RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 ARAP1Q96P48 1450 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-211ENST00000548041 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-211ENST00000548041 IQGAP2Q13576 1575 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-211ENST00000548041 PRXQ9BXM0 1461 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-211ENST00000548041 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-211ENST00000548041 EEA1Q15075 1411 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-211ENST00000548041 KIF21BO75037 1637 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-211ENST00000548041 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-211ENST00000548041 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CS-211ENST00000548041 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-211ENST00000548041 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-211ENST00000548041 JPH4Q96JJ6 628 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-211ENST00000548041 KIAA0556O60303 1618 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-211ENST00000548041 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-211ENST00000548041 DISP1Q96F81 1524 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-211ENST00000548041 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.33□□□□□ -0.11
CS-211ENST00000548041 GOLGA3Q08378 1498 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-211ENST00000548041 SAMD9Q5K651 1589 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-211ENST00000548041 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-211ENST00000548041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-211ENST00000548041 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.26□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 PTPRGP23470 1445 aa14.24□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 ABCC2Q92887 1545 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
CS-211ENST00000548041 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 ABCA8O94911 1581 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 P3H3Q8IVL6 736 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.18□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 UACAQ9BZF9 1416 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 MAPKBP1O60336 1514 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-211ENST00000548041 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 DIP2BQ9P265 1576 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 TSPOAP1O95153 1857 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-211ENST00000548041 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.07□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 ASXL2Q76L83 1435 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 HECW1Q76N89 1606 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 ARID3CA6NKF2 412 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 CLIP1P30622 1438 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 ATP10BO94823 1461 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-211ENST00000548041 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 FMN1Q68DA7 1419 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 GLI2P10070 1586 aa14□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 CEP162Q5TB80 1403 aa14□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 CFAP43Q8NDM7 1665 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-211ENST00000548041 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.92□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 TTC37Q6PGP7 1564 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 KIF14Q15058 1648 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-211ENST00000548041 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 KDM6BO15054 1643 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 KCNH8Q96L42 1107 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.87□□□□□ -0.192e-20■□□□□ 10.1
CS-211ENST00000548041 CD109Q6YHK3 1445 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-211ENST00000548041 TEX14Q8IWB6 1497 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 PLEKHD1A6NEE1 506 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 TIAM1Q13009 1591 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 PREX2Q70Z35 1606 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-211ENST00000548041 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.77□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 RICTORQ6R327 1708 aa13.76□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 FANCAO15360 1455 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 NEO1Q92859 1461 aa13.73□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-211ENST00000548041 PLCH2O75038 1416 aa13.71□□□□□ -0.22
CS-211ENST00000548041 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms