RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 JPH4Q96JJ6 628 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-207ENST00000558936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.58■■□□□ 1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PRXQ9BXM0 1461 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
RABGGTA-207ENST00000558936 IQGAP2Q13576 1575 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-207ENST00000558936 DISP1Q96F81 1524 aa21.42■■□□□ 1.02
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RABGGTA-207ENST00000558936 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.13■□□□□ 0.97
RABGGTA-207ENST00000558936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.12■□□□□ 0.97
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RABGGTA-207ENST00000558936 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.03■□□□□ 0.96
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RABGGTA-207ENST00000558936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.01■□□□□ 0.95
RABGGTA-207ENST00000558936 ASXL2Q76L83 1435 aa20.98■□□□□ 0.95
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.97■□□□□ 0.95
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RABGGTA-207ENST00000558936 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RABGGTA-207ENST00000558936 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.91■□□□□ 0.94
RABGGTA-207ENST00000558936 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.91■□□□□ 0.94
RABGGTA-207ENST00000558936 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
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RABGGTA-207ENST00000558936 GLI2P10070 1586 aa20.88■□□□□ 0.93
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RABGGTA-207ENST00000558936 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.83■□□□□ 0.93
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RABGGTA-207ENST00000558936 CD109Q6YHK3 1445 aa20.63■□□□□ 0.89
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RABGGTA-207ENST00000558936 CEP162Q5TB80 1403 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-207ENST00000558936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.61■□□□□ 0.89
RABGGTA-207ENST00000558936 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
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RABGGTA-207ENST00000558936 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-207ENST00000558936 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.33■□□□□ 0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 PREX2Q70Z35 1606 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-207ENST00000558936 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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