RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555467.1

KLC1-218, Transcript of kinesin light chain 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLC1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC1-218ENST00000555467 CUL7Q14999 1698 aa42.41■■■■■ 4.38
KLC1-218ENST00000555467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
KLC1-218ENST00000555467 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.3■■■■■ 4.36
KLC1-218ENST00000555467 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.29■■■■■ 4.36
KLC1-218ENST00000555467 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.95■■■■■ 4.31
KLC1-218ENST00000555467 IQGAP2Q13576 1575 aa41.9■■■■■ 4.3
KLC1-218ENST00000555467 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.87■■■■■ 4.29
KLC1-218ENST00000555467 PTPRGP23470 1445 aa41.79■■■■■ 4.28
KLC1-218ENST00000555467 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.79■■■■■ 4.28
KLC1-218ENST00000555467 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.76■■■■■ 4.28
KLC1-218ENST00000555467 DISP1Q96F81 1524 aa41.75■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 MAPKBP1O60336 1514 aa41.74■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 PRXQ9BXM0 1461 aa41.7■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.69■■■■■ 4.27
KLC1-218ENST00000555467 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.66■■■■■ 4.26
KLC1-218ENST00000555467 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
KLC1-218ENST00000555467 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.56■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 DIP2BQ9P265 1576 aa41.55■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 KIAA0556O60303 1618 aa41.54■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 ABCC2Q92887 1545 aa41.54■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.51■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 UACAQ9BZF9 1416 aa41.51■■■■■ 4.24
KLC1-218ENST00000555467 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.42■■■■■ 4.22
KLC1-218ENST00000555467 ASXL2Q76L83 1435 aa41.35■■■■■ 4.21
KLC1-218ENST00000555467 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
KLC1-218ENST00000555467 GOLGA3Q08378 1498 aa41.34■■■■■ 4.21
KLC1-218ENST00000555467 EEA1Q15075 1411 aa41.31■■■■■ 4.2
KLC1-218ENST00000555467 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.29■■■■■ 4.2
KLC1-218ENST00000555467 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
KLC1-218ENST00000555467 GLI2P10070 1586 aa41.18■■■■■ 4.18
KLC1-218ENST00000555467 ABCA8O94911 1581 aa41.17■■■■■ 4.18
KLC1-218ENST00000555467 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
KLC1-218ENST00000555467 TSPOAP1O95153 1857 aa41.11■■■■■ 4.17
KLC1-218ENST00000555467 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
KLC1-218ENST00000555467 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.07■■■■■ 4.17
KLC1-218ENST00000555467 SAMD9Q5K651 1589 aa41.04■■■■■ 4.16
KLC1-218ENST00000555467 P3H3Q8IVL6 736 aa41.04■■■■■ 4.16
KLC1-218ENST00000555467 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
KLC1-218ENST00000555467 KDM6BO15054 1643 aa41.02■■■■■ 4.16
KLC1-218ENST00000555467 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.01■■■■■ 4.16
KLC1-218ENST00000555467 KIF21BO75037 1637 aa40.96■■■■■ 4.15
KLC1-218ENST00000555467 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.96■■■■■ 4.15
KLC1-218ENST00000555467 ATP10BO94823 1461 aa40.83■■■■■ 4.13
KLC1-218ENST00000555467 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.78■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 ARID3CA6NKF2 412 aa40.78■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.77■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 KCNH8Q96L42 1107 aa40.76■■■■■ 4.12
KLC1-218ENST00000555467 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.75■■■■■ 4.11
KLC1-218ENST00000555467 CD109Q6YHK3 1445 aa40.7■■■■■ 4.11
KLC1-218ENST00000555467 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.68■■■■■ 4.1
KLC1-218ENST00000555467 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.68■■■■■ 4.1
KLC1-218ENST00000555467 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
KLC1-218ENST00000555467 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.66■■■■■ 4.1
KLC1-218ENST00000555467 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.62■■■■■ 4.09
KLC1-218ENST00000555467 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
KLC1-218ENST00000555467 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.52■■■■■ 4.08
KLC1-218ENST00000555467 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.49■■■■■ 4.07
KLC1-218ENST00000555467 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
KLC1-218ENST00000555467 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
KLC1-218ENST00000555467 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.45■■■■■ 4.07
KLC1-218ENST00000555467 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.35■■■■■ 4.05
KLC1-218ENST00000555467 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.33■■■■■ 4.05
KLC1-218ENST00000555467 FMN1Q68DA7 1419 aa40.31■■■■■ 4.04
KLC1-218ENST00000555467 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
KLC1-218ENST00000555467 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.27■■■■■ 4.04
KLC1-218ENST00000555467 ADGRL1O94910 1474 aa40.26■■■■■ 4.03
KLC1-218ENST00000555467 NEO1Q92859 1461 aa40.24■■■■■ 4.03
KLC1-218ENST00000555467 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.036e-7■■■□□ 18
KLC1-218ENST00000555467 HECW1Q76N89 1606 aa40.17■■■■■ 4.02
KLC1-218ENST00000555467 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.13■■■■■ 4.01
KLC1-218ENST00000555467 RAPGEF3O95398 923 aa40.11■■■■■ 4.01
KLC1-218ENST00000555467 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
KLC1-218ENST00000555467 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.07■■■■■ 4.01
KLC1-218ENST00000555467 FANCAO15360 1455 aa40.03■■■■■ 4
KLC1-218ENST00000555467 AKNAQ7Z591 1439 aa40.02■■■■■ 4
KLC1-218ENST00000555467 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.98■■■■□ 3.99
KLC1-218ENST00000555467 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
KLC1-218ENST00000555467 PLCH2O75038 1416 aa39.96■■■■□ 3.99
KLC1-218ENST00000555467 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.96■■■■□ 3.99
KLC1-218ENST00000555467 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.94■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 KIF14Q15058 1648 aa39.91■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 CLIP1P30622 1438 aa39.91■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 RICTORQ6R327 1708 aa39.89■■■■□ 3.98
KLC1-218ENST00000555467 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.82■■■■□ 3.97
KLC1-218ENST00000555467 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.8■■■■□ 3.96
KLC1-218ENST00000555467 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.79■■■■□ 3.96
KLC1-218ENST00000555467 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.79■■■■□ 3.96
KLC1-218ENST00000555467 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.77■■■■□ 3.96
KLC1-218ENST00000555467 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.77■■■■□ 3.96
KLC1-218ENST00000555467 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.75■■■■□ 3.95
KLC1-218ENST00000555467 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.8 ms