RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.47■■■□□ 2.63
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.46■■■□□ 2.63
TSPAN4-216ENST00000526055 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
TSPAN4-216ENST00000526055 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.3■■■□□ 2.6
TSPAN4-216ENST00000526055 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
TSPAN4-216ENST00000526055 IQGAP2Q13576 1575 aa31.18■■■□□ 2.58
TSPAN4-216ENST00000526055 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
TSPAN4-216ENST00000526055 PRXQ9BXM0 1461 aa31.12■■■□□ 2.57
TSPAN4-216ENST00000526055 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.06■■■□□ 2.56
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRGP23470 1445 aa31.06■■■□□ 2.56
TSPAN4-216ENST00000526055 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.04■■■□□ 2.56
TSPAN4-216ENST00000526055 EEA1Q15075 1411 aa31.04■■■□□ 2.56
TSPAN4-216ENST00000526055 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
TSPAN4-216ENST00000526055 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31■■■□□ 2.55
TSPAN4-216ENST00000526055 DISP1Q96F81 1524 aa30.99■■■□□ 2.55
TSPAN4-216ENST00000526055 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.98■■■□□ 2.55
TSPAN4-216ENST00000526055 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPAN4-216ENST00000526055 MAPKBP1O60336 1514 aa30.93■■■□□ 2.54
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA0556O60303 1618 aa30.88■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 GOLGA3Q08378 1498 aa30.88■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 UACAQ9BZF9 1416 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCC2Q92887 1545 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.73■■■□□ 2.51
TSPAN4-216ENST00000526055 DIP2BQ9P265 1576 aa30.71■■■□□ 2.51
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.68■■■□□ 2.5
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
TSPAN4-216ENST00000526055 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.68■■■□□ 2.5
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF21BO75037 1637 aa30.66■■■□□ 2.5
TSPAN4-216ENST00000526055 ASXL2Q76L83 1435 aa30.64■■■□□ 2.49
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCA8O94911 1581 aa30.58■■■□□ 2.49
TSPAN4-216ENST00000526055 SAMD9Q5K651 1589 aa30.58■■■□□ 2.49
TSPAN4-216ENST00000526055 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TSPAN4-216ENST00000526055 GLI2P10070 1586 aa30.54■■■□□ 2.48
TSPAN4-216ENST00000526055 P3H3Q8IVL6 736 aa30.49■■■□□ 2.47
TSPAN4-216ENST00000526055 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPAN4-216ENST00000526055 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPAN4-216ENST00000526055 TSPOAP1O95153 1857 aa30.4■■■□□ 2.46
TSPAN4-216ENST00000526055 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
TSPAN4-216ENST00000526055 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
TSPAN4-216ENST00000526055 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPAN4-216ENST00000526055 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP10BO94823 1461 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPAN4-216ENST00000526055 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM6BO15054 1643 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPAN4-216ENST00000526055 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPAN4-216ENST00000526055 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
TSPAN4-216ENST00000526055 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNH8Q96L42 1107 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 ARID3CA6NKF2 412 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 CD109Q6YHK3 1445 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.17■■■□□ 2.42
TSPAN4-216ENST00000526055 FMN1Q68DA7 1419 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN4-216ENST00000526055 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPAN4-216ENST00000526055 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.09■■■□□ 2.41
TSPAN4-216ENST00000526055 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.07■■■□□ 2.4
TSPAN4-216ENST00000526055 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
TSPAN4-216ENST00000526055 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.02■■■□□ 2.4
TSPAN4-216ENST00000526055 HECW1Q76N89 1606 aa30■■■□□ 2.39
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 NEO1Q92859 1461 aa29.92■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 CLIP1P30622 1438 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN4-216ENST00000526055 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.87■■■□□ 2.37
TSPAN4-216ENST00000526055 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.78■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.77■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.76■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 FANCAO15360 1455 aa29.75■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 PLCH2O75038 1416 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 AKNAQ7Z591 1439 aa29.73■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF14Q15058 1648 aa29.71■■■□□ 2.35
TSPAN4-216ENST00000526055 RAPGEF3O95398 923 aa29.69■■■□□ 2.34
TSPAN4-216ENST00000526055 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP162Q5TB80 1403 aa29.67■■■□□ 2.34
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRL1O94910 1474 aa29.66■■■□□ 2.34
TSPAN4-216ENST00000526055 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPAN4-216ENST00000526055 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.63■■■□□ 2.33
TSPAN4-216ENST00000526055 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.62■■■□□ 2.33
TSPAN4-216ENST00000526055 RICTORQ6R327 1708 aa29.57■■■□□ 2.32
TSPAN4-216ENST00000526055 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.55■■■□□ 2.32
TSPAN4-216ENST00000526055 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.54■■■□□ 2.32
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms