RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536405.5

DKFZP434K028-202, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DKFZP434K028, Length 2,466 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.88■■■■□ 3.49
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.77■■■□□ 2.52
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 SCRIBQ14160 1630 aa29.55■■■□□ 2.32
DKFZP434K028-202ENST00000536405 NACADO15069 1562 aa29.38■■■□□ 2.29
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.03■■■□□ 2.24
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.01■■■□□ 2.23
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.83■■■□□ 2.21
DKFZP434K028-202ENST00000536405 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.66■■■□□ 2.18
DKFZP434K028-202ENST00000536405 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.62■■■□□ 2.17
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WIZO95785 1651 aa28.47■■■□□ 2.15
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 SMARCA4P51532 1647 aa28.21■■■□□ 2.11
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.15■■■□□ 2.1
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TRIM41Q8WV44 630 aa28.1■■■□□ 2.09
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.89■■■□□ 2.06
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.87■■■□□ 2.05
DKFZP434K028-202ENST00000536405 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SMARCA2P51531 1590 aa27.83■■■□□ 2.05
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
DKFZP434K028-202ENST00000536405 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.69■■■□□ 2.02
DKFZP434K028-202ENST00000536405 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.65■■■□□ 2.02
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.64■■■□□ 2.02
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCC8Q09428 1581 aa27.61■■■□□ 2.01
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.86■■□□□ 1.89
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 CEP162Q5TB80 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.8■■□□□ 1.88
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.65■■□□□ 1.86
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 NESP48681 1621 aa26.42■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KIF27Q86VH2 1401 aa26.41■■□□□ 1.82
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.3■■□□□ 1.8
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 IGF1RP08069 1367 aa26.23■■□□□ 1.79
DKFZP434K028-202ENST00000536405 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.16■■□□□ 1.78
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.14■■□□□ 1.78
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
DKFZP434K028-202ENST00000536405 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.12■■□□□ 1.77
DKFZP434K028-202ENST00000536405 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARAP1Q96P48 1450 aa26.09■■□□□ 1.77
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.09■■□□□ 1.77
DKFZP434K028-202ENST00000536405 APLP2Q06481 763 aa26.08■■□□□ 1.77
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.97■■□□□ 1.75
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DKFZP434K028-202ENST00000536405 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
DKFZP434K028-202ENST00000536405 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
DKFZP434K028-202ENST00000536405 P3H3Q8IVL6 736 aa25.81■■□□□ 1.72
DKFZP434K028-202ENST00000536405 WDR97A6NE52 1622 aa25.8■■□□□ 1.72
DKFZP434K028-202ENST00000536405 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
DKFZP434K028-202ENST00000536405 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
DKFZP434K028-202ENST00000536405 CUL7Q14999 1698 aa25.72■■□□□ 1.71
DKFZP434K028-202ENST00000536405 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.72■■□□□ 1.71
DKFZP434K028-202ENST00000536405 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
DKFZP434K028-202ENST00000536405 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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