RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558180.2

IRX3-203, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene IRX3, Length 1,540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-203ENST00000558180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.03■■■■■ 8.32
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IRX3-203ENST00000558180 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.1■■■■■ 6.57
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IRX3-203ENST00000558180 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.47■■■■■ 6.47
IRX3-203ENST00000558180 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.19■■■■■ 6.42
IRX3-203ENST00000558180 NACADO15069 1562 aa55.1■■■■■ 6.41
IRX3-203ENST00000558180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.83■■■■■ 6.37
IRX3-203ENST00000558180 SCRIBQ14160 1630 aa53.95■■■■■ 6.23
IRX3-203ENST00000558180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.91■■■■■ 6.22
IRX3-203ENST00000558180 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.61■■■■■ 6.17
IRX3-203ENST00000558180 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.18■■■■■ 6.1
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IRX3-203ENST00000558180 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.13■■■■■ 5.94
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IRX3-203ENST00000558180 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.72■■■■■ 5.87
IRX3-203ENST00000558180 SMARCA4P51532 1647 aa51.7■■■■■ 5.87
IRX3-203ENST00000558180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.65■■■■■ 5.86
IRX3-203ENST00000558180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.62■■■■■ 5.85
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IRX3-203ENST00000558180 WIZO95785 1651 aa51.21■■■■■ 5.79
IRX3-203ENST00000558180 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.15■■■■■ 5.78
IRX3-203ENST00000558180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.12■■■■■ 5.77
IRX3-203ENST00000558180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.11■■■■■ 5.77
IRX3-203ENST00000558180 SMARCA2P51531 1590 aa51.07■■■■■ 5.77
IRX3-203ENST00000558180 NCAPD3P42695 1498 aa50.88■■■■■ 5.74
IRX3-203ENST00000558180 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.76■■■■■ 5.72
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IRX3-203ENST00000558180 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.18■■■■■ 5.62
IRX3-203ENST00000558180 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.49■■■■■ 5.51
IRX3-203ENST00000558180 CFTRP13569 1480 aa49.46■■■■■ 5.51
IRX3-203ENST00000558180 NESP48681 1621 aa49.3■■■■■ 5.48
IRX3-203ENST00000558180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.27■■■■■ 5.48
IRX3-203ENST00000558180 PRDM2Q13029 1718 aa49.07■■■■■ 5.45
IRX3-203ENST00000558180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.93■■■■■ 5.42
IRX3-203ENST00000558180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.91■■■■■ 5.42
IRX3-203ENST00000558180 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.77■■■■■ 5.4
IRX3-203ENST00000558180 ABCC8Q09428 1581 aa48.75■■■■■ 5.39
IRX3-203ENST00000558180 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.7■■■■■ 5.39
IRX3-203ENST00000558180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.67■■■■■ 5.38
IRX3-203ENST00000558180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.61■■■■■ 5.37
IRX3-203ENST00000558180 ERCC6Q03468 1493 aa48.54■■■■■ 5.36
IRX3-203ENST00000558180 TRIM41Q8WV44 630 aa48.45■■■■■ 5.35
IRX3-203ENST00000558180 CUX1P39880 1505 aa48.43■■■■■ 5.34
IRX3-203ENST00000558180 SYNJ1O43426 1573 aa48.41■■■■■ 5.34
IRX3-203ENST00000558180 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
IRX3-203ENST00000558180 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.35■■■■■ 5.33
IRX3-203ENST00000558180 TOP2BQ02880 1626 aa48.32■■■■■ 5.33
IRX3-203ENST00000558180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.3■■■■■ 5.32
IRX3-203ENST00000558180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.28■■■■■ 5.32
IRX3-203ENST00000558180 TOPBP1Q92547 1522 aa48.27■■■■■ 5.32
IRX3-203ENST00000558180 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
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IRX3-203ENST00000558180 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.05■■■■■ 5.28
IRX3-203ENST00000558180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
IRX3-203ENST00000558180 SOGA1O94964 1423 aa47.82■■■■■ 5.25
IRX3-203ENST00000558180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.79■■■■■ 5.24
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IRX3-203ENST00000558180 IFT140Q96RY7 1462 aa47.61■■■■■ 5.21
IRX3-203ENST00000558180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.55■■■■■ 5.2
IRX3-203ENST00000558180 WDR97A6NE52 1622 aa47.51■■■■■ 5.2
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IRX3-203ENST00000558180 KIF27Q86VH2 1401 aa47.48■■■■■ 5.19
IRX3-203ENST00000558180 EEA1Q15075 1411 aa47.43■■■■■ 5.18
IRX3-203ENST00000558180 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
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IRX3-203ENST00000558180 IGF1RP08069 1367 aa47.17■■■■■ 5.14
IRX3-203ENST00000558180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
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IRX3-203ENST00000558180 GRIN2BQ13224 1484 aa47.06■■■■■ 5.12
IRX3-203ENST00000558180 PBRM1Q86U86 1689 aa47.01■■■■■ 5.12
IRX3-203ENST00000558180 PRXQ9BXM0 1461 aa46.93■■■■■ 5.1
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IRX3-203ENST00000558180 SYNJ2O15056 1496 aa46.59■■■■■ 5.05
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IRX3-203ENST00000558180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
IRX3-203ENST00000558180 FBLN2P98095 1184 aa46.47■■■■■ 5.03
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IRX3-203ENST00000558180 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.4■■■■■ 5.02
IRX3-203ENST00000558180 CHD1O14646 1710 aa46.29■■■■■ 5
IRX3-203ENST00000558180 NUP160Q12769 1436 aa46.2■■■■■ 4.99
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