RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-205ENST00000563200 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.93■■■■■ 6.22
PPP4C-205ENST00000563200 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.14■■■■■ 5.3
PPP4C-205ENST00000563200 ABCC9O60706 1549 aa47.54■■■■■ 5.2
PPP4C-205ENST00000563200 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.52■■■■■ 4.88
PPP4C-205ENST00000563200 NACADO15069 1562 aa45.38■■■■■ 4.85
PPP4C-205ENST00000563200 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.12■■■■■ 4.81
PPP4C-205ENST00000563200 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.99■■■■■ 4.79
PPP4C-205ENST00000563200 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
PPP4C-205ENST00000563200 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.61■■■■■ 4.73
PPP4C-205ENST00000563200 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.55■■■■■ 4.72
PPP4C-205ENST00000563200 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.33■■■■■ 4.69
PPP4C-205ENST00000563200 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.24■■■■■ 4.67
PPP4C-205ENST00000563200 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.16■■■■■ 4.66
PPP4C-205ENST00000563200 SCRIBQ14160 1630 aa43.85■■■■■ 4.61
PPP4C-205ENST00000563200 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
PPP4C-205ENST00000563200 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
PPP4C-205ENST00000563200 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.01■■■■■ 4.48
PPP4C-205ENST00000563200 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.79■■■■■ 4.44
PPP4C-205ENST00000563200 SMARCA4P51532 1647 aa41.93■■■■■ 4.3
PPP4C-205ENST00000563200 NCAPD3P42695 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
PPP4C-205ENST00000563200 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.84■■■■■ 4.29
PPP4C-205ENST00000563200 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
PPP4C-205ENST00000563200 SMARCA2P51531 1590 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP4C-205ENST00000563200 HMGXB3Q12766 1538 aa41.64■■■■■ 4.26
PPP4C-205ENST00000563200 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.58■■■■■ 4.25
PPP4C-205ENST00000563200 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP4C-205ENST00000563200 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
PPP4C-205ENST00000563200 WIZO95785 1651 aa41.07■■■■■ 4.16
PPP4C-205ENST00000563200 NESP48681 1621 aa41.03■■■■■ 4.16
PPP4C-205ENST00000563200 ERCC6Q03468 1493 aa40.97■■■■■ 4.15
PPP4C-205ENST00000563200 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-205ENST00000563200 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.84■■■■■ 4.13
PPP4C-205ENST00000563200 CUX2O14529 1486 aa40.77■■■■■ 4.12
PPP4C-205ENST00000563200 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.63■■■■■ 4.09
PPP4C-205ENST00000563200 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PPP4C-205ENST00000563200 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.56■■■■■ 4.08
PPP4C-205ENST00000563200 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-205ENST00000563200 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-205ENST00000563200 CFTRP13569 1480 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-205ENST00000563200 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
PPP4C-205ENST00000563200 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.15■■■■■ 4.02
PPP4C-205ENST00000563200 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.13■■■■■ 4.02
PPP4C-205ENST00000563200 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.12■■■■■ 4.01
PPP4C-205ENST00000563200 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.11■■■■■ 4.01
PPP4C-205ENST00000563200 WDR62O43379 1518 aa40.1■■■■■ 4.01
PPP4C-205ENST00000563200 PRDM2Q13029 1718 aa39.95■■■■□ 3.99
PPP4C-205ENST00000563200 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PPP4C-205ENST00000563200 TOPBP1Q92547 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
PPP4C-205ENST00000563200 ABCC8Q09428 1581 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP4C-205ENST00000563200 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
PPP4C-205ENST00000563200 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-205ENST00000563200 IFT140Q96RY7 1462 aa39.32■■■■□ 3.89
PPP4C-205ENST00000563200 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
PPP4C-205ENST00000563200 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
PPP4C-205ENST00000563200 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
PPP4C-205ENST00000563200 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
PPP4C-205ENST00000563200 CUX1P39880 1505 aa39■■■■□ 3.83
PPP4C-205ENST00000563200 OSCARQ8IYS5 282 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4C-205ENST00000563200 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.93■■■■□ 3.82
PPP4C-205ENST00000563200 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.93■■■■□ 3.82
PPP4C-205ENST00000563200 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.92■■■■□ 3.826e-7■■■■□ 24.5
PPP4C-205ENST00000563200 SOGA1O94964 1423 aa38.91■■■■□ 3.82
PPP4C-205ENST00000563200 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
PPP4C-205ENST00000563200 WDR97A6NE52 1622 aa38.74■■■■□ 3.79
PPP4C-205ENST00000563200 CHD1O14646 1710 aa38.62■■■■□ 3.77
PPP4C-205ENST00000563200 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.55■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.54■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.54■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 TOP2BQ02880 1626 aa38.53■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.52■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 GRIN2BQ13224 1484 aa38.51■■■■□ 3.76
PPP4C-205ENST00000563200 SYNJ1O43426 1573 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 TRIM41Q8WV44 630 aa38.48■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 FBLN2P98095 1184 aa38.46■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.45■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.45■■■■□ 3.75
PPP4C-205ENST00000563200 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-205ENST00000563200 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-205ENST00000563200 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4C-205ENST00000563200 PBRM1Q86U86 1689 aa38.41■■■■□ 3.74
PPP4C-205ENST00000563200 ARHGEF11O15085 1522 aa38.38■■■■□ 3.73
PPP4C-205ENST00000563200 SYNJ2O15056 1496 aa38.34■■■■□ 3.73
PPP4C-205ENST00000563200 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
PPP4C-205ENST00000563200 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP4C-205ENST00000563200 ADAMTS12P58397 1594 aa38.09■■■■□ 3.69
PPP4C-205ENST00000563200 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.06■■■■□ 3.68
PPP4C-205ENST00000563200 GRIN2AQ12879 1464 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-205ENST00000563200 ARAP1Q96P48 1450 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-205ENST00000563200 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.01■■■■□ 3.68
PPP4C-205ENST00000563200 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.99■■■■□ 3.67
PPP4C-205ENST00000563200 NUP160Q12769 1436 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-205ENST00000563200 CEP170Q5SW79 1584 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP4C-205ENST00000563200 KIF27Q86VH2 1401 aa37.75■■■■□ 3.63
PPP4C-205ENST00000563200 IGF1RP08069 1367 aa37.72■■■■□ 3.63
PPP4C-205ENST00000563200 SHROOM2Q13796 1616 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP4C-205ENST00000563200 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.66■■■■□ 3.62
PPP4C-205ENST00000563200 CUL7Q14999 1698 aa37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-205ENST00000563200 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.55■■■■□ 3.6
PPP4C-205ENST00000563200 JPH4Q96JJ6 628 aa37.48■■■■□ 3.59
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