RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		53.93	■■■■■ 6.22
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		48.14	■■■■■ 5.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC9	O60706	1549 aa		47.54	■■■■■ 5.2
PPP4C-205	ENST00000563200	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		45.52	■■■■■ 4.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NACAD	O15069	1562 aa		45.38	■■■■■ 4.85
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		45.12	■■■■■ 4.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		44.99	■■■■■ 4.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	44.82	■■■■■ 4.77
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		44.61	■■■■■ 4.73
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		44.55	■■■■■ 4.72
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	44.33	■■■■■ 4.69
PPP4C-205	ENST00000563200	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		44.24	■■■■■ 4.67
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PPP4C-205	ENST00000563200	SCRIB	Q14160	1630 aa		43.85	■■■■■ 4.61
PPP4C-205	ENST00000563200	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		43.69	■■■■■ 4.58
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PPP4C-205	ENST00000563200	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCA4	P51532	1647 aa		41.93	■■■■■ 4.3
PPP4C-205	ENST00000563200	NCAPD3	P42695	1498 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		41.84	■■■■■ 4.29
PPP4C-205	ENST00000563200	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	41.8	■■■■■ 4.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SMARCA2	P51531	1590 aa		41.73	■■■■■ 4.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HMGXB3	Q12766	1538 aa		41.64	■■■■■ 4.26
PPP4C-205	ENST00000563200	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		41.55	■■■■■ 4.24
PPP4C-205	ENST00000563200	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	41.42	■■■■■ 4.22
PPP4C-205	ENST00000563200	WIZ	O95785	1651 aa		41.07	■■■■■ 4.16
PPP4C-205	ENST00000563200	NES	P48681	1621 aa		41.03	■■■■■ 4.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC6	Q03468	1493 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CUX2	O14529	1486 aa		40.77	■■■■■ 4.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		40.56	■■■■■ 4.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PPP4C-205	ENST00000563200	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CFTR	P13569	1480 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPP4C-205	ENST00000563200	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPP4C-205	ENST00000563200	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		40.13	■■■■■ 4.02
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		40.12	■■■■■ 4.01
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR62	O43379	1518 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM2	Q13029	1718 aa		39.95	■■■■□ 3.99
PPP4C-205	ENST00000563200	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96
PPP4C-205	ENST00000563200	TOPBP1	Q92547	1522 aa		39.47	■■■■□ 3.91
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC8	Q09428	1581 aa		39.41	■■■■□ 3.9
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	39.4	■■■■□ 3.9
PPP4C-205	ENST00000563200	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		39.37	■■■■□ 3.89
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT140	Q96RY7	1462 aa		39.32	■■■■□ 3.89
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	39.22	■■■■□ 3.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	39.11	■■■■□ 3.85
PPP4C-205	ENST00000563200	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	39.1	■■■■□ 3.85
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	39.03	■■■■□ 3.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CUX1	P39880	1505 aa		39	■■■■□ 3.83
PPP4C-205	ENST00000563200	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		38.97	■■■■□ 3.83
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		38.93	■■■■□ 3.82
PPP4C-205	ENST00000563200	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		38.93	■■■■□ 3.82
PPP4C-205	ENST00000563200	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	38.92	■■■■□ 3.82	6e-7	■■■■□ 24.5
PPP4C-205	ENST00000563200	SOGA1	O94964	1423 aa		38.91	■■■■□ 3.82
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	38.75	■■■■□ 3.79
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR97	A6NE52	1622 aa		38.74	■■■■□ 3.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD1	O14646	1710 aa		38.62	■■■■□ 3.77
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		38.55	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		38.54	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	38.54	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	TOP2B	Q02880	1626 aa		38.53	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		38.52	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIN2B	Q13224	1484 aa		38.51	■■■■□ 3.76
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNJ1	O43426	1573 aa		38.5	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM41	Q8WV44	630 aa		38.48	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	38.47	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	FBLN2	P98095	1184 aa		38.46	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		38.45	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		38.45	■■■■□ 3.75
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		38.44	■■■■□ 3.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		38.44	■■■■□ 3.74
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		38.44	■■■■□ 3.74
PPP4C-205	ENST00000563200	PBRM1	Q86U86	1689 aa		38.41	■■■■□ 3.74
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF11	O15085	1522 aa		38.38	■■■■□ 3.73
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNJ2	O15056	1496 aa		38.34	■■■■□ 3.73
PPP4C-205	ENST00000563200	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	38.3	■■■■□ 3.72
PPP4C-205	ENST00000563200	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		38.23	■■■■□ 3.71
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS12	P58397	1594 aa		38.09	■■■■□ 3.69
PPP4C-205	ENST00000563200	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		38.06	■■■■□ 3.68
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIN2A	Q12879	1464 aa		38.04	■■■■□ 3.68
PPP4C-205	ENST00000563200	ARAP1	Q96P48	1450 aa		38.04	■■■■□ 3.68
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		38.01	■■■■□ 3.68
PPP4C-205	ENST00000563200	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		37.99	■■■■□ 3.67
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP160	Q12769	1436 aa		37.91	■■■■□ 3.66
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP170	Q5SW79	1584 aa		37.88	■■■■□ 3.65
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF27	Q86VH2	1401 aa		37.75	■■■■□ 3.63
PPP4C-205	ENST00000563200	IGF1R	P08069	1367 aa		37.72	■■■■□ 3.63
PPP4C-205	ENST00000563200	SHROOM2	Q13796	1616 aa		37.7	■■■■□ 3.63
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		37.66	■■■■□ 3.62
PPP4C-205	ENST00000563200	CUL7	Q14999	1698 aa		37.6	■■■■□ 3.61
PPP4C-205	ENST00000563200	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		37.55	■■■■□ 3.6
PPP4C-205	ENST00000563200	JPH4	Q96JJ6	628 aa		37.48	■■■■□ 3.59

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