RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562041.1

CDIPT-203, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

TSL 3

Gene CDIPT, Length 1,129 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-203ENST00000562041 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
CDIPT-203ENST00000562041 JPH4Q96JJ6 628 aa41.37■■■■■ 4.21
CDIPT-203ENST00000562041 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.23■■■■■ 4.19
CDIPT-203ENST00000562041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.16■■■■■ 4.18
CDIPT-203ENST00000562041 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.96■■■■■ 4.15
CDIPT-203ENST00000562041 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.95■■■■■ 4.15
CDIPT-203ENST00000562041 IQGAP2Q13576 1575 aa40.91■■■■■ 4.14
CDIPT-203ENST00000562041 MAPKBP1O60336 1514 aa40.85■■■■■ 4.13
CDIPT-203ENST00000562041 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
CDIPT-203ENST00000562041 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.84■■■■■ 4.13
CDIPT-203ENST00000562041 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.82■■■■■ 4.12
CDIPT-203ENST00000562041 PTPRGP23470 1445 aa40.77■■■■■ 4.12
CDIPT-203ENST00000562041 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.74■■■■■ 4.11
CDIPT-203ENST00000562041 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.74■■■■■ 4.11
CDIPT-203ENST00000562041 DIP2BQ9P265 1576 aa40.69■■■■■ 4.11
CDIPT-203ENST00000562041 DISP1Q96F81 1524 aa40.67■■■■■ 4.1
CDIPT-203ENST00000562041 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
CDIPT-203ENST00000562041 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
CDIPT-203ENST00000562041 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.64■■■■■ 4.1
CDIPT-203ENST00000562041 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.61■■■■■ 4.09
CDIPT-203ENST00000562041 ABCC2Q92887 1545 aa40.57■■■■■ 4.08
CDIPT-203ENST00000562041 KIAA0556O60303 1618 aa40.54■■■■■ 4.08
CDIPT-203ENST00000562041 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.52■■■■■ 4.08
CDIPT-203ENST00000562041 UACAQ9BZF9 1416 aa40.5■■■■■ 4.07
CDIPT-203ENST00000562041 PRXQ9BXM0 1461 aa40.48■■■■■ 4.07
CDIPT-203ENST00000562041 TSPOAP1O95153 1857 aa40.43■■■■■ 4.06
CDIPT-203ENST00000562041 ASXL2Q76L83 1435 aa40.38■■■■■ 4.05
CDIPT-203ENST00000562041 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.37■■■■■ 4.05
CDIPT-203ENST00000562041 GOLGA3Q08378 1498 aa40.34■■■■■ 4.05
CDIPT-203ENST00000562041 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.34■■■■■ 4.05
CDIPT-203ENST00000562041 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CDIPT-203ENST00000562041 GLI2P10070 1586 aa40.28■■■■■ 4.04
CDIPT-203ENST00000562041 KDM6BO15054 1643 aa40.27■■■■■ 4.04
CDIPT-203ENST00000562041 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CDIPT-203ENST00000562041 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.18■■■■■ 4.02
CDIPT-203ENST00000562041 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
CDIPT-203ENST00000562041 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
CDIPT-203ENST00000562041 ABCA8O94911 1581 aa40.14■■■■■ 4.02
CDIPT-203ENST00000562041 EEA1Q15075 1411 aa40.13■■■■■ 4.01
CDIPT-203ENST00000562041 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.09■■■■■ 4.01
CDIPT-203ENST00000562041 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.05■■■■■ 4
CDIPT-203ENST00000562041 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.01■■■■■ 4
CDIPT-203ENST00000562041 SAMD9Q5K651 1589 aa39.98■■■■□ 3.99
CDIPT-203ENST00000562041 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.94■■■■□ 3.98
CDIPT-203ENST00000562041 P3H3Q8IVL6 736 aa39.92■■■■□ 3.98
CDIPT-203ENST00000562041 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
CDIPT-203ENST00000562041 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.86■■■■□ 3.97
CDIPT-203ENST00000562041 KIF21BO75037 1637 aa39.83■■■■□ 3.97
CDIPT-203ENST00000562041 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CDIPT-203ENST00000562041 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.78■■■■□ 3.96
CDIPT-203ENST00000562041 KCNH8Q96L42 1107 aa39.77■■■■□ 3.96
CDIPT-203ENST00000562041 ATP10BO94823 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
CDIPT-203ENST00000562041 CD109Q6YHK3 1445 aa39.75■■■■□ 3.95
CDIPT-203ENST00000562041 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.74■■■■□ 3.95
CDIPT-203ENST00000562041 ARID3CA6NKF2 412 aa39.72■■■■□ 3.95
CDIPT-203ENST00000562041 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
CDIPT-203ENST00000562041 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.66■■■■□ 3.94
CDIPT-203ENST00000562041 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.66■■■■□ 3.94
CDIPT-203ENST00000562041 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.64■■■■□ 3.94
CDIPT-203ENST00000562041 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
CDIPT-203ENST00000562041 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.58■■■■□ 3.93
CDIPT-203ENST00000562041 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
CDIPT-203ENST00000562041 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
CDIPT-203ENST00000562041 ADGRL1O94910 1474 aa39.48■■■■□ 3.91
CDIPT-203ENST00000562041 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.43■■■■□ 3.9
CDIPT-203ENST00000562041 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
CDIPT-203ENST00000562041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.4■■■■□ 3.9
CDIPT-203ENST00000562041 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.35■■■■□ 3.89
CDIPT-203ENST00000562041 NEO1Q92859 1461 aa39.31■■■■□ 3.88
CDIPT-203ENST00000562041 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.31■■■■□ 3.88
CDIPT-203ENST00000562041 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.27■■■■□ 3.88
CDIPT-203ENST00000562041 FMN1Q68DA7 1419 aa39.24■■■■□ 3.87
CDIPT-203ENST00000562041 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
CDIPT-203ENST00000562041 HECW1Q76N89 1606 aa39.21■■■■□ 3.87
CDIPT-203ENST00000562041 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.2■■■■□ 3.875e-6■■■■□ 19.7
CDIPT-203ENST00000562041 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.16■■■■□ 3.86
CDIPT-203ENST00000562041 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.15■■■■□ 3.86
CDIPT-203ENST00000562041 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.14■■■■□ 3.86
CDIPT-203ENST00000562041 RAPGEF3O95398 923 aa39.12■■■■□ 3.85
CDIPT-203ENST00000562041 FANCAO15360 1455 aa39.09■■■■□ 3.85
CDIPT-203ENST00000562041 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
CDIPT-203ENST00000562041 RICTORQ6R327 1708 aa39.05■■■■□ 3.84
CDIPT-203ENST00000562041 AKNAQ7Z591 1439 aa39.05■■■■□ 3.84
CDIPT-203ENST00000562041 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
CDIPT-203ENST00000562041 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.99■■■■□ 3.83
CDIPT-203ENST00000562041 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
CDIPT-203ENST00000562041 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.94■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.94■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 PLCH2O75038 1416 aa38.93■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 KIF14Q15058 1648 aa38.92■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.9■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.89■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
CDIPT-203ENST00000562041 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
CDIPT-203ENST00000562041 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.87■■■■□ 3.81
CDIPT-203ENST00000562041 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.86■■■■□ 3.81
CDIPT-203ENST00000562041 CLIP1P30622 1438 aa38.84■■■■□ 3.81
CDIPT-203ENST00000562041 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.84■■■■□ 3.81
CDIPT-203ENST00000562041 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.8■■■■□ 3.8
CDIPT-203ENST00000562041 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.79■■■■□ 3.8
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