RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562589.5

E4F1-202, Transcript of E4F transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene E4F1, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1-202ENST00000562589 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.46■■■■■ 4.39
E4F1-202ENST00000562589 JPH4Q96JJ6 628 aa42.45■■■■■ 4.39
E4F1-202ENST00000562589 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.4■■■■■ 4.38
E4F1-202ENST00000562589 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
E4F1-202ENST00000562589 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.25■■■■■ 4.35
E4F1-202ENST00000562589 PRXQ9BXM0 1461 aa42.23■■■■■ 4.35
E4F1-202ENST00000562589 EEA1Q15075 1411 aa42.17■■■■■ 4.34
E4F1-202ENST00000562589 IQGAP2Q13576 1575 aa42.17■■■■■ 4.34
E4F1-202ENST00000562589 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.14■■■■■ 4.34
E4F1-202ENST00000562589 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.99■■■■■ 4.31
E4F1-202ENST00000562589 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.96■■■■■ 4.31
E4F1-202ENST00000562589 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.96■■■■■ 4.31
E4F1-202ENST00000562589 DISP1Q96F81 1524 aa41.9■■■■■ 4.3
E4F1-202ENST00000562589 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
E4F1-202ENST00000562589 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.88■■■■■ 4.29
E4F1-202ENST00000562589 PTPRGP23470 1445 aa41.86■■■■■ 4.29
E4F1-202ENST00000562589 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
E4F1-202ENST00000562589 KIAA0556O60303 1618 aa41.77■■■■■ 4.28
E4F1-202ENST00000562589 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.75■■■■■ 4.27
E4F1-202ENST00000562589 KIF21BO75037 1637 aa41.73■■■■■ 4.27
E4F1-202ENST00000562589 GOLGA3Q08378 1498 aa41.71■■■■■ 4.27
E4F1-202ENST00000562589 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
E4F1-202ENST00000562589 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.26
E4F1-202ENST00000562589 UACAQ9BZF9 1416 aa41.57■■■■■ 4.25
E4F1-202ENST00000562589 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.57■■■■■ 4.25
E4F1-202ENST00000562589 MAPKBP1O60336 1514 aa41.54■■■■■ 4.24
E4F1-202ENST00000562589 ABCC2Q92887 1545 aa41.51■■■■■ 4.24
E4F1-202ENST00000562589 SAMD9Q5K651 1589 aa41.46■■■■■ 4.23
E4F1-202ENST00000562589 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.37■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 P3H3Q8IVL6 736 aa41.37■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.36■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.36■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.35■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 ABCA8O94911 1581 aa41.34■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.33■■■■■ 4.21
E4F1-202ENST00000562589 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
E4F1-202ENST00000562589 DIP2BQ9P265 1576 aa41.27■■■■■ 4.2
E4F1-202ENST00000562589 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.26■■■■■ 4.2
E4F1-202ENST00000562589 ASXL2Q76L83 1435 aa41.25■■■■■ 4.19
E4F1-202ENST00000562589 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.24■■■■■ 4.19
E4F1-202ENST00000562589 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
E4F1-202ENST00000562589 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.18■■■■■ 4.18
E4F1-202ENST00000562589 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.07■■■■■ 4.17
E4F1-202ENST00000562589 GLI2P10070 1586 aa41.05■■■■■ 4.16
E4F1-202ENST00000562589 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.02■■■■■ 4.16
E4F1-202ENST00000562589 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
E4F1-202ENST00000562589 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.01■■■■■ 4.16
E4F1-202ENST00000562589 ATP10BO94823 1461 aa41■■■■■ 4.15
E4F1-202ENST00000562589 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
E4F1-202ENST00000562589 ARID3CA6NKF2 412 aa40.93■■■■■ 4.14
E4F1-202ENST00000562589 TSPOAP1O95153 1857 aa40.89■■■■■ 4.14
E4F1-202ENST00000562589 FMN1Q68DA7 1419 aa40.87■■■■■ 4.13
E4F1-202ENST00000562589 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.84■■■■■ 4.13
E4F1-202ENST00000562589 KCNH8Q96L42 1107 aa40.8■■■■■ 4.12
E4F1-202ENST00000562589 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
E4F1-202ENST00000562589 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
E4F1-202ENST00000562589 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
E4F1-202ENST00000562589 CLIP1P30622 1438 aa40.71■■■■■ 4.11
E4F1-202ENST00000562589 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.69■■■■■ 4.1
E4F1-202ENST00000562589 HECW1Q76N89 1606 aa40.67■■■■■ 4.1
E4F1-202ENST00000562589 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.66■■■■■ 4.1
E4F1-202ENST00000562589 CD109Q6YHK3 1445 aa40.66■■■■■ 4.1
E4F1-202ENST00000562589 KDM6BO15054 1643 aa40.64■■■■■ 4.1
E4F1-202ENST00000562589 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.63■■■■■ 4.09
E4F1-202ENST00000562589 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
E4F1-202ENST00000562589 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.61■■■■■ 4.09
E4F1-202ENST00000562589 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
E4F1-202ENST00000562589 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.58■■■■■ 4.09
E4F1-202ENST00000562589 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.54■■■■■ 4.08
E4F1-202ENST00000562589 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.49■■■■■ 4.07
E4F1-202ENST00000562589 CEP162Q5TB80 1403 aa40.49■■■■■ 4.07
E4F1-202ENST00000562589 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
E4F1-202ENST00000562589 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
E4F1-202ENST00000562589 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.44■■■■■ 4.06
E4F1-202ENST00000562589 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
E4F1-202ENST00000562589 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.42■■■■■ 4.06
E4F1-202ENST00000562589 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.39■■■■■ 4.06
E4F1-202ENST00000562589 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.056e-8■■□□□ 12.9
E4F1-202ENST00000562589 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.31■■■■■ 4.04
E4F1-202ENST00000562589 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
E4F1-202ENST00000562589 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.3■■■■■ 4.04
E4F1-202ENST00000562589 NEO1Q92859 1461 aa40.28■■■■■ 4.04
E4F1-202ENST00000562589 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.27■■■■■ 4.04
E4F1-202ENST00000562589 KIF14Q15058 1648 aa40.21■■■■■ 4.03
E4F1-202ENST00000562589 PLCH2O75038 1416 aa40.16■■■■■ 4.02
E4F1-202ENST00000562589 FANCAO15360 1455 aa40.15■■■■■ 4.02
E4F1-202ENST00000562589 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
E4F1-202ENST00000562589 AKNAQ7Z591 1439 aa40.09■■■■■ 4.01
E4F1-202ENST00000562589 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.08■■■■■ 4.01
E4F1-202ENST00000562589 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.02■■■■■ 4
E4F1-202ENST00000562589 RAPGEF3O95398 923 aa40.02■■■■■ 4
E4F1-202ENST00000562589 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40■■■■□ 3.99
E4F1-202ENST00000562589 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
E4F1-202ENST00000562589 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.97■■■■□ 3.99
E4F1-202ENST00000562589 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.94■■■■□ 3.98
E4F1-202ENST00000562589 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.93■■■■□ 3.98
E4F1-202ENST00000562589 ADGRL1O94910 1474 aa39.93■■■■□ 3.98
E4F1-202ENST00000562589 RICTORQ6R327 1708 aa39.91■■■■□ 3.98
E4F1-202ENST00000562589 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.9■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms