RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
LTBR-211ENST00000543190 JPH4Q96JJ6 628 aa32.75■■■□□ 2.83
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.68■■■□□ 2.82
LTBR-211ENST00000543190 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.56■■■□□ 2.8
LTBR-211ENST00000543190 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.5■■■□□ 2.79
LTBR-211ENST00000543190 MAPKBP1O60336 1514 aa32.49■■■□□ 2.79
LTBR-211ENST00000543190 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.44■■■□□ 2.78
LTBR-211ENST00000543190 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.38■■■□□ 2.77
LTBR-211ENST00000543190 IQGAP2Q13576 1575 aa32.35■■■□□ 2.77
LTBR-211ENST00000543190 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.3■■■□□ 2.76
LTBR-211ENST00000543190 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.3■■■□□ 2.76
LTBR-211ENST00000543190 DIP2BQ9P265 1576 aa32.3■■■□□ 2.76
LTBR-211ENST00000543190 PTPRGP23470 1445 aa32.26■■■□□ 2.75
LTBR-211ENST00000543190 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.25■■■□□ 2.75
LTBR-211ENST00000543190 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.25■■■□□ 2.75
LTBR-211ENST00000543190 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.21■■■□□ 2.75
LTBR-211ENST00000543190 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.19■■■□□ 2.74
LTBR-211ENST00000543190 DISP1Q96F81 1524 aa32.19■■■□□ 2.74
LTBR-211ENST00000543190 ABCC2Q92887 1545 aa32.17■■■□□ 2.74
LTBR-211ENST00000543190 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.17■■■□□ 2.74
LTBR-211ENST00000543190 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.07■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 UACAQ9BZF9 1416 aa32.06■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0556O60303 1618 aa32.05■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.04■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 GLI2P10070 1586 aa32.04■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.02■■■□□ 2.72
LTBR-211ENST00000543190 PRXQ9BXM0 1461 aa32.01■■■□□ 2.71
LTBR-211ENST00000543190 ASXL2Q76L83 1435 aa31.98■■■□□ 2.71
LTBR-211ENST00000543190 TSPOAP1O95153 1857 aa31.96■■■□□ 2.71
LTBR-211ENST00000543190 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
LTBR-211ENST00000543190 KDM6BO15054 1643 aa31.94■■■□□ 2.7
LTBR-211ENST00000543190 GOLGA3Q08378 1498 aa31.91■■■□□ 2.7
LTBR-211ENST00000543190 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
LTBR-211ENST00000543190 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.83■■■□□ 2.69
LTBR-211ENST00000543190 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
LTBR-211ENST00000543190 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
LTBR-211ENST00000543190 ABCA8O94911 1581 aa31.79■■■□□ 2.68
LTBR-211ENST00000543190 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.72■■■□□ 2.67
LTBR-211ENST00000543190 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.69■■■□□ 2.66
LTBR-211ENST00000543190 EEA1Q15075 1411 aa31.68■■■□□ 2.66
LTBR-211ENST00000543190 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.63■■■□□ 2.65
LTBR-211ENST00000543190 SAMD9Q5K651 1589 aa31.63■■■□□ 2.65
LTBR-211ENST00000543190 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.62■■■□□ 2.65
LTBR-211ENST00000543190 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
LTBR-211ENST00000543190 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.57■■■□□ 2.64
LTBR-211ENST00000543190 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.52■■■□□ 2.64
LTBR-211ENST00000543190 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
LTBR-211ENST00000543190 CD109Q6YHK3 1445 aa31.47■■■□□ 2.63
LTBR-211ENST00000543190 ATP10BO94823 1461 aa31.46■■■□□ 2.63
LTBR-211ENST00000543190 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.42■■■□□ 2.62
LTBR-211ENST00000543190 KIF21BO75037 1637 aa31.42■■■□□ 2.62
LTBR-211ENST00000543190 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.38■■■□□ 2.61
LTBR-211ENST00000543190 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.34■■■□□ 2.61
LTBR-211ENST00000543190 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.32■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 KCNH8Q96L42 1107 aa31.32■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.32■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 ADGRL1O94910 1474 aa31.32■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 P3H3Q8IVL6 736 aa31.3■■■□□ 2.6
LTBR-211ENST00000543190 NEO1Q92859 1461 aa31.21■■■□□ 2.59
LTBR-211ENST00000543190 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.2■■■□□ 2.59
LTBR-211ENST00000543190 ARID3CA6NKF2 412 aa31.1■■■□□ 2.57
LTBR-211ENST00000543190 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.06■■■□□ 2.56
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.03■■■□□ 2.56
LTBR-211ENST00000543190 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.02■■■□□ 2.56
LTBR-211ENST00000543190 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.01■■■□□ 2.56
LTBR-211ENST00000543190 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
LTBR-211ENST00000543190 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
LTBR-211ENST00000543190 FMN1Q68DA7 1419 aa30.99■■■□□ 2.55
LTBR-211ENST00000543190 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.555e-7■■■■■ 32.7
LTBR-211ENST00000543190 RICTORQ6R327 1708 aa30.96■■■□□ 2.55
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.95■■■□□ 2.55
LTBR-211ENST00000543190 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.93■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.93■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 HECW1Q76N89 1606 aa30.93■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 FANCAO15360 1455 aa30.91■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 RAPGEF3O95398 923 aa30.91■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 AKNAQ7Z591 1439 aa30.9■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
LTBR-211ENST00000543190 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.53
LTBR-211ENST00000543190 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.88■■■□□ 2.53
LTBR-211ENST00000543190 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.88■■■□□ 2.53
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.87■■■□□ 2.53
LTBR-211ENST00000543190 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
LTBR-211ENST00000543190 PLCH2O75038 1416 aa30.82■■■□□ 2.52
LTBR-211ENST00000543190 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.8■■■□□ 2.52
LTBR-211ENST00000543190 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.78■■■□□ 2.52
LTBR-211ENST00000543190 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
LTBR-211ENST00000543190 PTPRMP28827 1452 aa30.76■■■□□ 2.51
LTBR-211ENST00000543190 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.76■■■□□ 2.51
LTBR-211ENST00000543190 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
LTBR-211ENST00000543190 KIF14Q15058 1648 aa30.71■■■□□ 2.51
LTBR-211ENST00000543190 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.69■■■□□ 2.5
LTBR-211ENST00000543190 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.68■■■□□ 2.5
LTBR-211ENST00000543190 MADDQ8WXG6 1647 aa30.68■■■□□ 2.5
LTBR-211ENST00000543190 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.66■■■□□ 2.5
LTBR-211ENST00000543190 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.65■■■□□ 2.5
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