RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547724.1

YAF2-211, Transcript of YY1 associated factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene YAF2, Length 396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YAF2-211ENST00000547724 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.92■■■■■ 7.5
YAF2-211ENST00000547724 ABCC9O60706 1549 aa55.83■■■■■ 6.53
YAF2-211ENST00000547724 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.64■■■■■ 6.5
YAF2-211ENST00000547724 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.02■■■■■ 6.08
YAF2-211ENST00000547724 NACADO15069 1562 aa52.61■■■■■ 6.01
YAF2-211ENST00000547724 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.49■■■■■ 5.99
YAF2-211ENST00000547724 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.26■■■■■ 5.96
YAF2-211ENST00000547724 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.92■■■■■ 5.9
YAF2-211ENST00000547724 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.92■■■■■ 5.9
YAF2-211ENST00000547724 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.8■■■■■ 5.88
YAF2-211ENST00000547724 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.56■■■■■ 5.84
YAF2-211ENST00000547724 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.32■■■■■ 5.81
YAF2-211ENST00000547724 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.1■■■■■ 5.77
YAF2-211ENST00000547724 SCRIBQ14160 1630 aa50.76■■■■■ 5.72
YAF2-211ENST00000547724 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.74■■■■■ 5.71
YAF2-211ENST00000547724 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.43■■■■■ 5.66
YAF2-211ENST00000547724 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.28■■■■■ 5.64
YAF2-211ENST00000547724 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
YAF2-211ENST00000547724 NCAPD3P42695 1498 aa48.55■■■■■ 5.36
YAF2-211ENST00000547724 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.42■■■■■ 5.34
YAF2-211ENST00000547724 SMARCA4P51532 1647 aa48.37■■■■■ 5.33
YAF2-211ENST00000547724 SMARCA2P51531 1590 aa48.26■■■■■ 5.32
YAF2-211ENST00000547724 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.24■■■■■ 5.31
YAF2-211ENST00000547724 HMGXB3Q12766 1538 aa48.23■■■■■ 5.31
YAF2-211ENST00000547724 ERCC6Q03468 1493 aa48.18■■■■■ 5.3
YAF2-211ENST00000547724 CUX2O14529 1486 aa48.13■■■■■ 5.3
YAF2-211ENST00000547724 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
YAF2-211ENST00000547724 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.96■■■■■ 5.27
YAF2-211ENST00000547724 NESP48681 1621 aa47.94■■■■■ 5.26
YAF2-211ENST00000547724 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.87■■■■■ 5.25
YAF2-211ENST00000547724 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.75■■■■■ 5.23
YAF2-211ENST00000547724 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.51■■■■■ 5.2
YAF2-211ENST00000547724 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
YAF2-211ENST00000547724 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.33■■■■■ 5.17
YAF2-211ENST00000547724 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.2■■■■■ 5.15
YAF2-211ENST00000547724 WIZO95785 1651 aa47.18■■■■■ 5.14
YAF2-211ENST00000547724 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.07■■■■■ 5.13
YAF2-211ENST00000547724 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.87■■■■■ 5.09
YAF2-211ENST00000547724 WDR62O43379 1518 aa46.78■■■■■ 5.08
YAF2-211ENST00000547724 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
YAF2-211ENST00000547724 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.64■■■■■ 5.06
YAF2-211ENST00000547724 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.58■■■■■ 5.05
YAF2-211ENST00000547724 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
YAF2-211ENST00000547724 CFTRP13569 1480 aa46.52■■■■■ 5.04
YAF2-211ENST00000547724 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
YAF2-211ENST00000547724 TRIM41Q8WV44 630 aa46.12■■■■■ 4.97
YAF2-211ENST00000547724 PRDM2Q13029 1718 aa46.1■■■■■ 4.97
YAF2-211ENST00000547724 CCDC88BA6NC98 1476 aa46■■■■■ 4.95
YAF2-211ENST00000547724 OSCARQ8IYS5 282 aa45.82■■■■■ 4.93
YAF2-211ENST00000547724 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
YAF2-211ENST00000547724 TOPBP1Q92547 1522 aa45.7■■■■■ 4.91
YAF2-211ENST00000547724 IFT140Q96RY7 1462 aa45.69■■■■■ 4.91
YAF2-211ENST00000547724 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.51■■■■■ 4.88
YAF2-211ENST00000547724 ABCC8Q09428 1581 aa45.49■■■■■ 4.87
YAF2-211ENST00000547724 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
YAF2-211ENST00000547724 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
YAF2-211ENST00000547724 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
YAF2-211ENST00000547724 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.39■■■■■ 4.86
YAF2-211ENST00000547724 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
YAF2-211ENST00000547724 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.23■■■■■ 4.832e-8■■■■□ 24.7
YAF2-211ENST00000547724 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
YAF2-211ENST00000547724 ARHGEF11O15085 1522 aa45.22■■■■■ 4.83
YAF2-211ENST00000547724 CHD1O14646 1710 aa45.16■■■■■ 4.82
YAF2-211ENST00000547724 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.08■■■■■ 4.81
YAF2-211ENST00000547724 SOGA1O94964 1423 aa44.95■■■■■ 4.79
YAF2-211ENST00000547724 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
YAF2-211ENST00000547724 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.92■■■■■ 4.78
YAF2-211ENST00000547724 FBLN2P98095 1184 aa44.92■■■■■ 4.78
YAF2-211ENST00000547724 CUX1P39880 1505 aa44.88■■■■■ 4.78
YAF2-211ENST00000547724 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.82■■■■■ 4.77
YAF2-211ENST00000547724 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.8■■■■■ 4.76
YAF2-211ENST00000547724 ARAP1Q96P48 1450 aa44.78■■■■■ 4.76
YAF2-211ENST00000547724 WDR97A6NE52 1622 aa44.78■■■■■ 4.76
YAF2-211ENST00000547724 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
YAF2-211ENST00000547724 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.62■■■■■ 4.73
YAF2-211ENST00000547724 GRIN2BQ13224 1484 aa44.6■■■■■ 4.73
YAF2-211ENST00000547724 SYNJ1O43426 1573 aa44.53■■■■■ 4.72
YAF2-211ENST00000547724 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
YAF2-211ENST00000547724 PBRM1Q86U86 1689 aa44.49■■■■■ 4.71
YAF2-211ENST00000547724 SYNJ2O15056 1496 aa44.48■■■■■ 4.71
YAF2-211ENST00000547724 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
YAF2-211ENST00000547724 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.43■■■■■ 4.7
YAF2-211ENST00000547724 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.38■■■■■ 4.69
YAF2-211ENST00000547724 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.38■■■■■ 4.69
YAF2-211ENST00000547724 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
YAF2-211ENST00000547724 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.14■■■■■ 4.66
YAF2-211ENST00000547724 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.1■■■■■ 4.65
YAF2-211ENST00000547724 TOP2BQ02880 1626 aa44.09■■■■■ 4.65
YAF2-211ENST00000547724 ADAMTS12P58397 1594 aa44.07■■■■■ 4.65
YAF2-211ENST00000547724 GRIN2AQ12879 1464 aa44.06■■■■■ 4.64
YAF2-211ENST00000547724 CEP170Q5SW79 1584 aa43.96■■■■■ 4.63
YAF2-211ENST00000547724 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.96■■■■■ 4.63
YAF2-211ENST00000547724 NUP160Q12769 1436 aa43.91■■■■■ 4.62
YAF2-211ENST00000547724 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.85■■■■■ 4.61
YAF2-211ENST00000547724 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.8■■■■■ 4.6
YAF2-211ENST00000547724 SHROOM2Q13796 1616 aa43.77■■■■■ 4.6
YAF2-211ENST00000547724 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
YAF2-211ENST00000547724 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.46■■■■■ 4.55
YAF2-211ENST00000547724 JPH4Q96JJ6 628 aa43.38■■■■■ 4.53
YAF2-211ENST00000547724 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.27■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms