RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527634.5

C11orf80-210, Transcript of chromosome 11 open reading frame 80, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene C11orf80, Length 1,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf80-210ENST00000527634 MAP3K1Q13233 1512 aa38.22■■■■□ 3.71
C11orf80-210ENST00000527634 GRIN2BQ13224 1484 aa38.22■■■■□ 3.71
C11orf80-210ENST00000527634 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.21■■■■□ 3.71
C11orf80-210ENST00000527634 ADAMTS12P58397 1594 aa38.15■■■■□ 3.7
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C11orf80-210ENST00000527634 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.91■■■■□ 3.5
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C11orf80-210ENST00000527634 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.88■■■■□ 3.49
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C11orf80-210ENST00000527634 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
C11orf80-210ENST00000527634 DAPK1P53355 1430 aa36.44■■■■□ 3.42
C11orf80-210ENST00000527634 ABCC2Q92887 1545 aa36.43■■■■□ 3.42
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C11orf80-210ENST00000527634 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.43■■■■□ 3.42
C11orf80-210ENST00000527634 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.42■■■■□ 3.42
C11orf80-210ENST00000527634 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.38■■■■□ 3.41
C11orf80-210ENST00000527634 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.37■■■■□ 3.41
C11orf80-210ENST00000527634 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
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