RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 FBLN2P98095 1184 aa28.01■■■□□ 2.07
LGMN-216ENST00000557434 CEP162Q5TB80 1403 aa28■■■□□ 2.07
LGMN-216ENST00000557434 NUP160Q12769 1436 aa27.97■■■□□ 2.07
LGMN-216ENST00000557434 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.89■■■□□ 2.06
LGMN-216ENST00000557434 IQGAP2Q13576 1575 aa27.89■■■□□ 2.05
LGMN-216ENST00000557434 CLIP1P30622 1438 aa27.89■■■□□ 2.05
LGMN-216ENST00000557434 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
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LGMN-216ENST00000557434 SAMD9Q5K651 1589 aa27.77■■■□□ 2.04
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LGMN-216ENST00000557434 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.76■■■□□ 2.03
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LGMN-216ENST00000557434 DISP1Q96F81 1524 aa27.69■■■□□ 2.02
LGMN-216ENST00000557434 SHROOM2Q13796 1616 aa27.68■■■□□ 2.02
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LGMN-216ENST00000557434 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.65■■■□□ 2.02
LGMN-216ENST00000557434 P3H3Q8IVL6 736 aa27.65■■■□□ 2.02
LGMN-216ENST00000557434 KIAA0556O60303 1618 aa27.64■■■□□ 2.02
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LGMN-216ENST00000557434 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.58■■■□□ 2.01
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LGMN-216ENST00000557434 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.31■■□□□ 1.96
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LGMN-216ENST00000557434 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.16■■□□□ 1.94
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LGMN-216ENST00000557434 ABCC2Q92887 1545 aa27.12■■□□□ 1.93
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LGMN-216ENST00000557434 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.1■■□□□ 1.93
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LGMN-216ENST00000557434 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.09■■□□□ 1.93
LGMN-216ENST00000557434 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.09■■□□□ 1.93
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LGMN-216ENST00000557434 NCOA2Q15596 1464 aa26.83■■□□□ 1.89
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LGMN-216ENST00000557434 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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LGMN-216ENST00000557434 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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LGMN-216ENST00000557434 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.72■■□□□ 1.87
LGMN-216ENST00000557434 ASXL2Q76L83 1435 aa26.72■■□□□ 1.87
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LGMN-216ENST00000557434 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.63■■□□□ 1.85
LGMN-216ENST00000557434 KCNH8Q96L42 1107 aa26.63■■□□□ 1.85
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LGMN-216ENST00000557434 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.6■■□□□ 1.85
LGMN-216ENST00000557434 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.58■■□□□ 1.85
LGMN-216ENST00000557434 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.57■■□□□ 1.84
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LGMN-216ENST00000557434 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.56■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 PREX2Q70Z35 1606 aa26.55■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 MIA2Q96PC5 1412 aa26.54■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.53■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
LGMN-216ENST00000557434 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
LGMN-216ENST00000557434 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
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