RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FBLN2P98095 1184 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-216ENST00000549221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-216ENST00000549221 CEP170Q5SW79 1584 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-216ENST00000549221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-216ENST00000549221 NUP160Q12769 1436 aa13.27□□□□□ -0.29
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CS-216ENST00000549221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa13.24□□□□□ -0.29
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CS-216ENST00000549221 IQGAP2Q13576 1575 aa13.2□□□□□ -0.3
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CS-216ENST00000549221 CEP162Q5TB80 1403 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-216ENST00000549221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-216ENST00000549221 ARHGEF11O15085 1522 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-216ENST00000549221 OSCARQ8IYS5 282 aa13.15□□□□□ -0.3
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CS-216ENST00000549221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-216ENST00000549221 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-216ENST00000549221 SHROOM2Q13796 1616 aa13.13□□□□□ -0.31
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CS-216ENST00000549221 KIAA0556O60303 1618 aa13.09□□□□□ -0.31
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CS-216ENST00000549221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-216ENST00000549221 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
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CS-216ENST00000549221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.01□□□□□ -0.33
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CS-216ENST00000549221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
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CS-216ENST00000549221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-216ENST00000549221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-216ENST00000549221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-216ENST00000549221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-216ENST00000549221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-216ENST00000549221 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
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CS-216ENST00000549221 HECW1Q76N89 1606 aa12.87□□□□□ -0.35
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CS-216ENST00000549221 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-216ENST00000549221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-216ENST00000549221 ARID3CA6NKF2 412 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-216ENST00000549221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
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CS-216ENST00000549221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-216ENST00000549221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 TIAM1Q13009 1591 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 ATP10BO94823 1461 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 MAP3K1Q13233 1512 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CS-216ENST00000549221 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 APLP2Q06481 763 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-216ENST00000549221 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 KIF14Q15058 1648 aa12.7□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 ASXL2Q76L83 1435 aa12.69□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.68□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.67□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 NCOA2Q15596 1464 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 MAPKBP1O60336 1514 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.66□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.65□□□□□ -0.38
CS-216ENST00000549221 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.63□□□□□ -0.39
CS-216ENST00000549221 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.392e-20■□□□□ 10.1
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CS-216ENST00000549221 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-216ENST00000549221 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 DIP2BQ9P265 1576 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 ABCA9Q8IUA7 1624 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 PREX2Q70Z35 1606 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 GLI2P10070 1586 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 PLCH2O75038 1416 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-216ENST00000549221 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.52□□□□□ -0.4
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