RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.06	■■■■■ 7.05
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.41	■■■■■ 5.98
RPS2-215	ENST00000533872	ABCC9	O60706	1549 aa		50.76	■■■■■ 5.72
RPS2-215	ENST00000533872	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.31	■■■■■ 5.48
RPS2-215	ENST00000533872	NACAD	O15069	1562 aa		49.13	■■■■■ 5.46
RPS2-215	ENST00000533872	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.08	■■■■■ 5.45
RPS2-215	ENST00000533872	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.01	■■■■■ 5.44
RPS2-215	ENST00000533872	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.01	■■■■■ 5.44
RPS2-215	ENST00000533872	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.94	■■■■■ 5.43
RPS2-215	ENST00000533872	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.01	■■■■■ 5.28
RPS2-215	ENST00000533872	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.77	■■■■■ 5.24
RPS2-215	ENST00000533872	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.58	■■■■■ 5.21
RPS2-215	ENST00000533872	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.43	■■■■■ 5.18
RPS2-215	ENST00000533872	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.18	■■■■■ 5.14
RPS2-215	ENST00000533872	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.29	■■■■■ 5
RPS2-215	ENST00000533872	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.15	■■■■■ 4.98
RPS2-215	ENST00000533872	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.99	■■■■■ 4.95
RPS2-215	ENST00000533872	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.92	■■■■■ 4.94
RPS2-215	ENST00000533872	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.77	■■■■■ 4.92
RPS2-215	ENST00000533872	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.77	■■■■■ 4.92
RPS2-215	ENST00000533872	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.5	■■■■■ 4.87
RPS2-215	ENST00000533872	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.38	■■■■■ 4.86
RPS2-215	ENST00000533872	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.38	■■■■■ 4.86
RPS2-215	ENST00000533872	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.35	■■■■■ 4.85
RPS2-215	ENST00000533872	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.3	■■■■■ 4.84
RPS2-215	ENST00000533872	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.16	■■■■■ 4.82
RPS2-215	ENST00000533872	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.12	■■■■■ 4.81
RPS2-215	ENST00000533872	WIZ	O95785	1651 aa		45.05	■■■■■ 4.8
RPS2-215	ENST00000533872	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.04	■■■■■ 4.8
RPS2-215	ENST00000533872	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.62	■■■■■ 4.73
RPS2-215	ENST00000533872	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.17	■■■■■ 4.66
RPS2-215	ENST00000533872	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.08	■■■■■ 4.65
RPS2-215	ENST00000533872	NES	P48681	1621 aa		44.05	■■■■■ 4.64
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.04	■■■■■ 4.64
RPS2-215	ENST00000533872	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.98	■■■■■ 4.63
RPS2-215	ENST00000533872	CFTR	P13569	1480 aa		43.83	■■■■■ 4.61
RPS2-215	ENST00000533872	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.73	■■■■■ 4.59
RPS2-215	ENST00000533872	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.72	■■■■■ 4.59
RPS2-215	ENST00000533872	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.62	■■■■■ 4.57
RPS2-215	ENST00000533872	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.61	■■■■■ 4.57
RPS2-215	ENST00000533872	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.49	■■■■■ 4.55
RPS2-215	ENST00000533872	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.41	■■■■■ 4.54
RPS2-215	ENST00000533872	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.54
RPS2-215	ENST00000533872	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.26	■■■■■ 4.52
RPS2-215	ENST00000533872	CUX2	O14529	1486 aa		43.18	■■■■■ 4.5
RPS2-215	ENST00000533872	WDR62	O43379	1518 aa		43.14	■■■■■ 4.5
RPS2-215	ENST00000533872	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
RPS2-215	ENST00000533872	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.89	■■■■■ 4.46
RPS2-215	ENST00000533872	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RPS2-215	ENST00000533872	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.85	■■■■■ 4.45
RPS2-215	ENST00000533872	CUX1	P39880	1505 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RPS2-215	ENST00000533872	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.54	■■■■■ 4.4	not detected	■■■■□ 25.1
RPS2-215	ENST00000533872	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
RPS2-215	ENST00000533872	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RPS2-215	ENST00000533872	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.47	■■■■■ 4.39
RPS2-215	ENST00000533872	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RPS2-215	ENST00000533872	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.45	■■■■■ 4.39
RPS2-215	ENST00000533872	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.44	■■■■■ 4.38
RPS2-215	ENST00000533872	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
RPS2-215	ENST00000533872	SOGA1	O94964	1423 aa		42.3	■■■■■ 4.36
RPS2-215	ENST00000533872	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.28	■■■■■ 4.36
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
RPS2-215	ENST00000533872	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RPS2-215	ENST00000533872	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
RPS2-215	ENST00000533872	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.09	■■■■■ 4.33
RPS2-215	ENST00000533872	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.02	■■■■■ 4.32	not detected	■■■■■ 31.4
RPS2-215	ENST00000533872	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
RPS2-215	ENST00000533872	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RPS2-215	ENST00000533872	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.85	■■■■■ 4.29
RPS2-215	ENST00000533872	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.8	■■■■■ 4.28
RPS2-215	ENST00000533872	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.79	■■■■■ 4.28
RPS2-215	ENST00000533872	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RPS2-215	ENST00000533872	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.67	■■■■■ 4.26
RPS2-215	ENST00000533872	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
RPS2-215	ENST00000533872	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.62	■■■■■ 4.25
RPS2-215	ENST00000533872	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.61	■■■■■ 4.25
RPS2-215	ENST00000533872	CHD1	O14646	1710 aa		41.52	■■■■■ 4.24
RPS2-215	ENST00000533872	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.5	■■■■■ 4.23
RPS2-215	ENST00000533872	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.48	■■■■■ 4.23
RPS2-215	ENST00000533872	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.48	■■■■■ 4.23
RPS2-215	ENST00000533872	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.39	■■■■■ 4.22
RPS2-215	ENST00000533872	FBLN2	P98095	1184 aa		41.37	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.37	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	IGF1R	P08069	1367 aa		41.37	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.36	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	CUL7	Q14999	1698 aa		41.33	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.33	■■■■■ 4.21
RPS2-215	ENST00000533872	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPS2-215	ENST00000533872	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPS2-215	ENST00000533872	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.14	■■■■■ 4.18
RPS2-215	ENST00000533872	EEA1	Q15075	1411 aa		41.12	■■■■■ 4.17
RPS2-215	ENST00000533872	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.08	■■■■■ 4.17
RPS2-215	ENST00000533872	NUP160	Q12769	1436 aa		41.08	■■■■■ 4.17
RPS2-215	ENST00000533872	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.05	■■■■■ 4.16
RPS2-215	ENST00000533872	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.97	■■■■■ 4.15
RPS2-215	ENST00000533872	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.94	■■■■■ 4.14
RPS2-215	ENST00000533872	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RPS2-215	ENST00000533872	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
RPS2-215	ENST00000533872	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		40.77	■■■■■ 4.12
RPS2-215	ENST00000533872	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.77	■■■■■ 4.12

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