RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.29■■■□□ 2.6
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.76■■■□□ 2.03
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCC9O60706 1549 aa27.28■■□□□ 1.96
RABGGTA-207ENST00000558936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-207ENST00000558936 NACADO15069 1562 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-207ENST00000558936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-207ENST00000558936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26■■□□□ 1.75
RABGGTA-207ENST00000558936 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-207ENST00000558936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.83■■□□□ 1.72
RABGGTA-207ENST00000558936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-207ENST00000558936 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-207ENST00000558936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-207ENST00000558936 SCRIBQ14160 1630 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-207ENST00000558936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RABGGTA-207ENST00000558936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-207ENST00000558936 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.5■■□□□ 1.51
RABGGTA-207ENST00000558936 SMARCA4P51532 1647 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-207ENST00000558936 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-207ENST00000558936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
RABGGTA-207ENST00000558936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-207ENST00000558936 NCAPD3P42695 1498 aa24.14■■□□□ 1.46
RABGGTA-207ENST00000558936 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-207ENST00000558936 SMARCA2P51531 1590 aa24■■□□□ 1.43
RABGGTA-207ENST00000558936 HMGXB3Q12766 1538 aa23.97■■□□□ 1.43
RABGGTA-207ENST00000558936 WIZO95785 1651 aa23.92■■□□□ 1.42
RABGGTA-207ENST00000558936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RABGGTA-207ENST00000558936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
RABGGTA-207ENST00000558936 NESP48681 1621 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-207ENST00000558936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-207ENST00000558936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
RABGGTA-207ENST00000558936 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.4■■□□□ 1.34
RABGGTA-207ENST00000558936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.37■■□□□ 1.33
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.34■■□□□ 1.33
RABGGTA-207ENST00000558936 ERCC6Q03468 1493 aa23.33■■□□□ 1.33
RABGGTA-207ENST00000558936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RABGGTA-207ENST00000558936 CFTRP13569 1480 aa23.29■■□□□ 1.32
RABGGTA-207ENST00000558936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.2■■□□□ 1.3
RABGGTA-207ENST00000558936 CUX2O14529 1486 aa23.17■■□□□ 1.3
RABGGTA-207ENST00000558936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.12■■□□□ 1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 PRDM2Q13029 1718 aa23.1■■□□□ 1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RABGGTA-207ENST00000558936 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.05■■□□□ 1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR62O43379 1518 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.04■■□□□ 1.28
RABGGTA-207ENST00000558936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RABGGTA-207ENST00000558936 TOPBP1Q92547 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-207ENST00000558936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-207ENST00000558936 CUX1P39880 1505 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-207ENST00000558936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-207ENST00000558936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCC8Q09428 1581 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-207ENST00000558936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-207ENST00000558936 IFT140Q96RY7 1462 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-207ENST00000558936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-207ENST00000558936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-207ENST00000558936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-207ENST00000558936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNJ1O43426 1573 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-207ENST00000558936 SOGA1O94964 1423 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-207ENST00000558936 WDR97A6NE52 1622 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-207ENST00000558936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-207ENST00000558936 TOP2BQ02880 1626 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-207ENST00000558936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RABGGTA-207ENST00000558936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.26■■□□□ 1.15
RABGGTA-207ENST00000558936 CHD1O14646 1710 aa22.23■■□□□ 1.15
RABGGTA-207ENST00000558936 PBRM1Q86U86 1689 aa22.2■■□□□ 1.15
RABGGTA-207ENST00000558936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-207ENST00000558936 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-207ENST00000558936 OSCARQ8IYS5 282 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-207ENST00000558936 GRIN2BQ13224 1484 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-207ENST00000558936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNJ2O15056 1496 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-207ENST00000558936 FBLN2P98095 1184 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-207ENST00000558936 ADAMTS12P58397 1594 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 CLASP1Q7Z460 1538 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-207ENST00000558936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 ARHGEF11O15085 1522 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 GRIN2AQ12879 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 IGF1RP08069 1367 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 CEP170Q5SW79 1584 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.89■■□□□ 1.1
RABGGTA-207ENST00000558936 NUP160Q12769 1436 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-207ENST00000558936 KIF27Q86VH2 1401 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-207ENST00000558936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-207ENST00000558936 ARAP1Q96P48 1450 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-207ENST00000558936 TRIM41Q8WV44 630 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-207ENST00000558936 SHROOM2Q13796 1616 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-207ENST00000558936 CUL7Q14999 1698 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-207ENST00000558936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.68■■□□□ 1.06
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