RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.97■■■■■ 4.79
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.77■■■■□ 3.96
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC9O60706 1549 aa38.7■■■■□ 3.79
CTDSP2-207ENST00000551594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.56■■■■□ 3.6
CTDSP2-207ENST00000551594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
CTDSP2-207ENST00000551594 NACADO15069 1562 aa37.32■■■■□ 3.56
CTDSP2-207ENST00000551594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.29■■■■□ 3.56
CTDSP2-207ENST00000551594 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.15■■■■□ 3.54
CTDSP2-207ENST00000551594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.15■■■■□ 3.54
CTDSP2-207ENST00000551594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDSP2-207ENST00000551594 SCRIBQ14160 1630 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDSP2-207ENST00000551594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.28■■■■□ 3.4
CTDSP2-207ENST00000551594 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.2■■■■□ 3.39
CTDSP2-207ENST00000551594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.87■■■■□ 3.33
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.26■■■■□ 3.24
CTDSP2-207ENST00000551594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CTDSP2-207ENST00000551594 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.07■■■■□ 3.2
CTDSP2-207ENST00000551594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.99■■■■□ 3.19
CTDSP2-207ENST00000551594 SMARCA4P51532 1647 aa34.83■■■■□ 3.17
CTDSP2-207ENST00000551594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CTDSP2-207ENST00000551594 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.71■■■■□ 3.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDSP2-207ENST00000551594 SMARCA2P51531 1590 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDSP2-207ENST00000551594 NCAPD3P42695 1498 aa34.45■■■■□ 3.1
CTDSP2-207ENST00000551594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
CTDSP2-207ENST00000551594 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.43■■■■□ 3.1
CTDSP2-207ENST00000551594 WIZO95785 1651 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDSP2-207ENST00000551594 HMGXB3Q12766 1538 aa34.29■■■■□ 3.08
CTDSP2-207ENST00000551594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CTDSP2-207ENST00000551594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CTDSP2-207ENST00000551594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.62■■■□□ 2.97
CTDSP2-207ENST00000551594 NESP48681 1621 aa33.61■■■□□ 2.97
CTDSP2-207ENST00000551594 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.48■■■□□ 2.95
CTDSP2-207ENST00000551594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.47■■■□□ 2.95
CTDSP2-207ENST00000551594 CFTRP13569 1480 aa33.35■■■□□ 2.93
CTDSP2-207ENST00000551594 ERCC6Q03468 1493 aa33.28■■■□□ 2.92
CTDSP2-207ENST00000551594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.24■■■□□ 2.91
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.2■■■□□ 2.91
CTDSP2-207ENST00000551594 PRDM2Q13029 1718 aa33.13■■■□□ 2.89
CTDSP2-207ENST00000551594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.12■■■□□ 2.89
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.01■■■□□ 2.88
CTDSP2-207ENST00000551594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
CTDSP2-207ENST00000551594 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.9■■■□□ 2.86
CTDSP2-207ENST00000551594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR62O43379 1518 aa32.77■■■□□ 2.84
CTDSP2-207ENST00000551594 CUX2O14529 1486 aa32.74■■■□□ 2.83
CTDSP2-207ENST00000551594 TOPBP1Q92547 1522 aa32.62■■■□□ 2.81
CTDSP2-207ENST00000551594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.6■■■□□ 2.81
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC8Q09428 1581 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDSP2-207ENST00000551594 CUX1P39880 1505 aa32.53■■■□□ 2.8
CTDSP2-207ENST00000551594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
CTDSP2-207ENST00000551594 SYNJ1O43426 1573 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDSP2-207ENST00000551594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDSP2-207ENST00000551594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.35■■■□□ 2.77
CTDSP2-207ENST00000551594 TOP2BQ02880 1626 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDSP2-207ENST00000551594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDSP2-207ENST00000551594 IFT140Q96RY7 1462 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDSP2-207ENST00000551594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDSP2-207ENST00000551594 SOGA1O94964 1423 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDSP2-207ENST00000551594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDSP2-207ENST00000551594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.737e-7■■■■□ 25.9
CTDSP2-207ENST00000551594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.73
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR97A6NE52 1622 aa32.05■■■□□ 2.72
CTDSP2-207ENST00000551594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.03■■■□□ 2.72
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM41Q8WV44 630 aa31.96■■■□□ 2.71
CTDSP2-207ENST00000551594 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.88■■■□□ 2.69
CTDSP2-207ENST00000551594 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.84■■■□□ 2.69
CTDSP2-207ENST00000551594 PBRM1Q86U86 1689 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDSP2-207ENST00000551594 GRIN2BQ13224 1484 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDSP2-207ENST00000551594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF27Q86VH2 1401 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDSP2-207ENST00000551594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CTDSP2-207ENST00000551594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.65■■■□□ 2.66
CTDSP2-207ENST00000551594 FBLN2P98095 1184 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDSP2-207ENST00000551594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.64■■■□□ 2.66
CTDSP2-207ENST00000551594 CHD1O14646 1710 aa31.61■■■□□ 2.65
CTDSP2-207ENST00000551594 IGF1RP08069 1367 aa31.58■■■□□ 2.65
CTDSP2-207ENST00000551594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CTDSP2-207ENST00000551594 SYNJ2O15056 1496 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTS12P58397 1594 aa31.55■■■□□ 2.64
CTDSP2-207ENST00000551594 OSCARQ8IYS5 282 aa31.51■■■□□ 2.63
CTDSP2-207ENST00000551594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.49■■■□□ 2.63
CTDSP2-207ENST00000551594 CUL7Q14999 1698 aa31.41■■■□□ 2.62
CTDSP2-207ENST00000551594 GRIN2AQ12879 1464 aa31.4■■■□□ 2.62
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDSP2-207ENST00000551594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.39■■■□□ 2.62
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CTDSP2-207ENST00000551594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.3■■■□□ 2.6
CTDSP2-207ENST00000551594 EEA1Q15075 1411 aa31.29■■■□□ 2.6
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP170Q5SW79 1584 aa31.26■■■□□ 2.6
CTDSP2-207ENST00000551594 NUP160Q12769 1436 aa31.24■■■□□ 2.59
CTDSP2-207ENST00000551594 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.23■■■□□ 2.59
CTDSP2-207ENST00000551594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDSP2-207ENST00000551594 PRXQ9BXM0 1461 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.03■■■□□ 2.56
CTDSP2-207ENST00000551594 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31■■■□□ 2.55
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