43
E2F4-206ENST00000565849 WDR62O43379 1518 aa48.99■■■■■ 5.43
E2F4-206ENST00000565849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.72■■■■■ 5.39
E2F4-206ENST00000565849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
E2F4-206ENST00000565849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.56■■■■■ 5.36
E2F4-206ENST00000565849 TOPBP1Q92547 1522 aa48.33■■■■■ 5.33
E2F4-206ENST00000565849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.25■■■■■ 5.31
E2F4-206ENST00000565849 ABCC8Q09428 1581 aa48.24■■■■■ 5.31
E2F4-206ENST00000565849 IFT140Q96RY7 1462 aa48.1■■■■■ 5.29
E2F4-206ENST00000565849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
E2F4-206ENST00000565849 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.91■■■■■ 5.26
E2F4-206ENST00000565849 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
E2F4-206ENST00000565849 CUX1P39880 1505 aa47.85■■■■■ 5.25
E2F4-206ENST00000565849 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
E2F4-206ENST00000565849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.74■■■■■ 5.23
E2F4-206ENST00000565849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.72■■■■■ 5.23
E2F4-206ENST00000565849 SOGA1O94964 1423 aa47.68■■■■■ 5.22
E2F4-206ENST00000565849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.65■■■■■ 5.222e-7■■■■■ 30.6
E2F4-206ENST00000565849 OSCARQ8IYS5 282 aa47.51■■■■■ 5.2
E2F4-206ENST00000565849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
E2F4-206ENST00000565849 WDR97A6NE52 1622 aa47.39■■■■■ 5.18
E2F4-206ENST00000565849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.37■■■■■ 5.17
E2F4-206ENST00000565849 SYNJ1O43426 1573 aa47.33■■■■■ 5.17
E2F4-206ENST00000565849 TOP2BQ02880 1626 aa47.33■■■■■ 5.17
E2F4-206ENST00000565849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.33■■■■■ 5.17
E2F4-206ENST00000565849 CHD1O14646 1710 aa47.27■■■■■ 5.16
E2F4-206ENST00000565849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.23■■■■■ 5.15
E2F4-206ENST00000565849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.2■■■■■ 5.15
E2F4-206ENST00000565849 GRIN2BQ13224 1484 aa47.16■■■■■ 5.14
E2F4-206ENST00000565849 FBLN2P98095 1184 aa47.15■■■■■ 5.14
E2F4-206ENST00000565849 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.13■■■■■ 5.13
E2F4-206ENST00000565849 PBRM1Q86U86 1689 aa47.13■■■■■ 5.13
E2F4-206ENST00000565849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.11■■■■■ 5.13
E2F4-206ENST00000565849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.07■■■■■ 5.13
E2F4-206ENST00000565849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
E2F4-206ENST00000565849 SYNJ2O15056 1496 aa46.91■■■■■ 5.1
E2F4-206ENST00000565849 TRIM41Q8WV44 630 aa46.9■■■■■ 5.1
E2F4-206ENST00000565849 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.87■■■■■ 5.09
E2F4-206ENST00000565849 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.87■■■■■ 5.09
E2F4-206ENST00000565849 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.87■■■■■ 5.09
E2F4-206ENST00000565849 ARHGEF11O15085 1522 aa46.8■■■■■ 5.08
E2F4-206ENST00000565849 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.7■■■■■ 5.07
E2F4-206ENST00000565849 ADAMTS12P58397 1594 aa46.7■■■■■ 5.07
E2F4-206ENST00000565849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.65■■■■■ 5.06
E2F4-206ENST00000565849 GRIN2AQ12879 1464 aa46.57■■■■■ 5.05
E2F4-206ENST00000565849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.55■■■■■ 5.04
E2F4-206ENST00000565849 ARAP1Q96P48 1450 aa46.41■■■■■ 5.02
E2F4-206ENST00000565849 CEP170Q5SW79 1584 aa46.4■■■■■ 5.02
E2F4-206ENST00000565849 KIF27Q86VH2 1401 aa46.39■■■■■ 5.02
E2F4-206ENST00000565849 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.38■■■■■ 5.02
E2F4-206ENST00000565849 NUP160Q12769 1436 aa46.37■■■■■ 5.01
E2F4-206ENST00000565849 IGF1RP08069 1367 aa46.25■■■■■ 4.99
E2F4-206ENST00000565849 CUL7Q14999 1698 aa46.19■■■■■ 4.98
E2F4-206ENST00000565849 SHROOM2Q13796 1616 aa46.09■■■■■ 4.97
E2F4-206ENST00000565849 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.08■■■■■ 4.97
E2F4-206ENST00000565849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.03■■■■■ 4.96
E2F4-206ENST00000565849 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.97■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms