RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-215ENST00000533872 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
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RPS2-215ENST00000533872 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.74■■■■■ 4.11
RPS2-215ENST00000533872 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.74■■■■■ 4.11
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RPS2-215ENST00000533872 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.63■■■■■ 4.1
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RPS2-215ENST00000533872 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.2■■■■■ 4.03
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RPS2-215ENST00000533872 P3H3Q8IVL6 736 aa39.86■■■■□ 3.97
RPS2-215ENST00000533872 UACAQ9BZF9 1416 aa39.83■■■■□ 3.97
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RPS2-215ENST00000533872 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.82■■■■□ 3.97
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RPS2-215ENST00000533872 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.75■■■■□ 3.95
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RPS2-215ENST00000533872 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.64■■■■□ 3.94
RPS2-215ENST00000533872 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.93
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RPS2-215ENST00000533872 CEP162Q5TB80 1403 aa39.62■■■■□ 3.93
RPS2-215ENST00000533872 FMN1Q68DA7 1419 aa39.6■■■■□ 3.93
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RPS2-215ENST00000533872 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.31■■■■□ 3.88
RPS2-215ENST00000533872 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
RPS2-215ENST00000533872 DIP2BQ9P265 1576 aa39.29■■■■□ 3.88
RPS2-215ENST00000533872 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.29■■■■□ 3.88
RPS2-215ENST00000533872 ARID3CA6NKF2 412 aa39.29■■■■□ 3.88
RPS2-215ENST00000533872 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.28■■■■□ 3.88
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RPS2-215ENST00000533872 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
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RPS2-215ENST00000533872 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.16■■■■□ 3.86
RPS2-215ENST00000533872 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.14■■■■□ 3.86
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RPS2-215ENST00000533872 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.05■■■■□ 3.84
RPS2-215ENST00000533872 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39■■■■□ 3.83
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RPS2-215ENST00000533872 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.88■■■■□ 3.81
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RPS2-215ENST00000533872 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.84■■■■□ 3.81not detected■□□□□ 9.1
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RPS2-215ENST00000533872 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
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