RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562311.5

KIFC3-209, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-209ENST00000562311 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.5■■■■■ 7.76
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KIFC3-209ENST00000562311 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.9■■■■■ 6.22
KIFC3-209ENST00000562311 NACADO15069 1562 aa53.59■■■■■ 6.17
KIFC3-209ENST00000562311 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.38■■■■■ 6.14
KIFC3-209ENST00000562311 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.04■■■■■ 6.08
KIFC3-209ENST00000562311 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.91■■■■■ 6.06
KIFC3-209ENST00000562311 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.89■■■■■ 6.06
KIFC3-209ENST00000562311 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.81■■■■■ 6.04
KIFC3-209ENST00000562311 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.72■■■■■ 6.03
KIFC3-209ENST00000562311 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.55■■■■■ 6
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KIFC3-209ENST00000562311 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.56■■■■■ 5.84
KIFC3-209ENST00000562311 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.19■■■■■ 5.78
KIFC3-209ENST00000562311 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
KIFC3-209ENST00000562311 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.96■■■■■ 5.75
KIFC3-209ENST00000562311 NCAPD3P42695 1498 aa49.51■■■■■ 5.52
KIFC3-209ENST00000562311 SMARCA4P51532 1647 aa49.5■■■■■ 5.51
KIFC3-209ENST00000562311 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.47■■■■■ 5.51
KIFC3-209ENST00000562311 SMARCA2P51531 1590 aa49.23■■■■■ 5.47
KIFC3-209ENST00000562311 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.19■■■■■ 5.47
KIFC3-209ENST00000562311 HMGXB3Q12766 1538 aa49.19■■■■■ 5.46
KIFC3-209ENST00000562311 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.03■■■■■ 5.44
KIFC3-209ENST00000562311 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.98■■■■■ 5.43
KIFC3-209ENST00000562311 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.95■■■■■ 5.43
KIFC3-209ENST00000562311 NESP48681 1621 aa48.84■■■■■ 5.41
KIFC3-209ENST00000562311 ERCC6Q03468 1493 aa48.77■■■■■ 5.4
KIFC3-209ENST00000562311 CUX2O14529 1486 aa48.57■■■■■ 5.37
KIFC3-209ENST00000562311 WIZO95785 1651 aa48.45■■■■■ 5.35
KIFC3-209ENST00000562311 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.32■■■■■ 5.33
KIFC3-209ENST00000562311 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.28■■■■■ 5.32
KIFC3-209ENST00000562311 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.31
KIFC3-209ENST00000562311 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.17■■■■■ 5.3
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KIFC3-209ENST00000562311 CADPSQ9ULU8 1353 aa48■■■■■ 5.28
KIFC3-209ENST00000562311 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.97■■■■■ 5.27
KIFC3-209ENST00000562311 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
KIFC3-209ENST00000562311 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.66■■■■■ 5.22
KIFC3-209ENST00000562311 WDR62O43379 1518 aa47.58■■■■■ 5.21
KIFC3-209ENST00000562311 CFTRP13569 1480 aa47.56■■■■■ 5.2
KIFC3-209ENST00000562311 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.52■■■■■ 5.2
KIFC3-209ENST00000562311 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.5■■■■■ 5.19
KIFC3-209ENST00000562311 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.26■■■■■ 5.16
KIFC3-209ENST00000562311 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
KIFC3-209ENST00000562311 PRDM2Q13029 1718 aa47.09■■■■■ 5.13
KIFC3-209ENST00000562311 TOPBP1Q92547 1522 aa46.69■■■■■ 5.06
KIFC3-209ENST00000562311 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
KIFC3-209ENST00000562311 IFT140Q96RY7 1462 aa46.51■■■■■ 5.04
KIFC3-209ENST00000562311 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.5■■■■■ 5.03
KIFC3-209ENST00000562311 ABCC8Q09428 1581 aa46.36■■■■■ 5.01
KIFC3-209ENST00000562311 OSCARQ8IYS5 282 aa46.33■■■■■ 5.01
KIFC3-209ENST00000562311 TRIM41Q8WV44 630 aa46.32■■■■■ 5.01
KIFC3-209ENST00000562311 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
KIFC3-209ENST00000562311 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.28■■■■■ 5
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KIFC3-209ENST00000562311 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.99■■■■■ 4.95
KIFC3-209ENST00000562311 SOGA1O94964 1423 aa45.94■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 CHD1O14646 1710 aa45.92■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.92■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
KIFC3-209ENST00000562311 ARHGEF11O15085 1522 aa45.77■■■■■ 4.92
KIFC3-209ENST00000562311 WDR97A6NE52 1622 aa45.69■■■■■ 4.9
KIFC3-209ENST00000562311 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
KIFC3-209ENST00000562311 FBLN2P98095 1184 aa45.66■■■■■ 4.9
KIFC3-209ENST00000562311 GRIN2BQ13224 1484 aa45.5■■■■■ 4.87
KIFC3-209ENST00000562311 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
KIFC3-209ENST00000562311 PBRM1Q86U86 1689 aa45.43■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.42■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 ARAP1Q96P48 1450 aa45.41■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.41■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.4■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.4■■■■■ 4.86
KIFC3-209ENST00000562311 SYNJ1O43426 1573 aa45.36■■■■■ 4.85
KIFC3-209ENST00000562311 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.34■■■■■ 4.85
KIFC3-209ENST00000562311 SYNJ2O15056 1496 aa45.34■■■■■ 4.85
KIFC3-209ENST00000562311 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
KIFC3-209ENST00000562311 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.3■■■■■ 4.84
KIFC3-209ENST00000562311 TOP2BQ02880 1626 aa45.28■■■■■ 4.84
KIFC3-209ENST00000562311 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.26■■■■■ 4.84
KIFC3-209ENST00000562311 ADAMTS12P58397 1594 aa45.04■■■■■ 4.8
KIFC3-209ENST00000562311 GRIN2AQ12879 1464 aa44.98■■■■■ 4.79
KIFC3-209ENST00000562311 CEP170Q5SW79 1584 aa44.9■■■■■ 4.78
KIFC3-209ENST00000562311 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.85■■■■■ 4.77
KIFC3-209ENST00000562311 NUP160Q12769 1436 aa44.83■■■■■ 4.77
KIFC3-209ENST00000562311 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
KIFC3-209ENST00000562311 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.8■■■■■ 4.76
KIFC3-209ENST00000562311 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
KIFC3-209ENST00000562311 SHROOM2Q13796 1616 aa44.62■■■■■ 4.73
KIFC3-209ENST00000562311 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.42■■■■■ 4.7
KIFC3-209ENST00000562311 IGF1RP08069 1367 aa44.35■■■■■ 4.69
KIFC3-209ENST00000562311 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
KIFC3-209ENST00000562311 KIF27Q86VH2 1401 aa44.31■■■■■ 4.68
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