RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545671.5

MMP17-210, Transcript of matrix metallopeptidase 17, humanhuman

TSL 3

Gene MMP17, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17-210ENST00000545671 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.49■■■■■ 4.23
MMP17-210ENST00000545671 ARAP1Q96P48 1450 aa41.45■■■■■ 4.23
MMP17-210ENST00000545671 PRXQ9BXM0 1461 aa41.44■■■■■ 4.22
MMP17-210ENST00000545671 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.42■■■■■ 4.22
MMP17-210ENST00000545671 JPH4Q96JJ6 628 aa41.34■■■■■ 4.21
MMP17-210ENST00000545671 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.32■■■■■ 4.21
MMP17-210ENST00000545671 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.28■■■■■ 4.2
MMP17-210ENST00000545671 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
MMP17-210ENST00000545671 IQGAP2Q13576 1575 aa41.26■■■■■ 4.2
MMP17-210ENST00000545671 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.17■■■■■ 4.18
MMP17-210ENST00000545671 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.08■■■■■ 4.17
MMP17-210ENST00000545671 KIF21BO75037 1637 aa41.08■■■■■ 4.17
MMP17-210ENST00000545671 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.02■■■■■ 4.16
MMP17-210ENST00000545671 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
MMP17-210ENST00000545671 DISP1Q96F81 1524 aa40.94■■■■■ 4.14
MMP17-210ENST00000545671 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.87■■■■■ 4.13
MMP17-210ENST00000545671 KIAA0556O60303 1618 aa40.87■■■■■ 4.13
MMP17-210ENST00000545671 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
MMP17-210ENST00000545671 GOLGA3Q08378 1498 aa40.85■■■■■ 4.13
MMP17-210ENST00000545671 PTPRGP23470 1445 aa40.8■■■■■ 4.12
MMP17-210ENST00000545671 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.67■■■■■ 4.1
MMP17-210ENST00000545671 SAMD9Q5K651 1589 aa40.66■■■■■ 4.1
MMP17-210ENST00000545671 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.61■■■■■ 4.09
MMP17-210ENST00000545671 UACAQ9BZF9 1416 aa40.57■■■■■ 4.08
MMP17-210ENST00000545671 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.53■■■■■ 4.08
MMP17-210ENST00000545671 ABCC2Q92887 1545 aa40.52■■■■■ 4.08
MMP17-210ENST00000545671 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
MMP17-210ENST00000545671 MAPKBP1O60336 1514 aa40.5■■■■■ 4.07
MMP17-210ENST00000545671 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.07
MMP17-210ENST00000545671 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
MMP17-210ENST00000545671 ABCA8O94911 1581 aa40.43■■■■■ 4.06
MMP17-210ENST00000545671 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.38■■■■■ 4.06
MMP17-210ENST00000545671 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.38■■■■■ 4.05
MMP17-210ENST00000545671 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.32■■■■■ 4.05
MMP17-210ENST00000545671 P3H3Q8IVL6 736 aa40.3■■■■■ 4.04
MMP17-210ENST00000545671 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.29■■■■■ 4.04
MMP17-210ENST00000545671 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.24■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.23■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.21■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.2■■■■■ 4.03
MMP17-210ENST00000545671 DIP2BQ9P265 1576 aa40.18■■■■■ 4.02
MMP17-210ENST00000545671 ASXL2Q76L83 1435 aa40.16■■■■■ 4.02
MMP17-210ENST00000545671 FMN1Q68DA7 1419 aa40.11■■■■■ 4.01
MMP17-210ENST00000545671 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
MMP17-210ENST00000545671 GLI2P10070 1586 aa40.03■■■■■ 4
MMP17-210ENST00000545671 ATP10BO94823 1461 aa40.03■■■■■ 4
MMP17-210ENST00000545671 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.02■■■■■ 4
MMP17-210ENST00000545671 CLIP1P30622 1438 aa40■■■■□ 3.99
MMP17-210ENST00000545671 FAM69CQ0P6D2 419 aa40■■■■□ 3.99
MMP17-210ENST00000545671 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
MMP17-210ENST00000545671 HECW1Q76N89 1606 aa39.91■■■■□ 3.98
MMP17-210ENST00000545671 CEP162Q5TB80 1403 aa39.85■■■■□ 3.97
MMP17-210ENST00000545671 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.81■■■■□ 3.96
MMP17-210ENST00000545671 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.79■■■■□ 3.96
MMP17-210ENST00000545671 ARID3CA6NKF2 412 aa39.78■■■■□ 3.96
MMP17-210ENST00000545671 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.76■■■■□ 3.96
MMP17-210ENST00000545671 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.73■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.73■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 TSPOAP1O95153 1857 aa39.71■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
MMP17-210ENST00000545671 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.67■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.66■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.65■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 KCNH8Q96L42 1107 aa39.64■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.63■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.63■■■■□ 3.94
MMP17-210ENST00000545671 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.62■■■■□ 3.93
MMP17-210ENST00000545671 CD109Q6YHK3 1445 aa39.59■■■■□ 3.93
MMP17-210ENST00000545671 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
MMP17-210ENST00000545671 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
MMP17-210ENST00000545671 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
MMP17-210ENST00000545671 KDM6BO15054 1643 aa39.47■■■■□ 3.91
MMP17-210ENST00000545671 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.913e-6■■■■□ 26.1
MMP17-210ENST00000545671 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
MMP17-210ENST00000545671 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.41■■■■□ 3.9
MMP17-210ENST00000545671 KIF14Q15058 1648 aa39.4■■■■□ 3.9
MMP17-210ENST00000545671 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.38■■■■□ 3.89
MMP17-210ENST00000545671 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.37■■■■□ 3.89
MMP17-210ENST00000545671 NEO1Q92859 1461 aa39.33■■■■□ 3.89
MMP17-210ENST00000545671 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.29■■■■□ 3.88
MMP17-210ENST00000545671 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.27■■■■□ 3.88
MMP17-210ENST00000545671 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
MMP17-210ENST00000545671 PLCH2O75038 1416 aa39.24■■■■□ 3.87
MMP17-210ENST00000545671 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.24■■■■□ 3.87
MMP17-210ENST00000545671 FANCAO15360 1455 aa39.19■■■■□ 3.86
MMP17-210ENST00000545671 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.18■■■■□ 3.86
MMP17-210ENST00000545671 MAP3K1Q13233 1512 aa39.17■■■■□ 3.86
MMP17-210ENST00000545671 TIAM1Q13009 1591 aa39.16■■■■□ 3.86
MMP17-210ENST00000545671 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.15■■■■□ 3.86
MMP17-210ENST00000545671 AKNAQ7Z591 1439 aa39.1■■■■□ 3.85
MMP17-210ENST00000545671 PREX2Q70Z35 1606 aa39.09■■■■□ 3.85
MMP17-210ENST00000545671 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.04■■■■□ 3.84
MMP17-210ENST00000545671 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.03■■■■□ 3.84
MMP17-210ENST00000545671 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.4 ms