RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 CUL7Q14999 1698 aa35.7■■■■□ 3.31
CSRNP2-202ENST00000546935 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.64■■■■□ 3.3
CSRNP2-202ENST00000546935 CEP170Q5SW79 1584 aa35.64■■■■□ 3.3
CSRNP2-202ENST00000546935 GOLGA3Q08378 1498 aa35.63■■■■□ 3.29
CSRNP2-202ENST00000546935 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.63■■■■□ 3.29
CSRNP2-202ENST00000546935 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.59■■■■□ 3.29
CSRNP2-202ENST00000546935 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.56■■■■□ 3.28
CSRNP2-202ENST00000546935 SHROOM2Q13796 1616 aa35.52■■■■□ 3.28
CSRNP2-202ENST00000546935 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.41■■■■□ 3.26
CSRNP2-202ENST00000546935 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.35■■■■□ 3.25
CSRNP2-202ENST00000546935 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.32■■■■□ 3.24
CSRNP2-202ENST00000546935 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.28■■■■□ 3.24
CSRNP2-202ENST00000546935 JPH4Q96JJ6 628 aa35.24■■■■□ 3.23
CSRNP2-202ENST00000546935 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
CSRNP2-202ENST00000546935 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.21■■■■□ 3.23
CSRNP2-202ENST00000546935 CEP162Q5TB80 1403 aa35.13■■■■□ 3.21
CSRNP2-202ENST00000546935 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
CSRNP2-202ENST00000546935 IQGAP2Q13576 1575 aa35■■■■□ 3.19
CSRNP2-202ENST00000546935 CLIP1P30622 1438 aa34.98■■■■□ 3.19
CSRNP2-202ENST00000546935 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.9■■■■□ 3.18
CSRNP2-202ENST00000546935 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.87■■■■□ 3.17
CSRNP2-202ENST00000546935 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.86■■■■□ 3.17
CSRNP2-202ENST00000546935 SAMD9Q5K651 1589 aa34.83■■■■□ 3.17
CSRNP2-202ENST00000546935 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.83■■■■□ 3.17
CSRNP2-202ENST00000546935 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.79■■■■□ 3.16
CSRNP2-202ENST00000546935 PTPRGP23470 1445 aa34.78■■■■□ 3.16
CSRNP2-202ENST00000546935 MAPKBP1O60336 1514 aa34.76■■■■□ 3.15
CSRNP2-202ENST00000546935 DISP1Q96F81 1524 aa34.76■■■■□ 3.15
CSRNP2-202ENST00000546935 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
CSRNP2-202ENST00000546935 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
CSRNP2-202ENST00000546935 KIAA0556O60303 1618 aa34.66■■■■□ 3.14
CSRNP2-202ENST00000546935 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.65■■■■□ 3.14
CSRNP2-202ENST00000546935 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.64■■■■□ 3.14
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.6■■■■□ 3.13
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.59■■■■□ 3.13
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCC2Q92887 1545 aa34.59■■■■□ 3.13
CSRNP2-202ENST00000546935 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.57■■■■□ 3.13
CSRNP2-202ENST00000546935 UACAQ9BZF9 1416 aa34.56■■■■□ 3.12
CSRNP2-202ENST00000546935 DIP2BQ9P265 1576 aa34.51■■■■□ 3.12
CSRNP2-202ENST00000546935 FMN1Q68DA7 1419 aa34.47■■■■□ 3.11
CSRNP2-202ENST00000546935 P3H3Q8IVL6 736 aa34.47■■■■□ 3.11
CSRNP2-202ENST00000546935 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.45■■■■□ 3.1
CSRNP2-202ENST00000546935 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.42■■■■□ 3.1
CSRNP2-202ENST00000546935 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.4■■■■□ 3.1
CSRNP2-202ENST00000546935 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CSRNP2-202ENST00000546935 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.36■■■■□ 3.09
CSRNP2-202ENST00000546935 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.35■■■■□ 3.09
CSRNP2-202ENST00000546935 ASXL2Q76L83 1435 aa34.35■■■■□ 3.09
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCA8O94911 1581 aa34.32■■■■□ 3.09
CSRNP2-202ENST00000546935 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CSRNP2-202ENST00000546935 GLI2P10070 1586 aa34.3■■■■□ 3.08
CSRNP2-202ENST00000546935 MAP3K1Q13233 1512 aa34.26■■■■□ 3.08
CSRNP2-202ENST00000546935 HECW1Q76N89 1606 aa34.22■■■■□ 3.07
CSRNP2-202ENST00000546935 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.22■■■■□ 3.07
CSRNP2-202ENST00000546935 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.19■■■■□ 3.06
CSRNP2-202ENST00000546935 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.18■■■■□ 3.06
CSRNP2-202ENST00000546935 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CSRNP2-202ENST00000546935 TIAM1Q13009 1591 aa34.17■■■■□ 3.06
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.16■■■■□ 3.06
CSRNP2-202ENST00000546935 APLP2Q06481 763 aa34.11■■■■□ 3.05
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.09■■■■□ 3.05
CSRNP2-202ENST00000546935 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.08■■■■□ 3.05
CSRNP2-202ENST00000546935 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CSRNP2-202ENST00000546935 TSPOAP1O95153 1857 aa34.08■■■■□ 3.05
CSRNP2-202ENST00000546935 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CSRNP2-202ENST00000546935 KDM6BO15054 1643 aa34.04■■■■□ 3.04
CSRNP2-202ENST00000546935 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.01■■■■□ 3.03
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP10BO94823 1461 aa33.98■■■■□ 3.03
CSRNP2-202ENST00000546935 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.97■■■■□ 3.03
CSRNP2-202ENST00000546935 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
CSRNP2-202ENST00000546935 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
CSRNP2-202ENST00000546935 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
CSRNP2-202ENST00000546935 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.89■■■■□ 3.02
CSRNP2-202ENST00000546935 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.87■■■■□ 3.01
CSRNP2-202ENST00000546935 CD109Q6YHK3 1445 aa33.84■■■■□ 3.01
CSRNP2-202ENST00000546935 KCNH8Q96L42 1107 aa33.78■■■■□ 3
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.78■■■■□ 3
CSRNP2-202ENST00000546935 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.77■■■■□ 3
CSRNP2-202ENST00000546935 ARID3CA6NKF2 412 aa33.74■■■□□ 2.99
CSRNP2-202ENST00000546935 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CSRNP2-202ENST00000546935 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CSRNP2-202ENST00000546935 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CSRNP2-202ENST00000546935 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
CSRNP2-202ENST00000546935 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CSRNP2-202ENST00000546935 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.67■■■□□ 2.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CSRNP2-202ENST00000546935 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CSRNP2-202ENST00000546935 NCOA2Q15596 1464 aa33.63■■■□□ 2.97
CSRNP2-202ENST00000546935 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.63■■■□□ 2.97
CSRNP2-202ENST00000546935 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
CSRNP2-202ENST00000546935 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.61■■■□□ 2.97
CSRNP2-202ENST00000546935 NEO1Q92859 1461 aa33.58■■■□□ 2.97
CSRNP2-202ENST00000546935 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF14Q15058 1648 aa33.56■■■□□ 2.96
CSRNP2-202ENST00000546935 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.49■■■□□ 2.95
CSRNP2-202ENST00000546935 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.95
CSRNP2-202ENST00000546935 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 373.7 ms