RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558180.2

IRX3-203, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene IRX3, Length 1,540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-203ENST00000558180 CEP170Q5SW79 1584 aa46.17■■■■■ 4.98
IRX3-203ENST00000558180 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.15■■■■■ 4.98
IRX3-203ENST00000558180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.09■■■■■ 4.97
IRX3-203ENST00000558180 CEP162Q5TB80 1403 aa46.04■■■■■ 4.96
IRX3-203ENST00000558180 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
IRX3-203ENST00000558180 IQGAP2Q13576 1575 aa46■■■■■ 4.95
IRX3-203ENST00000558180 CLIP1P30622 1438 aa45.92■■■■■ 4.94
IRX3-203ENST00000558180 OSCARQ8IYS5 282 aa45.87■■■■■ 4.93
IRX3-203ENST00000558180 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.83■■■■■ 4.93
IRX3-203ENST00000558180 JPH4Q96JJ6 628 aa45.81■■■■■ 4.92
IRX3-203ENST00000558180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.81■■■■■ 4.92
IRX3-203ENST00000558180 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.77■■■■■ 4.92
IRX3-203ENST00000558180 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.7■■■■■ 4.91
IRX3-203ENST00000558180 SAMD9Q5K651 1589 aa45.68■■■■■ 4.9
IRX3-203ENST00000558180 SHROOM2Q13796 1616 aa45.65■■■■■ 4.9
IRX3-203ENST00000558180 P3H3Q8IVL6 736 aa45.65■■■■■ 4.9
IRX3-203ENST00000558180 DISP1Q96F81 1524 aa45.62■■■■■ 4.89
IRX3-203ENST00000558180 ARAP1Q96P48 1450 aa45.6■■■■■ 4.89
IRX3-203ENST00000558180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
IRX3-203ENST00000558180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.54■■■■■ 4.88
IRX3-203ENST00000558180 KIAA0556O60303 1618 aa45.54■■■■■ 4.88
IRX3-203ENST00000558180 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.53■■■■■ 4.88
IRX3-203ENST00000558180 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.39■■■■■ 4.86
IRX3-203ENST00000558180 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.38■■■■■ 4.85
IRX3-203ENST00000558180 FMN1Q68DA7 1419 aa45.3■■■■■ 4.84
IRX3-203ENST00000558180 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
IRX3-203ENST00000558180 PTPRGP23470 1445 aa45.2■■■■■ 4.83
IRX3-203ENST00000558180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.12■■■■■ 4.81
IRX3-203ENST00000558180 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
IRX3-203ENST00000558180 ARHGEF11O15085 1522 aa45.08■■■■■ 4.81
IRX3-203ENST00000558180 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.05■■■■■ 4.8
IRX3-203ENST00000558180 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.03■■■■■ 4.8
IRX3-203ENST00000558180 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
IRX3-203ENST00000558180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.97■■■■■ 4.79
IRX3-203ENST00000558180 ABCA8O94911 1581 aa44.97■■■■■ 4.79
IRX3-203ENST00000558180 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.93■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.93■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.93■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 UACAQ9BZF9 1416 aa44.92■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 HECW1Q76N89 1606 aa44.9■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 APLP2Q06481 763 aa44.88■■■■■ 4.78
IRX3-203ENST00000558180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
IRX3-203ENST00000558180 ABCC2Q92887 1545 aa44.79■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.79■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.78■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 MAP3K1Q13233 1512 aa44.78■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 ARID3CA6NKF2 412 aa44.76■■■■■ 4.76
IRX3-203ENST00000558180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.75■■■■■ 4.75
IRX3-203ENST00000558180 TIAM1Q13009 1591 aa44.74■■■■■ 4.75
IRX3-203ENST00000558180 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
IRX3-203ENST00000558180 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.68■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.68■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 ATP10BO94823 1461 aa44.67■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.66■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
IRX3-203ENST00000558180 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
IRX3-203ENST00000558180 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
IRX3-203ENST00000558180 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.57■■■■■ 4.73
IRX3-203ENST00000558180 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.57■■■■■ 4.73
IRX3-203ENST00000558180 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.56■■■■■ 4.72
IRX3-203ENST00000558180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
IRX3-203ENST00000558180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.48■■■■■ 4.71
IRX3-203ENST00000558180 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
IRX3-203ENST00000558180 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.47■■■■■ 4.71
IRX3-203ENST00000558180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.41■■■■■ 4.7
IRX3-203ENST00000558180 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
IRX3-203ENST00000558180 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.39■■■■■ 4.7
IRX3-203ENST00000558180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
IRX3-203ENST00000558180 ASXL2Q76L83 1435 aa44.2■■■■■ 4.67
IRX3-203ENST00000558180 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
IRX3-203ENST00000558180 NCOA2Q15596 1464 aa44.19■■■■■ 4.66
IRX3-203ENST00000558180 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.16■■■■■ 4.66
IRX3-203ENST00000558180 KIF14Q15058 1648 aa44.13■■■■■ 4.65
IRX3-203ENST00000558180 KCNH8Q96L42 1107 aa44.11■■■■■ 4.65
IRX3-203ENST00000558180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.1■■■■■ 4.65
IRX3-203ENST00000558180 MAPKBP1O60336 1514 aa44.09■■■■■ 4.65
IRX3-203ENST00000558180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.03■■■■■ 4.64
IRX3-203ENST00000558180 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.97■■■■■ 4.63
IRX3-203ENST00000558180 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.96■■■■■ 4.63
IRX3-203ENST00000558180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.96■■■■■ 4.63
IRX3-203ENST00000558180 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
IRX3-203ENST00000558180 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
IRX3-203ENST00000558180 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.89■■■■■ 4.62
IRX3-203ENST00000558180 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
IRX3-203ENST00000558180 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.85■■■■■ 4.61
IRX3-203ENST00000558180 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.81■■■■■ 4.6
IRX3-203ENST00000558180 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.8■■■■■ 4.6
IRX3-203ENST00000558180 MIA2Q96PC5 1412 aa43.8■■■■■ 4.6
IRX3-203ENST00000558180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.78■■■■■ 4.6
IRX3-203ENST00000558180 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
IRX3-203ENST00000558180 PLCH2O75038 1416 aa43.73■■■■■ 4.59
IRX3-203ENST00000558180 PREX2Q70Z35 1606 aa43.72■■■■■ 4.59
IRX3-203ENST00000558180 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.71■■■■■ 4.59
IRX3-203ENST00000558180 GLI2P10070 1586 aa43.71■■■■■ 4.59
IRX3-203ENST00000558180 DIP2BQ9P265 1576 aa43.7■■■■■ 4.59
IRX3-203ENST00000558180 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.68■■■■■ 4.58
IRX3-203ENST00000558180 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.68■■■■■ 4.58
IRX3-203ENST00000558180 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.68■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms