RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555467.1

KLC1-218, Transcript of kinesin light chain 1, humanhuman

TSL 2

Gene KLC1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC1-218ENST00000555467 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.92■■■■■ 7.34
KLC1-218ENST00000555467 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.37■■■■■ 6.29
KLC1-218ENST00000555467 ABCC9O60706 1549 aa53.95■■■■■ 6.23
KLC1-218ENST00000555467 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.53■■■■■ 5.84
KLC1-218ENST00000555467 NACADO15069 1562 aa51.32■■■■■ 5.81
KLC1-218ENST00000555467 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.09■■■■■ 5.77
KLC1-218ENST00000555467 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.83■■■■■ 5.73
KLC1-218ENST00000555467 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
KLC1-218ENST00000555467 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.36■■■■■ 5.65
KLC1-218ENST00000555467 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.34■■■■■ 5.65
KLC1-218ENST00000555467 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.32■■■■■ 5.65
KLC1-218ENST00000555467 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.28■■■■■ 5.64
KLC1-218ENST00000555467 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.11■■■■■ 5.61
KLC1-218ENST00000555467 SCRIBQ14160 1630 aa49.6■■■■■ 5.53
KLC1-218ENST00000555467 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.44■■■■■ 5.5
KLC1-218ENST00000555467 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
KLC1-218ENST00000555467 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.75■■■■■ 5.39
KLC1-218ENST00000555467 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.55■■■■■ 5.36
KLC1-218ENST00000555467 NCAPD3P42695 1498 aa47.43■■■■■ 5.18
KLC1-218ENST00000555467 SMARCA4P51532 1647 aa47.38■■■■■ 5.18
KLC1-218ENST00000555467 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.35■■■■■ 5.17
KLC1-218ENST00000555467 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
KLC1-218ENST00000555467 SMARCA2P51531 1590 aa47.18■■■■■ 5.14
KLC1-218ENST00000555467 HMGXB3Q12766 1538 aa47.09■■■■■ 5.13
KLC1-218ENST00000555467 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.96■■■■■ 5.11
KLC1-218ENST00000555467 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.96■■■■■ 5.11
KLC1-218ENST00000555467 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
KLC1-218ENST00000555467 NESP48681 1621 aa46.52■■■■■ 5.04
KLC1-218ENST00000555467 ERCC6Q03468 1493 aa46.48■■■■■ 5.03
KLC1-218ENST00000555467 WIZO95785 1651 aa46.36■■■■■ 5.01
KLC1-218ENST00000555467 CUX2O14529 1486 aa46.29■■■■■ 5
KLC1-218ENST00000555467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.22■■■■■ 4.99
KLC1-218ENST00000555467 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
KLC1-218ENST00000555467 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.99■■■■■ 4.95
KLC1-218ENST00000555467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.94■■■■■ 4.94
KLC1-218ENST00000555467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
KLC1-218ENST00000555467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.85■■■■■ 4.93
KLC1-218ENST00000555467 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
KLC1-218ENST00000555467 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.75■■■■■ 4.91
KLC1-218ENST00000555467 CFTRP13569 1480 aa45.59■■■■■ 4.89
KLC1-218ENST00000555467 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.53■■■■■ 4.88
KLC1-218ENST00000555467 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.45■■■■■ 4.87
KLC1-218ENST00000555467 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.43■■■■■ 4.86
KLC1-218ENST00000555467 WDR62O43379 1518 aa45.42■■■■■ 4.86
KLC1-218ENST00000555467 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.34■■■■■ 4.85
KLC1-218ENST00000555467 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
KLC1-218ENST00000555467 PRDM2Q13029 1718 aa45.02■■■■■ 4.8
KLC1-218ENST00000555467 TOPBP1Q92547 1522 aa44.66■■■■■ 4.74
KLC1-218ENST00000555467 ABCC8Q09428 1581 aa44.54■■■■■ 4.72
KLC1-218ENST00000555467 IFT140Q96RY7 1462 aa44.53■■■■■ 4.72
KLC1-218ENST00000555467 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.51■■■■■ 4.72
KLC1-218ENST00000555467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
KLC1-218ENST00000555467 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
KLC1-218ENST00000555467 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
KLC1-218ENST00000555467 OSCARQ8IYS5 282 aa44.24■■■■■ 4.67
KLC1-218ENST00000555467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
KLC1-218ENST00000555467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
KLC1-218ENST00000555467 CUX1P39880 1505 aa44.09■■■■■ 4.65
KLC1-218ENST00000555467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.08■■■■■ 4.65
KLC1-218ENST00000555467 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.08■■■■■ 4.65
KLC1-218ENST00000555467 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.02■■■■■ 4.64
KLC1-218ENST00000555467 SOGA1O94964 1423 aa44.02■■■■■ 4.64
KLC1-218ENST00000555467 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
KLC1-218ENST00000555467 TRIM41Q8WV44 630 aa43.86■■■■■ 4.61
KLC1-218ENST00000555467 WDR97A6NE52 1622 aa43.77■■■■■ 4.6
KLC1-218ENST00000555467 CHD1O14646 1710 aa43.7■■■■■ 4.59
KLC1-218ENST00000555467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.64■■■■■ 4.58
KLC1-218ENST00000555467 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.62■■■■■ 4.57
KLC1-218ENST00000555467 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.62■■■■■ 4.57
KLC1-218ENST00000555467 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.62■■■■■ 4.57
KLC1-218ENST00000555467 FBLN2P98095 1184 aa43.6■■■■■ 4.57
KLC1-218ENST00000555467 GRIN2BQ13224 1484 aa43.58■■■■■ 4.57
KLC1-218ENST00000555467 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.57■■■■■ 4.56
KLC1-218ENST00000555467 ARHGEF11O15085 1522 aa43.56■■■■■ 4.56
KLC1-218ENST00000555467 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
KLC1-218ENST00000555467 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.5■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 TOP2BQ02880 1626 aa43.47■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 SYNJ1O43426 1573 aa43.46■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.46■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.44■■■■■ 4.55
KLC1-218ENST00000555467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
KLC1-218ENST00000555467 SYNJ2O15056 1496 aa43.38■■■■■ 4.54
KLC1-218ENST00000555467 PBRM1Q86U86 1689 aa43.38■■■■■ 4.54
KLC1-218ENST00000555467 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.32■■■■■ 4.52
KLC1-218ENST00000555467 ARAP1Q96P48 1450 aa43.19■■■■■ 4.51
KLC1-218ENST00000555467 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.18■■■■■ 4.5
KLC1-218ENST00000555467 ADAMTS12P58397 1594 aa43.07■■■■■ 4.49
KLC1-218ENST00000555467 GRIN2AQ12879 1464 aa43.03■■■■■ 4.48
KLC1-218ENST00000555467 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43■■■■■ 4.47
KLC1-218ENST00000555467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.97■■■■■ 4.47
KLC1-218ENST00000555467 NUP160Q12769 1436 aa42.91■■■■■ 4.46
KLC1-218ENST00000555467 CEP170Q5SW79 1584 aa42.86■■■■■ 4.45
KLC1-218ENST00000555467 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.69■■■■■ 4.42
KLC1-218ENST00000555467 SHROOM2Q13796 1616 aa42.63■■■■■ 4.41
KLC1-218ENST00000555467 KIF27Q86VH2 1401 aa42.63■■■■■ 4.41
KLC1-218ENST00000555467 IGF1RP08069 1367 aa42.62■■■■■ 4.41
KLC1-218ENST00000555467 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
KLC1-218ENST00000555467 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.46■■■■■ 4.39
KLC1-218ENST00000555467 JPH4Q96JJ6 628 aa42.43■■■■■ 4.38
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