RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547724.1

YAF2-211, Transcript of YY1 associated factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene YAF2, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YAF2-211ENST00000547724 IGF1RP08069 1367 aa43.18■■■■■ 4.5
YAF2-211ENST00000547724 KIF27Q86VH2 1401 aa43.17■■■■■ 4.5
YAF2-211ENST00000547724 CUL7Q14999 1698 aa43.16■■■■■ 4.5
YAF2-211ENST00000547724 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
YAF2-211ENST00000547724 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.12■■■■■ 4.49
YAF2-211ENST00000547724 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.08■■■■■ 4.49
YAF2-211ENST00000547724 MAPKBP1O60336 1514 aa43.01■■■■■ 4.48
YAF2-211ENST00000547724 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.99■■■■■ 4.47
YAF2-211ENST00000547724 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
YAF2-211ENST00000547724 DIP2BQ9P265 1576 aa42.94■■■■■ 4.46
YAF2-211ENST00000547724 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.93■■■■■ 4.46
YAF2-211ENST00000547724 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.89■■■■■ 4.46
YAF2-211ENST00000547724 PTPRGP23470 1445 aa42.75■■■■■ 4.43
YAF2-211ENST00000547724 IQGAP2Q13576 1575 aa42.73■■■■■ 4.43
YAF2-211ENST00000547724 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
YAF2-211ENST00000547724 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.66■■■■■ 4.42
YAF2-211ENST00000547724 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.65■■■■■ 4.42
YAF2-211ENST00000547724 TSPOAP1O95153 1857 aa42.65■■■■■ 4.42
YAF2-211ENST00000547724 KDM6BO15054 1643 aa42.6■■■■■ 4.41
YAF2-211ENST00000547724 ABCC2Q92887 1545 aa42.59■■■■■ 4.41
YAF2-211ENST00000547724 DISP1Q96F81 1524 aa42.55■■■■■ 4.4
YAF2-211ENST00000547724 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.49■■■■■ 4.39
YAF2-211ENST00000547724 ASXL2Q76L83 1435 aa42.47■■■■■ 4.39
YAF2-211ENST00000547724 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.46■■■■■ 4.39
YAF2-211ENST00000547724 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.43■■■■■ 4.38
YAF2-211ENST00000547724 UACAQ9BZF9 1416 aa42.43■■■■■ 4.38
YAF2-211ENST00000547724 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.4■■■■■ 4.38
YAF2-211ENST00000547724 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
YAF2-211ENST00000547724 GLI2P10070 1586 aa42.36■■■■■ 4.37
YAF2-211ENST00000547724 KIAA0556O60303 1618 aa42.36■■■■■ 4.37
YAF2-211ENST00000547724 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.3■■■■■ 4.36
YAF2-211ENST00000547724 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
YAF2-211ENST00000547724 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.23■■■■■ 4.35
YAF2-211ENST00000547724 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.22■■■■■ 4.35
YAF2-211ENST00000547724 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
YAF2-211ENST00000547724 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.17■■■■■ 4.34
YAF2-211ENST00000547724 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
YAF2-211ENST00000547724 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.03■■■■■ 4.32
YAF2-211ENST00000547724 PRXQ9BXM0 1461 aa42.02■■■■■ 4.32
YAF2-211ENST00000547724 GOLGA3Q08378 1498 aa42.01■■■■■ 4.32
YAF2-211ENST00000547724 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.99■■■■■ 4.31
YAF2-211ENST00000547724 ABCA8O94911 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
YAF2-211ENST00000547724 ADGRL1O94910 1474 aa41.9■■■■■ 4.3
YAF2-211ENST00000547724 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.79■■■■■ 4.28
YAF2-211ENST00000547724 CD109Q6YHK3 1445 aa41.76■■■■■ 4.28
YAF2-211ENST00000547724 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.74■■■■■ 4.27
YAF2-211ENST00000547724 KCNH8Q96L42 1107 aa41.74■■■■■ 4.27
YAF2-211ENST00000547724 P3H3Q8IVL6 736 aa41.66■■■■■ 4.26
YAF2-211ENST00000547724 ARID3CA6NKF2 412 aa41.65■■■■■ 4.26
YAF2-211ENST00000547724 SAMD9Q5K651 1589 aa41.61■■■■■ 4.25
YAF2-211ENST00000547724 ATP10BO94823 1461 aa41.59■■■■■ 4.25
YAF2-211ENST00000547724 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.56■■■■■ 4.24
YAF2-211ENST00000547724 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.48■■■■■ 4.23
YAF2-211ENST00000547724 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.45■■■■■ 4.23
YAF2-211ENST00000547724 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
YAF2-211ENST00000547724 KIF21BO75037 1637 aa41.44■■■■■ 4.22
YAF2-211ENST00000547724 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.42■■■■■ 4.22
YAF2-211ENST00000547724 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.42■■■■■ 4.22
YAF2-211ENST00000547724 EEA1Q15075 1411 aa41.35■■■■■ 4.21
YAF2-211ENST00000547724 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
YAF2-211ENST00000547724 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.33■■■■■ 4.21
YAF2-211ENST00000547724 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
YAF2-211ENST00000547724 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
YAF2-211ENST00000547724 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
YAF2-211ENST00000547724 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.22■■■■■ 4.19
YAF2-211ENST00000547724 NEO1Q92859 1461 aa41.21■■■■■ 4.19
YAF2-211ENST00000547724 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.18■■■■■ 4.18
YAF2-211ENST00000547724 RAPGEF3O95398 923 aa41.17■■■■■ 4.18
YAF2-211ENST00000547724 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
YAF2-211ENST00000547724 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.11■■■■■ 4.17
YAF2-211ENST00000547724 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.06■■■■■ 4.16
YAF2-211ENST00000547724 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.99■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.99■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 PTPRMP28827 1452 aa40.97■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.96■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.96■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 RICTORQ6R327 1708 aa40.96■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
YAF2-211ENST00000547724 FANCAO15360 1455 aa40.94■■■■■ 4.14
YAF2-211ENST00000547724 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.92■■■■■ 4.14
YAF2-211ENST00000547724 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
YAF2-211ENST00000547724 AKNAQ7Z591 1439 aa40.92■■■■■ 4.14
YAF2-211ENST00000547724 MADDQ8WXG6 1647 aa40.91■■■■■ 4.14
YAF2-211ENST00000547724 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.87■■■■■ 4.13
YAF2-211ENST00000547724 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
YAF2-211ENST00000547724 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.79■■■■■ 4.12
YAF2-211ENST00000547724 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 HECW1Q76N89 1606 aa40.75■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.74■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.73■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.72■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.72■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 FMN1Q68DA7 1419 aa40.7■■■■■ 4.11
YAF2-211ENST00000547724 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
YAF2-211ENST00000547724 PLCH2O75038 1416 aa40.67■■■■■ 4.1
YAF2-211ENST00000547724 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
YAF2-211ENST00000547724 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.64■■■■■ 4.1
YAF2-211ENST00000547724 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms