RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528426.5

CHID1-212, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHID1, Length 991 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-212ENST00000528426 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.37■■■■■ 5.33
CHID1-212ENST00000528426 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.28■■■■■ 5.32
CHID1-212ENST00000528426 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
CHID1-212ENST00000528426 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.26■■■■■ 5.32
CHID1-212ENST00000528426 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.15■■■■■ 5.3
CHID1-212ENST00000528426 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.08■■■■■ 5.29
CHID1-212ENST00000528426 PRXQ9BXM0 1461 aa48.08■■■■■ 5.29
CHID1-212ENST00000528426 EEA1Q15075 1411 aa48.05■■■■■ 5.28
CHID1-212ENST00000528426 IQGAP2Q13576 1575 aa47.95■■■■■ 5.27
CHID1-212ENST00000528426 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.87■■■■■ 5.25
CHID1-212ENST00000528426 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.76■■■■■ 5.24
CHID1-212ENST00000528426 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.74■■■■■ 5.23
CHID1-212ENST00000528426 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
CHID1-212ENST00000528426 PTPRGP23470 1445 aa47.73■■■■■ 5.23
CHID1-212ENST00000528426 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
CHID1-212ENST00000528426 DISP1Q96F81 1524 aa47.69■■■■■ 5.22
CHID1-212ENST00000528426 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.61■■■■■ 5.21
CHID1-212ENST00000528426 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.57■■■■■ 5.21
CHID1-212ENST00000528426 GOLGA3Q08378 1498 aa47.51■■■■■ 5.2
CHID1-212ENST00000528426 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
CHID1-212ENST00000528426 KIAA0556O60303 1618 aa47.47■■■■■ 5.19
CHID1-212ENST00000528426 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.45■■■■■ 5.19
CHID1-212ENST00000528426 KIF21BO75037 1637 aa47.41■■■■■ 5.18
CHID1-212ENST00000528426 UACAQ9BZF9 1416 aa47.38■■■■■ 5.17
CHID1-212ENST00000528426 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.35■■■■■ 5.17
CHID1-212ENST00000528426 MAPKBP1O60336 1514 aa47.28■■■■■ 5.16
CHID1-212ENST00000528426 ABCC2Q92887 1545 aa47.26■■■■■ 5.16
CHID1-212ENST00000528426 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
CHID1-212ENST00000528426 P3H3Q8IVL6 736 aa47.15■■■■■ 5.14
CHID1-212ENST00000528426 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.13■■■■■ 5.13
CHID1-212ENST00000528426 SAMD9Q5K651 1589 aa47.11■■■■■ 5.13
CHID1-212ENST00000528426 KDM5BQ9UGL1 1544 aa47.1■■■■■ 5.13
CHID1-212ENST00000528426 PLB1Q6P1J6 1458 aa47.08■■■■■ 5.13
CHID1-212ENST00000528426 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.08■■■■■ 5.13
CHID1-212ENST00000528426 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.04■■■■■ 5.12
CHID1-212ENST00000528426 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
CHID1-212ENST00000528426 ABCA8O94911 1581 aa47.03■■■■■ 5.12
CHID1-212ENST00000528426 ASXL2Q76L83 1435 aa46.98■■■■■ 5.11
CHID1-212ENST00000528426 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.95■■■■■ 5.11
CHID1-212ENST00000528426 DIP2BQ9P265 1576 aa46.92■■■■■ 5.1
CHID1-212ENST00000528426 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.91■■■■■ 5.1
CHID1-212ENST00000528426 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
CHID1-212ENST00000528426 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.85■■■■■ 5.09
CHID1-212ENST00000528426 GLI2P10070 1586 aa46.73■■■■■ 5.07
CHID1-212ENST00000528426 ATP10BO94823 1461 aa46.7■■■■■ 5.07
CHID1-212ENST00000528426 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
CHID1-212ENST00000528426 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.7■■■■■ 5.07
CHID1-212ENST00000528426 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.68■■■■■ 5.06
CHID1-212ENST00000528426 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.66■■■■■ 5.06
CHID1-212ENST00000528426 ARID3CA6NKF2 412 aa46.6■■■■■ 5.05
CHID1-212ENST00000528426 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
CHID1-212ENST00000528426 FMN1Q68DA7 1419 aa46.56■■■■■ 5.04
CHID1-212ENST00000528426 KCNH8Q96L42 1107 aa46.54■■■■■ 5.04
CHID1-212ENST00000528426 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.5■■■■■ 5.03
CHID1-212ENST00000528426 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
CHID1-212ENST00000528426 TSPOAP1O95153 1857 aa46.42■■■■■ 5.02
CHID1-212ENST00000528426 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.41■■■■■ 5.02
CHID1-212ENST00000528426 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.38■■■■■ 5.02
CHID1-212ENST00000528426 CD109Q6YHK3 1445 aa46.35■■■■■ 5.01
CHID1-212ENST00000528426 CLIP1P30622 1438 aa46.34■■■■■ 5.01
CHID1-212ENST00000528426 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.32■■■■■ 5.01
CHID1-212ENST00000528426 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CHID1-212ENST00000528426 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
CHID1-212ENST00000528426 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.27■■■■■ 5
CHID1-212ENST00000528426 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.25■■■■■ 4.99
CHID1-212ENST00000528426 KDM6BO15054 1643 aa46.21■■■■■ 4.99
CHID1-212ENST00000528426 HECW1Q76N89 1606 aa46.21■■■■■ 4.99
CHID1-212ENST00000528426 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
CHID1-212ENST00000528426 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.16■■■■■ 4.98
CHID1-212ENST00000528426 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
CHID1-212ENST00000528426 ABCA9Q8IUA7 1624 aa46.14■■■■■ 4.98
CHID1-212ENST00000528426 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.14■■■■■ 4.98
CHID1-212ENST00000528426 CEP162Q5TB80 1403 aa46.06■■■■■ 4.96
CHID1-212ENST00000528426 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
CHID1-212ENST00000528426 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.02■■■■■ 4.96
CHID1-212ENST00000528426 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.99■■■■■ 4.95
CHID1-212ENST00000528426 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.97■■■■■ 4.95
CHID1-212ENST00000528426 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
CHID1-212ENST00000528426 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.93■■■■■ 4.943e-6■□□□□ 8.9
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CHID1-212ENST00000528426 NEO1Q92859 1461 aa45.89■■■■■ 4.94
CHID1-212ENST00000528426 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.87■■■■■ 4.93
CHID1-212ENST00000528426 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.85■■■■■ 4.93
CHID1-212ENST00000528426 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.77■■■■■ 4.92
CHID1-212ENST00000528426 PLCH2O75038 1416 aa45.77■■■■■ 4.92
CHID1-212ENST00000528426 FANCAO15360 1455 aa45.71■■■■■ 4.91
CHID1-212ENST00000528426 KIF14Q15058 1648 aa45.7■■■■■ 4.91
CHID1-212ENST00000528426 AKNAQ7Z591 1439 aa45.69■■■■■ 4.9
CHID1-212ENST00000528426 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.65■■■■■ 4.9
CHID1-212ENST00000528426 RAPGEF3O95398 923 aa45.63■■■■■ 4.9
CHID1-212ENST00000528426 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.62■■■■■ 4.89
CHID1-212ENST00000528426 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.55■■■■■ 4.88
CHID1-212ENST00000528426 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.55■■■■■ 4.88
CHID1-212ENST00000528426 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.51■■■■■ 4.88
CHID1-212ENST00000528426 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.5■■■■■ 4.87
CHID1-212ENST00000528426 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
CHID1-212ENST00000528426 ADGRL1O94910 1474 aa45.45■■■■■ 4.87
CHID1-212ENST00000528426 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.44■■■■■ 4.87
CHID1-212ENST00000528426 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.42■■■■■ 4.86
CHID1-212ENST00000528426 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.41■■■■■ 4.86
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