RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.58■■■□□ 2.97
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.97■■■□□ 2.39
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCC9O60706 1549 aa29.89■■■□□ 2.38
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.54■■■□□ 2.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.52■■■□□ 2.16
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NACADO15069 1562 aa28.38■■■□□ 2.13
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.02■■■□□ 2.08
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.73■■■□□ 2.03
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.64■■■□□ 2.02
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.54■■■□□ 2
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SCRIBQ14160 1630 aa27.38■■□□□ 1.97
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.34■■□□□ 1.97
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.94■■□□□ 1.9
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NCAPD3P42695 1498 aa26.2■■□□□ 1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SMARCA2P51531 1590 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SMARCA4P51532 1647 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMGXB3Q12766 1538 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ERCC6Q03468 1493 aa25.89■■□□□ 1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CUX2O14529 1486 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NESP48681 1621 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WIZO95785 1651 aa25.51■■□□□ 1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CFTRP13569 1480 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC88BA6NC98 1476 aa25■■□□□ 1.59
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRDM2Q13029 1718 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCC8Q09428 1581 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 OSCARQ8IYS5 282 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IFT140Q96RY7 1462 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOPBP1Q92547 1522 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.58■■□□□ 1.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRIM41Q8WV44 630 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SOGA1O94964 1423 aa24.4■■□□□ 1.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FBLN2P98095 1184 aa24.36■■□□□ 1.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CUX1P39880 1505 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR97A6NE52 1622 aa24.19■■□□□ 1.46
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GRIN2BQ13224 1484 aa24.14■■□□□ 1.46
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGEF11O15085 1522 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHD1O14646 1710 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.07■■□□□ 1.44
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SYNJ2O15056 1496 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SYNJ1O43426 1573 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOP2BQ02880 1626 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PBRM1Q86U86 1689 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARAP1Q96P48 1450 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GRIN2AQ12879 1464 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADAMTS12P58397 1594 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NUP160Q12769 1436 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF27Q86VH2 1401 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CEP170Q5SW79 1584 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 JPH4Q96JJ6 628 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGF1RP08069 1367 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.48■■□□□ 1.35
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