RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528966.5

LTBP3-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP3, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3-211ENST00000528966 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.35■■■□□ 2.77
LTBP3-211ENST00000528966 MAPKBP1O60336 1514 aa32.31■■■□□ 2.76
LTBP3-211ENST00000528966 DIP2BQ9P265 1576 aa32.31■■■□□ 2.76
LTBP3-211ENST00000528966 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.3■■■□□ 2.76
LTBP3-211ENST00000528966 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.26■■■□□ 2.75
LTBP3-211ENST00000528966 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.22■■■□□ 2.75
LTBP3-211ENST00000528966 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
LTBP3-211ENST00000528966 KDM6BO15054 1643 aa32.2■■■□□ 2.75
LTBP3-211ENST00000528966 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
LTBP3-211ENST00000528966 TSPOAP1O95153 1857 aa32.13■■■□□ 2.73
LTBP3-211ENST00000528966 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.01■■■□□ 2.72
LTBP3-211ENST00000528966 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
LTBP3-211ENST00000528966 IGF1RP08069 1367 aa31.87■■■□□ 2.69
LTBP3-211ENST00000528966 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
LTBP3-211ENST00000528966 CUL7Q14999 1698 aa31.85■■■□□ 2.69
LTBP3-211ENST00000528966 PTPRGP23470 1445 aa31.84■■■□□ 2.69
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC2Q92887 1545 aa31.8■■■□□ 2.68
LTBP3-211ENST00000528966 ADGRL1O94910 1474 aa31.78■■■□□ 2.68
LTBP3-211ENST00000528966 GLI2P10070 1586 aa31.77■■■□□ 2.68
LTBP3-211ENST00000528966 ASXL2Q76L83 1435 aa31.76■■■□□ 2.68
LTBP3-211ENST00000528966 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
LTBP3-211ENST00000528966 KIF27Q86VH2 1401 aa31.75■■■□□ 2.67
LTBP3-211ENST00000528966 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.73■■■□□ 2.67
LTBP3-211ENST00000528966 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.72■■■□□ 2.67
LTBP3-211ENST00000528966 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
LTBP3-211ENST00000528966 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.67■■■□□ 2.66
LTBP3-211ENST00000528966 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.65■■■□□ 2.66
LTBP3-211ENST00000528966 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.61■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.6■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 IQGAP2Q13576 1575 aa31.6■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.6■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 UACAQ9BZF9 1416 aa31.58■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
LTBP3-211ENST00000528966 DISP1Q96F81 1524 aa31.54■■■□□ 2.64
LTBP3-211ENST00000528966 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.54■■■□□ 2.64
LTBP3-211ENST00000528966 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.5■■■□□ 2.63
LTBP3-211ENST00000528966 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
LTBP3-211ENST00000528966 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.39■■■□□ 2.61
LTBP3-211ENST00000528966 KIAA0556O60303 1618 aa31.35■■■□□ 2.61
LTBP3-211ENST00000528966 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.33■■■□□ 2.61
LTBP3-211ENST00000528966 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.25■■■□□ 2.59
LTBP3-211ENST00000528966 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.24■■■□□ 2.59
LTBP3-211ENST00000528966 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.22■■■□□ 2.59
LTBP3-211ENST00000528966 CD109Q6YHK3 1445 aa31.21■■■□□ 2.59
LTBP3-211ENST00000528966 KIF21BO75037 1637 aa31.17■■■□□ 2.58
LTBP3-211ENST00000528966 ABCA8O94911 1581 aa31.12■■■□□ 2.57
LTBP3-211ENST00000528966 KCNH8Q96L42 1107 aa31.11■■■□□ 2.57
LTBP3-211ENST00000528966 FBXO41Q8TF61 875 aa31.09■■■□□ 2.57
LTBP3-211ENST00000528966 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.08■■■□□ 2.57
LTBP3-211ENST00000528966 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.02■■■□□ 2.56
LTBP3-211ENST00000528966 GOLGA3Q08378 1498 aa31.01■■■□□ 2.55
LTBP3-211ENST00000528966 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.97■■■□□ 2.55
LTBP3-211ENST00000528966 PTPRMP28827 1452 aa30.95■■■□□ 2.55
LTBP3-211ENST00000528966 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.86■■■□□ 2.53
LTBP3-211ENST00000528966 ATP10BO94823 1461 aa30.84■■■□□ 2.53
LTBP3-211ENST00000528966 ARID3CA6NKF2 412 aa30.83■■■□□ 2.53
LTBP3-211ENST00000528966 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.81■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.81■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 RAPGEF3O95398 923 aa30.8■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 MADDQ8WXG6 1647 aa30.79■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.77■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.77■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 PRXQ9BXM0 1461 aa30.76■■■□□ 2.52
LTBP3-211ENST00000528966 NEO1Q92859 1461 aa30.74■■■□□ 2.51
LTBP3-211ENST00000528966 P3H3Q8IVL6 736 aa30.69■■■□□ 2.5
LTBP3-211ENST00000528966 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
LTBP3-211ENST00000528966 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
LTBP3-211ENST00000528966 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.62■■■□□ 2.49
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.62■■■□□ 2.49
LTBP3-211ENST00000528966 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
LTBP3-211ENST00000528966 SAMD9Q5K651 1589 aa30.59■■■□□ 2.49
LTBP3-211ENST00000528966 RICTORQ6R327 1708 aa30.58■■■□□ 2.49
LTBP3-211ENST00000528966 HSPA2P54652 639 aa30.55■■■□□ 2.48
LTBP3-211ENST00000528966 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
LTBP3-211ENST00000528966 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
LTBP3-211ENST00000528966 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
LTBP3-211ENST00000528966 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
LTBP3-211ENST00000528966 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.5■■■□□ 2.47
LTBP3-211ENST00000528966 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.47■■■□□ 2.47
LTBP3-211ENST00000528966 AKNAQ7Z591 1439 aa30.46■■■□□ 2.47
LTBP3-211ENST00000528966 FANCAO15360 1455 aa30.44■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.43■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.43■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 CERKQ8TCT0 537 aa30.43■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.41■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.4■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.4■■■□□ 2.46
LTBP3-211ENST00000528966 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.38■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.36■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.36■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.34■■■□□ 2.45
LTBP3-211ENST00000528966 HECW1Q76N89 1606 aa30.31■■■□□ 2.44
LTBP3-211ENST00000528966 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.31■■■□□ 2.44
LTBP3-211ENST00000528966 MLECQ14165 292 aa30.29■■■□□ 2.44
LTBP3-211ENST00000528966 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.28■■■□□ 2.44
LTBP3-211ENST00000528966 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
LTBP3-211ENST00000528966 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.23■■■□□ 2.43
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