RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535067.5

PUS1-205, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PUS1, Length 838 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-205ENST00000535067 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
PUS1-205ENST00000535067 JPH4Q96JJ6 628 aa28.83■■■□□ 2.21
PUS1-205ENST00000535067 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.81■■■□□ 2.2
PUS1-205ENST00000535067 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-205ENST00000535067 IQGAP2Q13576 1575 aa28.64■■■□□ 2.18
PUS1-205ENST00000535067 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.61■■■□□ 2.17
PUS1-205ENST00000535067 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
PUS1-205ENST00000535067 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.58■■■□□ 2.17
PUS1-205ENST00000535067 MAPKBP1O60336 1514 aa28.49■■■□□ 2.15
PUS1-205ENST00000535067 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.49■■■□□ 2.15
PUS1-205ENST00000535067 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.49■■■□□ 2.15
PUS1-205ENST00000535067 DISP1Q96F81 1524 aa28.46■■■□□ 2.15
PUS1-205ENST00000535067 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.45■■■□□ 2.15
PUS1-205ENST00000535067 PTPRGP23470 1445 aa28.44■■■□□ 2.14
PUS1-205ENST00000535067 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.44■■■□□ 2.14
PUS1-205ENST00000535067 DIP2BQ9P265 1576 aa28.41■■■□□ 2.14
PUS1-205ENST00000535067 KIAA0556O60303 1618 aa28.4■■■□□ 2.14
PUS1-205ENST00000535067 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
PUS1-205ENST00000535067 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.39■■■□□ 2.13
PUS1-205ENST00000535067 PRXQ9BXM0 1461 aa28.39■■■□□ 2.13
PUS1-205ENST00000535067 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PUS1-205ENST00000535067 ABCC2Q92887 1545 aa28.32■■■□□ 2.12
PUS1-205ENST00000535067 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.3■■■□□ 2.12
PUS1-205ENST00000535067 UACAQ9BZF9 1416 aa28.27■■■□□ 2.12
PUS1-205ENST00000535067 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.27■■■□□ 2.12
PUS1-205ENST00000535067 TSPOAP1O95153 1857 aa28.21■■■□□ 2.11
PUS1-205ENST00000535067 GOLGA3Q08378 1498 aa28.21■■■□□ 2.11
PUS1-205ENST00000535067 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.18■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 EEA1Q15075 1411 aa28.16■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.15■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.14■■■□□ 2.1
PUS1-205ENST00000535067 GLI2P10070 1586 aa28.11■■■□□ 2.09
PUS1-205ENST00000535067 ABCA8O94911 1581 aa28.1■■■□□ 2.09
PUS1-205ENST00000535067 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PUS1-205ENST00000535067 KDM6BO15054 1643 aa28.06■■■□□ 2.08
PUS1-205ENST00000535067 SAMD9Q5K651 1589 aa28.05■■■□□ 2.08
PUS1-205ENST00000535067 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PUS1-205ENST00000535067 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.01■■■□□ 2.07
PUS1-205ENST00000535067 KIF21BO75037 1637 aa28■■■□□ 2.07
PUS1-205ENST00000535067 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.97■■■□□ 2.07
PUS1-205ENST00000535067 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PUS1-205ENST00000535067 P3H3Q8IVL6 736 aa27.91■■■□□ 2.06
PUS1-205ENST00000535067 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.89■■■□□ 2.06
PUS1-205ENST00000535067 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.87■■■□□ 2.05
PUS1-205ENST00000535067 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.85■■■□□ 2.05
PUS1-205ENST00000535067 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.83■■■□□ 2.05
PUS1-205ENST00000535067 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PUS1-205ENST00000535067 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.8■■■□□ 2.04
PUS1-205ENST00000535067 ATP10BO94823 1461 aa27.8■■■□□ 2.04
PUS1-205ENST00000535067 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.8■■■□□ 2.04
PUS1-205ENST00000535067 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
PUS1-205ENST00000535067 ARID3CA6NKF2 412 aa27.76■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.73■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 KCNH8Q96L42 1107 aa27.72■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 CD109Q6YHK3 1445 aa27.72■■■□□ 2.03
PUS1-205ENST00000535067 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.68■■■□□ 2.02
PUS1-205ENST00000535067 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.65■■■□□ 2.02
PUS1-205ENST00000535067 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PUS1-205ENST00000535067 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PUS1-205ENST00000535067 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PUS1-205ENST00000535067 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.56■■■□□ 2
PUS1-205ENST00000535067 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.54■■■□□ 2
PUS1-205ENST00000535067 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
PUS1-205ENST00000535067 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-205ENST00000535067 HECW1Q76N89 1606 aa27.49■■□□□ 1.99
PUS1-205ENST00000535067 ADGRL1O94910 1474 aa27.48■■□□□ 1.99
PUS1-205ENST00000535067 FMN1Q68DA7 1419 aa27.48■■□□□ 1.99
PUS1-205ENST00000535067 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.44■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.985e-6■□□□□ 9.5
PUS1-205ENST00000535067 NEO1Q92859 1461 aa27.44■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.42■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.41■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.41■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.39■■□□□ 1.98
PUS1-205ENST00000535067 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.38■■□□□ 1.97
PUS1-205ENST00000535067 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PUS1-205ENST00000535067 RICTORQ6R327 1708 aa27.31■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 FANCAO15360 1455 aa27.31■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 KIF14Q15058 1648 aa27.29■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 RAPGEF3O95398 923 aa27.28■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.27■■□□□ 1.96
PUS1-205ENST00000535067 AKNAQ7Z591 1439 aa27.26■■□□□ 1.95
PUS1-205ENST00000535067 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
PUS1-205ENST00000535067 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.23■■□□□ 1.95
PUS1-205ENST00000535067 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.22■■□□□ 1.95
PUS1-205ENST00000535067 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PUS1-205ENST00000535067 PLCH2O75038 1416 aa27.2■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.19■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 CLIP1P30622 1438 aa27.19■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.18■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.18■■□□□ 1.94
PUS1-205ENST00000535067 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.13■■□□□ 1.93
PUS1-205ENST00000535067 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.13■■□□□ 1.93
PUS1-205ENST00000535067 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms