RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553550.5

PRMT5-210, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, humanhuman

TSL 3

Gene PRMT5, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT5-210ENST00000553550 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
PRMT5-210ENST00000553550 JPH4Q96JJ6 628 aa37.45■■■■□ 3.59
PRMT5-210ENST00000553550 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.36■■■■□ 3.57
PRMT5-210ENST00000553550 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.3■■■■□ 3.56
PRMT5-210ENST00000553550 IQGAP2Q13576 1575 aa37.07■■■■□ 3.52
PRMT5-210ENST00000553550 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.06■■■■□ 3.52
PRMT5-210ENST00000553550 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.03■■■■□ 3.52
PRMT5-210ENST00000553550 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.98■■■■□ 3.51
PRMT5-210ENST00000553550 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.98■■■■□ 3.51
PRMT5-210ENST00000553550 MAPKBP1O60336 1514 aa36.97■■■■□ 3.51
PRMT5-210ENST00000553550 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
PRMT5-210ENST00000553550 PTPRGP23470 1445 aa36.93■■■■□ 3.5
PRMT5-210ENST00000553550 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.91■■■■□ 3.5
PRMT5-210ENST00000553550 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.87■■■■□ 3.49
PRMT5-210ENST00000553550 DISP1Q96F81 1524 aa36.85■■■■□ 3.49
PRMT5-210ENST00000553550 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.84■■■■□ 3.49
PRMT5-210ENST00000553550 DIP2BQ9P265 1576 aa36.81■■■■□ 3.48
PRMT5-210ENST00000553550 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
PRMT5-210ENST00000553550 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.76■■■■□ 3.48
PRMT5-210ENST00000553550 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.76■■■■□ 3.47
PRMT5-210ENST00000553550 ABCC2Q92887 1545 aa36.75■■■■□ 3.47
PRMT5-210ENST00000553550 PRXQ9BXM0 1461 aa36.74■■■■□ 3.47
PRMT5-210ENST00000553550 KIAA0556O60303 1618 aa36.74■■■■□ 3.47
PRMT5-210ENST00000553550 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.71■■■■□ 3.47
PRMT5-210ENST00000553550 UACAQ9BZF9 1416 aa36.68■■■■□ 3.46
PRMT5-210ENST00000553550 GOLGA3Q08378 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
PRMT5-210ENST00000553550 ASXL2Q76L83 1435 aa36.56■■■■□ 3.44
PRMT5-210ENST00000553550 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.55■■■■□ 3.44
PRMT5-210ENST00000553550 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.54■■■■□ 3.44
PRMT5-210ENST00000553550 TSPOAP1O95153 1857 aa36.48■■■■□ 3.43
PRMT5-210ENST00000553550 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
PRMT5-210ENST00000553550 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.46■■■■□ 3.43
PRMT5-210ENST00000553550 GLI2P10070 1586 aa36.45■■■■□ 3.43
PRMT5-210ENST00000553550 EEA1Q15075 1411 aa36.43■■■■□ 3.42
PRMT5-210ENST00000553550 KDM6BO15054 1643 aa36.41■■■■□ 3.42
PRMT5-210ENST00000553550 ABCA8O94911 1581 aa36.37■■■■□ 3.41
PRMT5-210ENST00000553550 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PRMT5-210ENST00000553550 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
PRMT5-210ENST00000553550 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
PRMT5-210ENST00000553550 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.28■■■■□ 3.4
PRMT5-210ENST00000553550 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.27■■■■□ 3.4
PRMT5-210ENST00000553550 SAMD9Q5K651 1589 aa36.25■■■■□ 3.39
PRMT5-210ENST00000553550 P3H3Q8IVL6 736 aa36.17■■■■□ 3.38
PRMT5-210ENST00000553550 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
PRMT5-210ENST00000553550 KIF21BO75037 1637 aa36.15■■■■□ 3.38
PRMT5-210ENST00000553550 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.14■■■■□ 3.38
PRMT5-210ENST00000553550 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.05■■■■□ 3.36
PRMT5-210ENST00000553550 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.04■■■■□ 3.36
PRMT5-210ENST00000553550 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.03■■■■□ 3.36
PRMT5-210ENST00000553550 ATP10BO94823 1461 aa36.03■■■■□ 3.36
PRMT5-210ENST00000553550 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
PRMT5-210ENST00000553550 KCNH8Q96L42 1107 aa36■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 ARID3CA6NKF2 412 aa35.99■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 CD109Q6YHK3 1445 aa35.99■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.98■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.98■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.95■■■■□ 3.35
PRMT5-210ENST00000553550 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PRMT5-210ENST00000553550 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.84■■■■□ 3.33
PRMT5-210ENST00000553550 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.83■■■■□ 3.33
PRMT5-210ENST00000553550 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PRMT5-210ENST00000553550 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
PRMT5-210ENST00000553550 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
PRMT5-210ENST00000553550 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.75■■■■□ 3.31
PRMT5-210ENST00000553550 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.69■■■■□ 3.3
PRMT5-210ENST00000553550 ADGRL1O94910 1474 aa35.69■■■■□ 3.3
PRMT5-210ENST00000553550 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.63■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.63■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.61■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 NEO1Q92859 1461 aa35.6■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 FMN1Q68DA7 1419 aa35.6■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
PRMT5-210ENST00000553550 HECW1Q76N89 1606 aa35.54■■■■□ 3.28
PRMT5-210ENST00000553550 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.27
PRMT5-210ENST00000553550 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.48■■■■□ 3.27
PRMT5-210ENST00000553550 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.44■■■■□ 3.26
PRMT5-210ENST00000553550 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.44■■■■□ 3.26
PRMT5-210ENST00000553550 RAPGEF3O95398 923 aa35.42■■■■□ 3.26
PRMT5-210ENST00000553550 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PRMT5-210ENST00000553550 FANCAO15360 1455 aa35.41■■■■□ 3.26
PRMT5-210ENST00000553550 AKNAQ7Z591 1439 aa35.36■■■■□ 3.25
PRMT5-210ENST00000553550 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
PRMT5-210ENST00000553550 RICTORQ6R327 1708 aa35.32■■■■□ 3.25
PRMT5-210ENST00000553550 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PRMT5-210ENST00000553550 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.3■■■■□ 3.24
PRMT5-210ENST00000553550 PLCH2O75038 1416 aa35.28■■■■□ 3.24
PRMT5-210ENST00000553550 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PRMT5-210ENST00000553550 KIF14Q15058 1648 aa35.27■■■■□ 3.24
PRMT5-210ENST00000553550 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.26■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.24■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.24■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.22■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 CLIP1P30622 1438 aa35.21■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.2■■■■□ 3.23
PRMT5-210ENST00000553550 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.17■■■■□ 3.22
PRMT5-210ENST00000553550 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.15■■■■□ 3.22
PRMT5-210ENST00000553550 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.14■■■■□ 3.22
PRMT5-210ENST00000553550 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms