RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562311.5

KIFC3-209, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-209	ENST00000562311	JPH4	Q96JJ6	628 aa		44.26	■■■■■ 4.68
KIFC3-209	ENST00000562311	CUL7	Q14999	1698 aa		44.2	■■■■■ 4.67
KIFC3-209	ENST00000562311	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.08	■■■■■ 4.65
KIFC3-209	ENST00000562311	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.01	■■■■■ 4.64
KIFC3-209	ENST00000562311	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.91	■■■■■ 4.62
KIFC3-209	ENST00000562311	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.87	■■■■■ 4.61
KIFC3-209	ENST00000562311	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.72	■■■■■ 4.59
KIFC3-209	ENST00000562311	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.68	■■■■■ 4.58
KIFC3-209	ENST00000562311	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.64	■■■■■ 4.58
KIFC3-209	ENST00000562311	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.63	■■■■■ 4.57
KIFC3-209	ENST00000562311	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.62	■■■■■ 4.57
KIFC3-209	ENST00000562311	PTPRG	P23470	1445 aa		43.61	■■■■■ 4.57
KIFC3-209	ENST00000562311	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.61	■■■■■ 4.57
KIFC3-209	ENST00000562311	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.59	■■■■■ 4.57
KIFC3-209	ENST00000562311	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.54	■■■■■ 4.56
KIFC3-209	ENST00000562311	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.54	■■■■■ 4.56
KIFC3-209	ENST00000562311	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.53	■■■■■ 4.56
KIFC3-209	ENST00000562311	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.52	■■■■■ 4.56
KIFC3-209	ENST00000562311	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.47	■■■■■ 4.55
KIFC3-209	ENST00000562311	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.4	■■■■■ 4.54
KIFC3-209	ENST00000562311	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.39	■■■■■ 4.54
KIFC3-209	ENST00000562311	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.33	■■■■■ 4.53
KIFC3-209	ENST00000562311	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.32	■■■■■ 4.53
KIFC3-209	ENST00000562311	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.32	■■■■■ 4.52
KIFC3-209	ENST00000562311	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.31	■■■■■ 4.52
KIFC3-209	ENST00000562311	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.28	■■■■■ 4.52
KIFC3-209	ENST00000562311	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.26	■■■■■ 4.52
KIFC3-209	ENST00000562311	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.17	■■■■■ 4.5
KIFC3-209	ENST00000562311	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
KIFC3-209	ENST00000562311	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.12	■■■■■ 4.49
KIFC3-209	ENST00000562311	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
KIFC3-209	ENST00000562311	KDM6B	O15054	1643 aa		43.09	■■■■■ 4.49
KIFC3-209	ENST00000562311	GLI2	P10070	1586 aa		43.07	■■■■■ 4.48
KIFC3-209	ENST00000562311	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
KIFC3-209	ENST00000562311	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.01	■■■■■ 4.48
KIFC3-209	ENST00000562311	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.98	■■■■■ 4.47
KIFC3-209	ENST00000562311	ABCA8	O94911	1581 aa		42.98	■■■■■ 4.47
KIFC3-209	ENST00000562311	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.91	■■■■■ 4.46
KIFC3-209	ENST00000562311	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.91	■■■■■ 4.46
KIFC3-209	ENST00000562311	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.85	■■■■■ 4.45
KIFC3-209	ENST00000562311	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
KIFC3-209	ENST00000562311	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.82	■■■■■ 4.45
KIFC3-209	ENST00000562311	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.77	■■■■■ 4.44
KIFC3-209	ENST00000562311	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
KIFC3-209	ENST00000562311	EEA1	Q15075	1411 aa		42.7	■■■■■ 4.43
KIFC3-209	ENST00000562311	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.69	■■■■■ 4.42
KIFC3-209	ENST00000562311	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.65	■■■■■ 4.42
KIFC3-209	ENST00000562311	ATP10B	O94823	1461 aa		42.6	■■■■■ 4.41
KIFC3-209	ENST00000562311	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.6	■■■■■ 4.41
KIFC3-209	ENST00000562311	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.59	■■■■■ 4.41
KIFC3-209	ENST00000562311	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.54	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.52	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	KIF21B	O75037	1637 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.51	■■■■■ 4.4
KIFC3-209	ENST00000562311	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.49	■■■■■ 4.39
KIFC3-209	ENST00000562311	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
KIFC3-209	ENST00000562311	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.42	■■■■■ 4.38
KIFC3-209	ENST00000562311	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.35	■■■■■ 4.37
KIFC3-209	ENST00000562311	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.35	■■■■■ 4.37
KIFC3-209	ENST00000562311	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.31	■■■■■ 4.36
KIFC3-209	ENST00000562311	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.25	■■■■■ 4.35
KIFC3-209	ENST00000562311	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
KIFC3-209	ENST00000562311	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
KIFC3-209	ENST00000562311	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.15	■■■■■ 4.34
KIFC3-209	ENST00000562311	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
KIFC3-209	ENST00000562311	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.06	■■■■■ 4.32
KIFC3-209	ENST00000562311	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
KIFC3-209	ENST00000562311	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.02	■■■■■ 4.32
KIFC3-209	ENST00000562311	NEO1	Q92859	1461 aa		41.98	■■■■■ 4.31
KIFC3-209	ENST00000562311	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.98	■■■■■ 4.31
KIFC3-209	ENST00000562311	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.98	■■■■■ 4.31
KIFC3-209	ENST00000562311	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.98	■■■■■ 4.31
KIFC3-209	ENST00000562311	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.93	■■■■■ 4.3
KIFC3-209	ENST00000562311	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.9	■■■■■ 4.3
KIFC3-209	ENST00000562311	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.84	■■■■■ 4.29
KIFC3-209	ENST00000562311	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.82	■■■■■ 4.29
KIFC3-209	ENST00000562311	FANCA	O15360	1455 aa		41.8	■■■■■ 4.28
KIFC3-209	ENST00000562311	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.8	■■■■■ 4.28
KIFC3-209	ENST00000562311	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.78	■■■■■ 4.28
KIFC3-209	ENST00000562311	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.77	■■■■■ 4.28
KIFC3-209	ENST00000562311	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
KIFC3-209	ENST00000562311	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.72	■■■■■ 4.27
KIFC3-209	ENST00000562311	KIF14	Q15058	1648 aa		41.71	■■■■■ 4.27
KIFC3-209	ENST00000562311	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.71	■■■■■ 4.27
KIFC3-209	ENST00000562311	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.69	■■■■■ 4.26
KIFC3-209	ENST00000562311	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.68	■■■■■ 4.26
KIFC3-209	ENST00000562311	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.67	■■■■■ 4.26
KIFC3-209	ENST00000562311	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.26
KIFC3-209	ENST00000562311	PLCH2	O75038	1416 aa		41.61	■■■■■ 4.25
KIFC3-209	ENST00000562311	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.61	■■■■■ 4.25
KIFC3-209	ENST00000562311	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.59	■■■■■ 4.25
KIFC3-209	ENST00000562311	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.58	■■■■■ 4.25
KIFC3-209	ENST00000562311	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.57	■■■■■ 4.25
KIFC3-209	ENST00000562311	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
KIFC3-209	ENST00000562311	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.55	■■■■■ 4.24
KIFC3-209	ENST00000562311	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.53	■■■■■ 4.24
KIFC3-209	ENST00000562311	PTPRM	P28827	1452 aa		41.52	■■■■■ 4.24
KIFC3-209	ENST00000562311	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.51	■■■■■ 4.24

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