RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 JPH4Q96JJ6 628 aa28.66■■■□□ 2.18
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CLSTN3-216ENST00000545663 TSPOAP1O95153 1857 aa28.57■■■□□ 2.16
CLSTN3-216ENST00000545663 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.53■■■□□ 2.16
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CLSTN3-216ENST00000545663 ADGRL1O94910 1474 aa28.5■■■□□ 2.15
CLSTN3-216ENST00000545663 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.45■■■□□ 2.14
CLSTN3-216ENST00000545663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3-216ENST00000545663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.35■■■□□ 2.13
CLSTN3-216ENST00000545663 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 FBXO41Q8TF61 875 aa28.24■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 TOP2BQ02880 1626 aa28.24■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.21■■■□□ 2.11
CLSTN3-216ENST00000545663 ASXL2Q76L83 1435 aa28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3-216ENST00000545663 PTPRGP23470 1445 aa28.14■■■□□ 2.1
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CLSTN3-216ENST00000545663 GLI2P10070 1586 aa28.1■■■□□ 2.09
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCC2Q92887 1545 aa28.08■■■□□ 2.09
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CLSTN3-216ENST00000545663 IGF1RP08069 1367 aa27.93■■■□□ 2.06
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.92■■■□□ 2.06
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CLSTN3-216ENST00000545663 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.83■■■□□ 2.04
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CLSTN3-216ENST00000545663 CD109Q6YHK3 1445 aa27.64■■■□□ 2.02
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CLSTN3-216ENST00000545663 ABCA8O94911 1581 aa27.27■■□□□ 1.96
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CLSTN3-216ENST00000545663 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.16■■□□□ 1.94
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CLSTN3-216ENST00000545663 NEO1Q92859 1461 aa27.09■■□□□ 1.93
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.02■■□□□ 1.92
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CLSTN3-216ENST00000545663 P3H3Q8IVL6 736 aa27.02■■□□□ 1.92
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CLSTN3-216ENST00000545663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.88■■□□□ 1.89
CLSTN3-216ENST00000545663 STRCQ7RTU9 1775 aa26.87■■□□□ 1.89
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CLSTN3-216ENST00000545663 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.84■■□□□ 1.89
CLSTN3-216ENST00000545663 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.83■■□□□ 1.89
CLSTN3-216ENST00000545663 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.82■■□□□ 1.88
CLSTN3-216ENST00000545663 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.79■■□□□ 1.88
CLSTN3-216ENST00000545663 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.77■■□□□ 1.88
CLSTN3-216ENST00000545663 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.75■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.73■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 HECW1Q76N89 1606 aa26.72■■□□□ 1.87
CLSTN3-216ENST00000545663 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.72■■□□□ 1.87
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