RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545802.1

TSPAN11-203, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-203ENST00000545802 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.95■■■■■ 4.47
TSPAN11-203ENST00000545802 CHD1O14646 1710 aa42.94■■■■■ 4.47
TSPAN11-203ENST00000545802 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
TSPAN11-203ENST00000545802 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.92■■■■■ 4.46
TSPAN11-203ENST00000545802 CLIP1P30622 1438 aa42.89■■■■■ 4.46
TSPAN11-203ENST00000545802 CEP170Q5SW79 1584 aa42.89■■■■■ 4.46
TSPAN11-203ENST00000545802 IQGAP2Q13576 1575 aa42.82■■■■■ 4.44
TSPAN11-203ENST00000545802 JPH4Q96JJ6 628 aa42.68■■■■■ 4.42
TSPAN11-203ENST00000545802 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.67■■■■■ 4.42
TSPAN11-203ENST00000545802 OSCARQ8IYS5 282 aa42.65■■■■■ 4.42
TSPAN11-203ENST00000545802 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.65■■■■■ 4.42
TSPAN11-203ENST00000545802 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.63■■■■■ 4.41
TSPAN11-203ENST00000545802 P3H3Q8IVL6 736 aa42.56■■■■■ 4.4
TSPAN11-203ENST00000545802 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.54■■■■■ 4.4
TSPAN11-203ENST00000545802 SAMD9Q5K651 1589 aa42.54■■■■■ 4.4
TSPAN11-203ENST00000545802 ARAP1Q96P48 1450 aa42.52■■■■■ 4.4
TSPAN11-203ENST00000545802 DISP1Q96F81 1524 aa42.45■■■■■ 4.39
TSPAN11-203ENST00000545802 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.44■■■■■ 4.39
TSPAN11-203ENST00000545802 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.43■■■■■ 4.38
TSPAN11-203ENST00000545802 SHROOM2Q13796 1616 aa42.4■■■■■ 4.38
TSPAN11-203ENST00000545802 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.4■■■■■ 4.38
TSPAN11-203ENST00000545802 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
TSPAN11-203ENST00000545802 KIAA0556O60303 1618 aa42.37■■■■■ 4.37
TSPAN11-203ENST00000545802 FMN1Q68DA7 1419 aa42.3■■■■■ 4.36
TSPAN11-203ENST00000545802 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
TSPAN11-203ENST00000545802 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.11■■■■■ 4.33
TSPAN11-203ENST00000545802 PTPRGP23470 1445 aa42.09■■■■■ 4.33
TSPAN11-203ENST00000545802 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.09■■■■■ 4.33
TSPAN11-203ENST00000545802 APLP2Q06481 763 aa42.06■■■■■ 4.32
TSPAN11-203ENST00000545802 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
TSPAN11-203ENST00000545802 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.02■■■■■ 4.32
TSPAN11-203ENST00000545802 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
TSPAN11-203ENST00000545802 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.91■■■■■ 4.3
TSPAN11-203ENST00000545802 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.87■■■■■ 4.29
TSPAN11-203ENST00000545802 HECW1Q76N89 1606 aa41.84■■■■■ 4.29
TSPAN11-203ENST00000545802 ABCA8O94911 1581 aa41.84■■■■■ 4.29
TSPAN11-203ENST00000545802 MAP3K1Q13233 1512 aa41.83■■■■■ 4.29
TSPAN11-203ENST00000545802 UACAQ9BZF9 1416 aa41.82■■■■■ 4.29
TSPAN11-203ENST00000545802 ARHGEF11O15085 1522 aa41.81■■■■■ 4.28
TSPAN11-203ENST00000545802 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
TSPAN11-203ENST00000545802 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
TSPAN11-203ENST00000545802 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.75■■■■■ 4.27
TSPAN11-203ENST00000545802 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
TSPAN11-203ENST00000545802 TIAM1Q13009 1591 aa41.74■■■■■ 4.27
TSPAN11-203ENST00000545802 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
TSPAN11-203ENST00000545802 ARID3CA6NKF2 412 aa41.68■■■■■ 4.26
TSPAN11-203ENST00000545802 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
TSPAN11-203ENST00000545802 ABCC2Q92887 1545 aa41.66■■■■■ 4.26
TSPAN11-203ENST00000545802 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.66■■■■■ 4.26
TSPAN11-203ENST00000545802 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.64■■■■■ 4.26
TSPAN11-203ENST00000545802 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.62■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.6■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 ATP10BO94823 1461 aa41.59■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
TSPAN11-203ENST00000545802 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.53■■■■■ 4.24
TSPAN11-203ENST00000545802 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.51■■■■■ 4.23
TSPAN11-203ENST00000545802 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN11-203ENST00000545802 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPAN11-203ENST00000545802 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.45■■■■■ 4.23
TSPAN11-203ENST00000545802 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.41■■■■■ 4.22
TSPAN11-203ENST00000545802 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.39■■■■■ 4.22
TSPAN11-203ENST00000545802 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
TSPAN11-203ENST00000545802 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
TSPAN11-203ENST00000545802 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
TSPAN11-203ENST00000545802 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
TSPAN11-203ENST00000545802 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.25■■■■■ 4.19
TSPAN11-203ENST00000545802 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
TSPAN11-203ENST00000545802 NCOA2Q15596 1464 aa41.22■■■■■ 4.19
TSPAN11-203ENST00000545802 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.16■■■■■ 4.18
TSPAN11-203ENST00000545802 ASXL2Q76L83 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
TSPAN11-203ENST00000545802 KCNH8Q96L42 1107 aa41.1■■■■■ 4.17
TSPAN11-203ENST00000545802 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.08■■■■■ 4.17
TSPAN11-203ENST00000545802 KIF14Q15058 1648 aa41.07■■■■■ 4.17
TSPAN11-203ENST00000545802 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.04■■■■■ 4.16
TSPAN11-203ENST00000545802 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.03■■■■■ 4.16
TSPAN11-203ENST00000545802 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
TSPAN11-203ENST00000545802 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.99■■■■■ 4.15
TSPAN11-203ENST00000545802 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.97■■■■■ 4.15
TSPAN11-203ENST00000545802 MAPKBP1O60336 1514 aa40.96■■■■■ 4.15
TSPAN11-203ENST00000545802 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.94■■■■■ 4.14
TSPAN11-203ENST00000545802 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
TSPAN11-203ENST00000545802 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TSPAN11-203ENST00000545802 MIA2Q96PC5 1412 aa40.91■■■■■ 4.14
TSPAN11-203ENST00000545802 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
TSPAN11-203ENST00000545802 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
TSPAN11-203ENST00000545802 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.13
TSPAN11-203ENST00000545802 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.81■■■■■ 4.12
TSPAN11-203ENST00000545802 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.8■■■■■ 4.12
TSPAN11-203ENST00000545802 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.76■■■■■ 4.12
TSPAN11-203ENST00000545802 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.75■■■■■ 4.11
TSPAN11-203ENST00000545802 PLCH2O75038 1416 aa40.75■■■■■ 4.11
TSPAN11-203ENST00000545802 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.74■■■■■ 4.11
TSPAN11-203ENST00000545802 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
TSPAN11-203ENST00000545802 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
TSPAN11-203ENST00000545802 PREX2Q70Z35 1606 aa40.69■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms