RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD8-204ENST00000544999 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD8-204ENST00000544999 JPH4Q96JJ6 628 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXD8-204ENST00000544999 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD8-204ENST00000544999 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
HOXD8-204ENST00000544999 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXD8-204ENST00000544999 IQGAP2Q13576 1575 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXD8-204ENST00000544999 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXD8-204ENST00000544999 PRXQ9BXM0 1461 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXD8-204ENST00000544999 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.55■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 PTPRGP23470 1445 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 DISP1Q96F81 1524 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXD8-204ENST00000544999 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
HOXD8-204ENST00000544999 EEA1Q15075 1411 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXD8-204ENST00000544999 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXD8-204ENST00000544999 MAPKBP1O60336 1514 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXD8-204ENST00000544999 KIAA0556O60303 1618 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXD8-204ENST00000544999 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
HOXD8-204ENST00000544999 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.39■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 GOLGA3Q08378 1498 aa28.36■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 UACAQ9BZF9 1416 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC2Q92887 1545 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXD8-204ENST00000544999 DIP2BQ9P265 1576 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-204ENST00000544999 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-204ENST00000544999 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-204ENST00000544999 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXD8-204ENST00000544999 KIF21BO75037 1637 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXD8-204ENST00000544999 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXD8-204ENST00000544999 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXD8-204ENST00000544999 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
HOXD8-204ENST00000544999 ABCA8O94911 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXD8-204ENST00000544999 SAMD9Q5K651 1589 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD8-204ENST00000544999 GLI2P10070 1586 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXD8-204ENST00000544999 P3H3Q8IVL6 736 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD8-204ENST00000544999 TSPOAP1O95153 1857 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD8-204ENST00000544999 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD8-204ENST00000544999 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28■■■□□ 2.07
HOXD8-204ENST00000544999 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXD8-204ENST00000544999 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD8-204ENST00000544999 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 KDM6BO15054 1643 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 ATP10BO94823 1461 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD8-204ENST00000544999 ARID3CA6NKF2 412 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD8-204ENST00000544999 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD8-204ENST00000544999 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXD8-204ENST00000544999 KCNH8Q96L42 1107 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXD8-204ENST00000544999 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXD8-204ENST00000544999 CD109Q6YHK3 1445 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-204ENST00000544999 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-204ENST00000544999 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-204ENST00000544999 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-204ENST00000544999 FMN1Q68DA7 1419 aa27.7■■■□□ 2.03
HOXD8-204ENST00000544999 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD8-204ENST00000544999 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD8-204ENST00000544999 HECW1Q76N89 1606 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD8-204ENST00000544999 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXD8-204ENST00000544999 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.53■■■□□ 2
HOXD8-204ENST00000544999 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
HOXD8-204ENST00000544999 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.51■■■□□ 2
HOXD8-204ENST00000544999 NEO1Q92859 1461 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD8-204ENST00000544999 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
HOXD8-204ENST00000544999 CLIP1P30622 1438 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD8-204ENST00000544999 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
HOXD8-204ENST00000544999 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.45■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.44■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 FANCAO15360 1455 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 KIF14Q15058 1648 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 AKNAQ7Z591 1439 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXD8-204ENST00000544999 PLCH2O75038 1416 aa27.33■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 RAPGEF3O95398 923 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRL1O94910 1474 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 CEP162Q5TB80 1403 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXD8-204ENST00000544999 RICTORQ6R327 1708 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXD8-204ENST00000544999 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXD8-204ENST00000544999 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms