RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	37.45	■■■■□ 3.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		37.43	■■■■□ 3.58
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		37.4	■■■■□ 3.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	37.34	■■■■□ 3.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		37.16	■■■■□ 3.54
PPP4C-205	ENST00000563200	IQGAP2	Q13576	1575 aa		37.1	■■■■□ 3.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		36.98	■■■■□ 3.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		36.97	■■■■□ 3.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PRX	Q9BXM0	1461 aa		36.96	■■■■□ 3.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRG	P23470	1445 aa		36.93	■■■■□ 3.5
PPP4C-205	ENST00000563200	DISP1	Q96F81	1524 aa		36.92	■■■■□ 3.5
PPP4C-205	ENST00000563200	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		36.92	■■■■□ 3.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		36.91	■■■■□ 3.5
PPP4C-205	ENST00000563200	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		36.85	■■■■□ 3.49
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPKBP1	O60336	1514 aa		36.85	■■■■□ 3.49
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		36.84	■■■■□ 3.49
PPP4C-205	ENST00000563200	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	36.83	■■■■□ 3.49
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0556	O60303	1618 aa		36.77	■■■■□ 3.48
PPP4C-205	ENST00000563200	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	36.75	■■■■□ 3.47
PPP4C-205	ENST00000563200	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		36.75	■■■■□ 3.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		36.75	■■■■□ 3.47
PPP4C-205	ENST00000563200	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		36.7	■■■■□ 3.47
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC2	Q92887	1545 aa		36.69	■■■■□ 3.46
PPP4C-205	ENST00000563200	EEA1	Q15075	1411 aa		36.69	■■■■□ 3.46
PPP4C-205	ENST00000563200	UACA	Q9BZF9	1416 aa		36.68	■■■■□ 3.46
PPP4C-205	ENST00000563200	DIP2B	Q9P265	1576 aa		36.66	■■■■□ 3.46
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		36.63	■■■■□ 3.45
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA3	Q08378	1498 aa		36.61	■■■■□ 3.45
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		36.54	■■■■□ 3.44
PPP4C-205	ENST00000563200	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		36.53	■■■■□ 3.44
PPP4C-205	ENST00000563200	ASXL2	Q76L83	1435 aa		36.5	■■■■□ 3.43
PPP4C-205	ENST00000563200	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		36.47	■■■■□ 3.43
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	36.45	■■■■□ 3.43
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	36.44	■■■■□ 3.42
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA8	O94911	1581 aa		36.43	■■■■□ 3.42
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF21B	O75037	1637 aa		36.39	■■■■□ 3.42
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD9	Q5K651	1589 aa		36.38	■■■■□ 3.41
PPP4C-205	ENST00000563200	GLI2	P10070	1586 aa		36.37	■■■■□ 3.41
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPOAP1	O95153	1857 aa		36.35	■■■■□ 3.41
PPP4C-205	ENST00000563200	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	36.3	■■■■□ 3.4
PPP4C-205	ENST00000563200	P3H3	Q8IVL6	736 aa		36.29	■■■■□ 3.4
PPP4C-205	ENST00000563200	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	36.24	■■■■□ 3.39
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		36.23	■■■■□ 3.39
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		36.2	■■■■□ 3.38
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM6B	O15054	1643 aa		36.18	■■■■□ 3.38
PPP4C-205	ENST00000563200	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	36.11	■■■■□ 3.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP10B	O94823	1461 aa		36.11	■■■■□ 3.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		36.11	■■■■□ 3.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		36.1	■■■■□ 3.37
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		36.09	■■■■□ 3.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID3C	A6NKF2	412 aa		36.02	■■■■□ 3.36
PPP4C-205	ENST00000563200	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	36	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		36	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH8	Q96L42	1107 aa		36	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	35.99	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		35.99	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		35.99	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	35.95	■■■■□ 3.35
PPP4C-205	ENST00000563200	CD109	Q6YHK3	1445 aa		35.94	■■■■□ 3.34
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		35.94	■■■■□ 3.34
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		35.86	■■■■□ 3.33
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		35.83	■■■■□ 3.33
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	35.8	■■■■□ 3.32
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	35.8	■■■■□ 3.32
PPP4C-205	ENST00000563200	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	35.8	■■■■□ 3.32
PPP4C-205	ENST00000563200	FMN1	Q68DA7	1419 aa		35.74	■■■■□ 3.31
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		35.68	■■■■□ 3.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	35.67	■■■■□ 3.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		35.65	■■■■□ 3.3
PPP4C-205	ENST00000563200	HECW1	Q76N89	1606 aa		35.63	■■■■□ 3.29
PPP4C-205	ENST00000563200	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		35.62	■■■■□ 3.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		35.6	■■■■□ 3.29
PPP4C-205	ENST00000563200	NEO1	Q92859	1461 aa		35.57	■■■■□ 3.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	35.56	■■■■□ 3.28	5e-11	■■□□□ 12.7
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	35.51	■■■■□ 3.28
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		35.51	■■■■□ 3.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		35.51	■■■■□ 3.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		35.44	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CLIP1	P30622	1438 aa		35.43	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRL1	O94910	1474 aa		35.43	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	35.43	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	35.4	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FANCA	O15360	1455 aa		35.4	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPGEF3	O95398	923 aa		35.4	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		35.39	■■■■□ 3.26
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		35.38	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AKNA	Q7Z591	1439 aa		35.37	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	35.36	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF14	Q15058	1648 aa		35.35	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCH2	O75038	1416 aa		35.34	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		35.33	■■■■□ 3.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		35.31	■■■■□ 3.24
PPP4C-205	ENST00000563200	RICTOR	Q6R327	1708 aa		35.3	■■■■□ 3.24
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	35.29	■■■■□ 3.24
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		35.28	■■■■□ 3.24
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		35.17	■■■■□ 3.22
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		35.16	■■■■□ 3.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP162	Q5TB80	1403 aa		35.16	■■■■□ 3.22
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		35.14	■■■■□ 3.22
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		35.14	■■■■□ 3.22

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