RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHROOM2Q13796 1616 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CUL7Q14999 1698 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.39■■□□□ 1.34
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.39■■□□□ 1.34
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.26■■□□□ 1.31
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PTPRGP23470 1445 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IQGAP2Q13576 1575 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAPKBP1O60336 1514 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UACAQ9BZF9 1416 aa23■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DISP1Q96F81 1524 aa23■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCC2Q92887 1545 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GOLGA3Q08378 1498 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRXQ9BXM0 1461 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DIP2BQ9P265 1576 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ASXL2Q76L83 1435 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA0556O60303 1618 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EEA1Q15075 1411 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 P3H3Q8IVL6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM6BO15054 1643 aa22.77■■□□□ 1.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TSPOAP1O95153 1857 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GLI2P10070 1586 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KCNH8Q96L42 1107 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.7■■□□□ 1.22
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARID3CA6NKF2 412 aa22.68■■□□□ 1.22
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCA8O94911 1581 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CD109Q6YHK3 1445 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.6■■□□□ 1.21
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SAMD9Q5K651 1589 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP10BO94823 1461 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF21BO75037 1637 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FMN1Q68DA7 1419 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADGRL1O94910 1474 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NEO1Q92859 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAPGEF3O95398 923 aa22.28■■□□□ 1.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.27■■□□□ 1.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HECW1Q76N89 1606 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FANCAO15360 1455 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AKNAQ7Z591 1439 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CLIP1P30622 1438 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLCH2O75038 1416 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF14Q15058 1648 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22■■□□□ 1.11
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.99■■□□□ 1.11
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