RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.64■■□□□ 1.69
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.61■■□□□ 1.69
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.59■■□□□ 1.69
DKFZP434K028-202ENST00000536405 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TIAM1Q13009 1591 aa25.56■■□□□ 1.68
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.49■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MAP3K1Q13233 1512 aa25.48■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.48■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ITGAEP38570 1179 aa25.47■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NEUROD1Q13562 356 aa25.47■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.47■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PBRM1Q86U86 1689 aa25.46■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WDR62O43379 1518 aa25.42■■□□□ 1.66
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERCC6Q03468 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.4■■□□□ 1.66
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.4■■□□□ 1.66
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.39■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.38■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 IFT140Q96RY7 1462 aa25.37■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SAMD9Q5K651 1589 aa25.37■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GRIN2BQ13224 1484 aa25.36■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FMN1Q68DA7 1419 aa25.36■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ADAMTS12P58397 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.33■■□□□ 1.65
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.24■■□□□ 1.63
DKFZP434K028-202ENST00000536405 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
DKFZP434K028-202ENST00000536405 IQGAP2Q13576 1575 aa25.23■■□□□ 1.63
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.2■■□□□ 1.62
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.19■■□□□ 1.62
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.15■■□□□ 1.62
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARID3CA6NKF2 412 aa25.13■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MIER1Q8N108 512 aa25.12■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GRIN2AQ12879 1464 aa25.11■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FBLN2P98095 1184 aa25.1■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.09■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.08■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.07■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.07■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.07■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.06■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NCOA2Q15596 1464 aa25.05■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DISP1Q96F81 1524 aa25.02■■□□□ 1.6
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 HECW1Q76N89 1606 aa24.99■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SYNJ2O15056 1496 aa24.98■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.98■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.98■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIAA0556O60303 1618 aa24.97■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.97■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CEP170Q5SW79 1584 aa24.97■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PTPRKQ15262 1439 aa24.95■■□□□ 1.59
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MAPKBP1O60336 1514 aa24.94■■□□□ 1.58
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARHGEF11O15085 1522 aa24.9■■□□□ 1.58
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MYT1Q01538 1121 aa24.9■■□□□ 1.58
DKFZP434K028-202ENST00000536405 JPH4Q96JJ6 628 aa24.87■■□□□ 1.57
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.86■■□□□ 1.57
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.85■■□□□ 1.57
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NUP160Q12769 1436 aa24.83■■□□□ 1.57
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.81■■□□□ 1.56
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.8■■□□□ 1.56
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.79■■□□□ 1.56
DKFZP434K028-202ENST00000536405 HFM1A2PYH4 1435 aa24.77■■□□□ 1.56
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.76■■□□□ 1.55
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NAIPQ13075 1403 aa24.75■■□□□ 1.55
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MIA2Q96PC5 1412 aa24.68■■□□□ 1.54
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UACAQ9BZF9 1416 aa24.64■■□□□ 1.54
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KDM6BO15054 1643 aa24.59■■□□□ 1.53
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHD1O14646 1710 aa24.59■■□□□ 1.53
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIF14Q15058 1648 aa24.56■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIM52Q96A61 297 aa24.56■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCA8O94911 1581 aa24.55■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DAPK1P53355 1430 aa24.54■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCC5O15440 1437 aa24.54■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms