RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.85■■□□□ 1.41
PCNX4-209ENST00000555569 JPH4Q96JJ6 628 aa23.83■■□□□ 1.41
PCNX4-209ENST00000555569 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PCNX4-209ENST00000555569 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.77■■□□□ 1.4
PCNX4-209ENST00000555569 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.75■■□□□ 1.39
PCNX4-209ENST00000555569 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.66■■□□□ 1.38
PCNX4-209ENST00000555569 IQGAP2Q13576 1575 aa23.58■■□□□ 1.37
PCNX4-209ENST00000555569 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.58■■□□□ 1.37
PCNX4-209ENST00000555569 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.53■■□□□ 1.36
PCNX4-209ENST00000555569 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.52■■□□□ 1.36
PCNX4-209ENST00000555569 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PCNX4-209ENST00000555569 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.49■■□□□ 1.35
PCNX4-209ENST00000555569 PTPRGP23470 1445 aa23.49■■□□□ 1.35
PCNX4-209ENST00000555569 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.47■■□□□ 1.35
PCNX4-209ENST00000555569 MAPKBP1O60336 1514 aa23.45■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 DISP1Q96F81 1524 aa23.43■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.41■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.39■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 PRXQ9BXM0 1461 aa23.39■■□□□ 1.34
PCNX4-209ENST00000555569 KIAA0556O60303 1618 aa23.36■■□□□ 1.33
PCNX4-209ENST00000555569 DIP2BQ9P265 1576 aa23.35■■□□□ 1.33
PCNX4-209ENST00000555569 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.35■■□□□ 1.33
PCNX4-209ENST00000555569 ABCC2Q92887 1545 aa23.33■■□□□ 1.33
PCNX4-209ENST00000555569 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
PCNX4-209ENST00000555569 UACAQ9BZF9 1416 aa23.32■■□□□ 1.32
PCNX4-209ENST00000555569 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.27■■□□□ 1.32
PCNX4-209ENST00000555569 GOLGA3Q08378 1498 aa23.27■■□□□ 1.32
PCNX4-209ENST00000555569 EEA1Q15075 1411 aa23.25■■□□□ 1.31
PCNX4-209ENST00000555569 ASXL2Q76L83 1435 aa23.22■■□□□ 1.31
PCNX4-209ENST00000555569 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.22■■□□□ 1.31
PCNX4-209ENST00000555569 TSPOAP1O95153 1857 aa23.22■■□□□ 1.31
PCNX4-209ENST00000555569 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.21■■□□□ 1.31
PCNX4-209ENST00000555569 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PCNX4-209ENST00000555569 GLI2P10070 1586 aa23.14■■□□□ 1.3
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA8O94911 1581 aa23.13■■□□□ 1.29
PCNX4-209ENST00000555569 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PCNX4-209ENST00000555569 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PCNX4-209ENST00000555569 KDM6BO15054 1643 aa23.09■■□□□ 1.29
PCNX4-209ENST00000555569 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 SAMD9Q5K651 1589 aa23.06■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 P3H3Q8IVL6 736 aa23.06■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.05■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 KIF21BO75037 1637 aa23.04■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.03■■□□□ 1.28
PCNX4-209ENST00000555569 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.95■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.94■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 ATP10BO94823 1461 aa22.92■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 KCNH8Q96L42 1107 aa22.92■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.91■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 ARID3CA6NKF2 412 aa22.91■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.89■■□□□ 1.26
PCNX4-209ENST00000555569 CD109Q6YHK3 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.85■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.85■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PCNX4-209ENST00000555569 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PCNX4-209ENST00000555569 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.78■■□□□ 1.24
PCNX4-209ENST00000555569 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.72■■□□□ 1.23
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.71■■□□□ 1.23
PCNX4-209ENST00000555569 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.69■■□□□ 1.22
PCNX4-209ENST00000555569 FMN1Q68DA7 1419 aa22.67■■□□□ 1.22
PCNX4-209ENST00000555569 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.66■■□□□ 1.22
PCNX4-209ENST00000555569 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.64■■□□□ 1.22
PCNX4-209ENST00000555569 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 HECW1Q76N89 1606 aa22.63■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 NEO1Q92859 1461 aa22.62■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 ADGRL1O94910 1474 aa22.61■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
PCNX4-209ENST00000555569 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.55■■□□□ 1.2
PCNX4-209ENST00000555569 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.53■■□□□ 1.2
PCNX4-209ENST00000555569 RAPGEF3O95398 923 aa22.52■■□□□ 1.2
PCNX4-209ENST00000555569 FANCAO15360 1455 aa22.51■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.51■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.5■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 AKNAQ7Z591 1439 aa22.48■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 RICTORQ6R327 1708 aa22.45■■□□□ 1.19
PCNX4-209ENST00000555569 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.45■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 PLCH2O75038 1416 aa22.44■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 CLIP1P30622 1438 aa22.44■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 KIF14Q15058 1648 aa22.44■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.44■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.41■■□□□ 1.18
PCNX4-209ENST00000555569 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.39■■□□□ 1.17
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.38■■□□□ 1.17
PCNX4-209ENST00000555569 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.36■■□□□ 1.17
PCNX4-209ENST00000555569 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.36■■□□□ 1.17
PCNX4-209ENST00000555569 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.34■■□□□ 1.17
PCNX4-209ENST00000555569 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.32■■□□□ 1.16
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