RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF11O15085 1522 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF21BO75037 1637 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 JPH4Q96JJ6 628 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 SHROOM2Q13796 1616 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDSP2-207ENST00000551594 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDSP2-207ENST00000551594 IQGAP2Q13576 1575 aa30.92■■■□□ 2.54
CTDSP2-207ENST00000551594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.91■■■□□ 2.54
CTDSP2-207ENST00000551594 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.53
CTDSP2-207ENST00000551594 GOLGA3Q08378 1498 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDSP2-207ENST00000551594 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CTDSP2-207ENST00000551594 ARAP1Q96P48 1450 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDSP2-207ENST00000551594 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP2-207ENST00000551594 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.75■■■□□ 2.51
CTDSP2-207ENST00000551594 DISP1Q96F81 1524 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDSP2-207ENST00000551594 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CTDSP2-207ENST00000551594 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDSP2-207ENST00000551594 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA0556O60303 1618 aa30.62■■■□□ 2.49
CTDSP2-207ENST00000551594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.6■■■□□ 2.49
CTDSP2-207ENST00000551594 P3H3Q8IVL6 736 aa30.59■■■□□ 2.49
CTDSP2-207ENST00000551594 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.57■■■□□ 2.48
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPRGP23470 1445 aa30.55■■■□□ 2.48
CTDSP2-207ENST00000551594 SAMD9Q5K651 1589 aa30.54■■■□□ 2.48
CTDSP2-207ENST00000551594 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.42■■■□□ 2.46
CTDSP2-207ENST00000551594 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.42■■■□□ 2.46
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.4■■■□□ 2.46
CTDSP2-207ENST00000551594 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.36■■■□□ 2.45
CTDSP2-207ENST00000551594 UACAQ9BZF9 1416 aa30.34■■■□□ 2.45
CTDSP2-207ENST00000551594 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 CLIP1P30622 1438 aa30.32■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP162Q5TB80 1403 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCA8O94911 1581 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC2Q92887 1545 aa30.27■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.26■■■□□ 2.44
CTDSP2-207ENST00000551594 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
CTDSP2-207ENST00000551594 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDSP2-207ENST00000551594 ARID3CA6NKF2 412 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDSP2-207ENST00000551594 FMN1Q68DA7 1419 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDSP2-207ENST00000551594 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CTDSP2-207ENST00000551594 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP10BO94823 1461 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDSP2-207ENST00000551594 MAPKBP1O60336 1514 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDSP2-207ENST00000551594 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 ASXL2Q76L83 1435 aa30■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 HECW1Q76N89 1606 aa29.98■■■□□ 2.39
CTDSP2-207ENST00000551594 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDSP2-207ENST00000551594 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CTDSP2-207ENST00000551594 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.88■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.87■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 DIP2BQ9P265 1576 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNH8Q96L42 1107 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.86■■■□□ 2.37
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.81■■■□□ 2.36
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.79■■■□□ 2.36
CTDSP2-207ENST00000551594 GLI2P10070 1586 aa29.74■■■□□ 2.35
CTDSP2-207ENST00000551594 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPOAP1O95153 1857 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDSP2-207ENST00000551594 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.69■■■□□ 2.34
CTDSP2-207ENST00000551594 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.64■■■□□ 2.34
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF14Q15058 1648 aa29.61■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.61■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 CD109Q6YHK3 1445 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 TIAM1Q13009 1591 aa29.6■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.332e-9■■■□□ 17.2
CTDSP2-207ENST00000551594 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CTDSP2-207ENST00000551594 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDSP2-207ENST00000551594 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDSP2-207ENST00000551594 APLP2Q06481 763 aa29.52■■■□□ 2.32
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP3K1Q13233 1512 aa29.51■■■□□ 2.32
CTDSP2-207ENST00000551594 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CTDSP2-207ENST00000551594 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.49■■■□□ 2.31
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.48■■■□□ 2.31
CTDSP2-207ENST00000551594 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.43■■■□□ 2.3
CTDSP2-207ENST00000551594 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.42■■■□□ 2.3
CTDSP2-207ENST00000551594 PLCH2O75038 1416 aa29.4■■■□□ 2.3
CTDSP2-207ENST00000551594 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 NCOA2Q15596 1464 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 FANCAO15360 1455 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CTDSP2-207ENST00000551594 PREX2Q70Z35 1606 aa29.32■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.31■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 NEO1Q92859 1461 aa29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.2 ms