RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH1-208ENST00000543175 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
PTRH1-208ENST00000543175 JPH4Q96JJ6 628 aa41.1■■■■■ 4.17
PTRH1-208ENST00000543175 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.01■■■■■ 4.16
PTRH1-208ENST00000543175 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.93■■■■■ 4.14
PTRH1-208ENST00000543175 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.74■■■■■ 4.11
PTRH1-208ENST00000543175 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.72■■■■■ 4.11
PTRH1-208ENST00000543175 IQGAP2Q13576 1575 aa40.72■■■■■ 4.11
PTRH1-208ENST00000543175 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.64■■■■■ 4.1
PTRH1-208ENST00000543175 MAPKBP1O60336 1514 aa40.61■■■■■ 4.09
PTRH1-208ENST00000543175 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.58■■■■■ 4.09
PTRH1-208ENST00000543175 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
PTRH1-208ENST00000543175 PTPRGP23470 1445 aa40.52■■■■■ 4.08
PTRH1-208ENST00000543175 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.5■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.49■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 DIP2BQ9P265 1576 aa40.46■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.46■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 DISP1Q96F81 1524 aa40.46■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.45■■■■■ 4.07
PTRH1-208ENST00000543175 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
PTRH1-208ENST00000543175 KIAA0556O60303 1618 aa40.35■■■■■ 4.05
PTRH1-208ENST00000543175 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.35■■■■■ 4.05
PTRH1-208ENST00000543175 ABCC2Q92887 1545 aa40.32■■■■■ 4.05
PTRH1-208ENST00000543175 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.3■■■■■ 4.04
PTRH1-208ENST00000543175 PRXQ9BXM0 1461 aa40.3■■■■■ 4.04
PTRH1-208ENST00000543175 UACAQ9BZF9 1416 aa40.25■■■■■ 4.03
PTRH1-208ENST00000543175 TSPOAP1O95153 1857 aa40.2■■■■■ 4.03
PTRH1-208ENST00000543175 ASXL2Q76L83 1435 aa40.13■■■■■ 4.01
PTRH1-208ENST00000543175 GOLGA3Q08378 1498 aa40.13■■■■■ 4.01
PTRH1-208ENST00000543175 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.13■■■■■ 4.01
PTRH1-208ENST00000543175 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.11■■■■■ 4.01
PTRH1-208ENST00000543175 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
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PTRH1-208ENST00000543175 KDM6BO15054 1643 aa40.03■■■■■ 4
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PTRH1-208ENST00000543175 ABCA8O94911 1581 aa39.95■■■■□ 3.99
PTRH1-208ENST00000543175 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
PTRH1-208ENST00000543175 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
PTRH1-208ENST00000543175 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.89■■■■□ 3.98
PTRH1-208ENST00000543175 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.82■■■■□ 3.97
PTRH1-208ENST00000543175 SAMD9Q5K651 1589 aa39.82■■■■□ 3.97
PTRH1-208ENST00000543175 KIF21BO75037 1637 aa39.69■■■■□ 3.94
PTRH1-208ENST00000543175 P3H3Q8IVL6 736 aa39.69■■■■□ 3.94
PTRH1-208ENST00000543175 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.68■■■■□ 3.94
PTRH1-208ENST00000543175 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.67■■■■□ 3.94
PTRH1-208ENST00000543175 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
PTRH1-208ENST00000543175 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.6■■■■□ 3.93
PTRH1-208ENST00000543175 ATP10BO94823 1461 aa39.56■■■■□ 3.92
PTRH1-208ENST00000543175 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
PTRH1-208ENST00000543175 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.51■■■■□ 3.92
PTRH1-208ENST00000543175 KCNH8Q96L42 1107 aa39.51■■■■□ 3.92
PTRH1-208ENST00000543175 CD109Q6YHK3 1445 aa39.5■■■■□ 3.91
PTRH1-208ENST00000543175 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.49■■■■□ 3.91
PTRH1-208ENST00000543175 ARID3CA6NKF2 412 aa39.48■■■■□ 3.91
PTRH1-208ENST00000543175 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.47■■■■□ 3.91
PTRH1-208ENST00000543175 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.47■■■■□ 3.91
PTRH1-208ENST00000543175 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
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PTRH1-208ENST00000543175 ADGRL1O94910 1474 aa39.21■■■■□ 3.87
PTRH1-208ENST00000543175 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.2■■■■□ 3.87
PTRH1-208ENST00000543175 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.19■■■■□ 3.86
PTRH1-208ENST00000543175 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.11■■■■□ 3.85
PTRH1-208ENST00000543175 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.1■■■■□ 3.85
PTRH1-208ENST00000543175 NEO1Q92859 1461 aa39.09■■■■□ 3.85
PTRH1-208ENST00000543175 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.08■■■■□ 3.85
PTRH1-208ENST00000543175 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
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PTRH1-208ENST00000543175 HECW1Q76N89 1606 aa39.04■■■■□ 3.84
PTRH1-208ENST00000543175 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39■■■■□ 3.83
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PTRH1-208ENST00000543175 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.96■■■■□ 3.83
PTRH1-208ENST00000543175 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.95■■■■□ 3.83
PTRH1-208ENST00000543175 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.87■■■■□ 3.81
PTRH1-208ENST00000543175 RAPGEF3O95398 923 aa38.87■■■■□ 3.81
PTRH1-208ENST00000543175 FANCAO15360 1455 aa38.86■■■■□ 3.81
PTRH1-208ENST00000543175 RICTORQ6R327 1708 aa38.86■■■■□ 3.81
PTRH1-208ENST00000543175 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
PTRH1-208ENST00000543175 AKNAQ7Z591 1439 aa38.81■■■■□ 3.8
PTRH1-208ENST00000543175 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
PTRH1-208ENST00000543175 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.78■■■■□ 3.8
PTRH1-208ENST00000543175 KIF14Q15058 1648 aa38.74■■■■□ 3.79
PTRH1-208ENST00000543175 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
PTRH1-208ENST00000543175 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
PTRH1-208ENST00000543175 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.73■■■■□ 3.79
PTRH1-208ENST00000543175 PLCH2O75038 1416 aa38.72■■■■□ 3.79
PTRH1-208ENST00000543175 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.68■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.68■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.66■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.64■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 CLIP1P30622 1438 aa38.63■■■■□ 3.78
PTRH1-208ENST00000543175 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.63■■■■□ 3.77
PTRH1-208ENST00000543175 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.61■■■■□ 3.77
PTRH1-208ENST00000543175 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.57■■■■□ 3.76
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