RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.64■■■■■ 4.9
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.52■■■■■ 4.88
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.3■■■■■ 4.84
RPS6KA1-212ENST00000526040 IQGAP2Q13576 1575 aa45.18■■■■■ 4.82
RPS6KA1-212ENST00000526040 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.06■■■■■ 4.8
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRXQ9BXM0 1461 aa44.99■■■■■ 4.79
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPRGP23470 1445 aa44.98■■■■■ 4.79
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.96■■■■■ 4.79
RPS6KA1-212ENST00000526040 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.95■■■■■ 4.79
RPS6KA1-212ENST00000526040 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.94■■■■■ 4.78
RPS6KA1-212ENST00000526040 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.92■■■■■ 4.78
RPS6KA1-212ENST00000526040 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.92■■■■■ 4.78
RPS6KA1-212ENST00000526040 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
RPS6KA1-212ENST00000526040 DISP1Q96F81 1524 aa44.91■■■■■ 4.78
RPS6KA1-212ENST00000526040 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.87■■■■■ 4.77
RPS6KA1-212ENST00000526040 EEA1Q15075 1411 aa44.77■■■■■ 4.76
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAPKBP1O60336 1514 aa44.76■■■■■ 4.76
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIAA0556O60303 1618 aa44.76■■■■■ 4.76
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.75■■■■■ 4.75
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.67■■■■■ 4.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 UACAQ9BZF9 1416 aa44.65■■■■■ 4.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.65■■■■■ 4.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.63■■■■■ 4.73
RPS6KA1-212ENST00000526040 GOLGA3Q08378 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC2Q92887 1545 aa44.63■■■■■ 4.73
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.6■■■■■ 4.73
RPS6KA1-212ENST00000526040 DIP2BQ9P265 1576 aa44.55■■■■■ 4.72
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.43■■■■■ 4.7
RPS6KA1-212ENST00000526040 ASXL2Q76L83 1435 aa44.41■■■■■ 4.7
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.38■■■■■ 4.69
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF21BO75037 1637 aa44.37■■■■■ 4.69
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
RPS6KA1-212ENST00000526040 P3H3Q8IVL6 736 aa44.34■■■■■ 4.69
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCA8O94911 1581 aa44.31■■■■■ 4.68
RPS6KA1-212ENST00000526040 SAMD9Q5K651 1589 aa44.28■■■■■ 4.68
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPOAP1O95153 1857 aa44.27■■■■■ 4.68
RPS6KA1-212ENST00000526040 GLI2P10070 1586 aa44.22■■■■■ 4.67
RPS6KA1-212ENST00000526040 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
RPS6KA1-212ENST00000526040 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.09■■■■■ 4.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.08■■■■■ 4.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.01■■■■■ 4.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDM6BO15054 1643 aa43.99■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.99■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.99■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARID3CA6NKF2 412 aa43.98■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.98■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATP10BO94823 1461 aa43.96■■■■■ 4.63
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCNH8Q96L42 1107 aa43.93■■■■■ 4.62
RPS6KA1-212ENST00000526040 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.82■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.79■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 CD109Q6YHK3 1445 aa43.76■■■■■ 4.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.7■■■■■ 4.59
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.68■■■■■ 4.58
RPS6KA1-212ENST00000526040 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
RPS6KA1-212ENST00000526040 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
RPS6KA1-212ENST00000526040 FMN1Q68DA7 1419 aa43.59■■■■■ 4.57
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.59■■■■■ 4.57
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.56■■■■■ 4.56
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.47■■■■■ 4.55
RPS6KA1-212ENST00000526040 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
RPS6KA1-212ENST00000526040 HECW1Q76N89 1606 aa43.44■■■■■ 4.54
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.33■■■■■ 4.53
RPS6KA1-212ENST00000526040 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.33■■■■■ 4.53
RPS6KA1-212ENST00000526040 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.29■■■■■ 4.522e-8■■■■■ 27.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 NEO1Q92859 1461 aa43.28■■■■■ 4.52
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLIP1P30622 1438 aa43.26■■■■■ 4.52
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.26■■■■■ 4.52
RPS6KA1-212ENST00000526040 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
RPS6KA1-212ENST00000526040 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.23■■■■■ 4.51
RPS6KA1-212ENST00000526040 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.21■■■■■ 4.51
RPS6KA1-212ENST00000526040 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.2■■■■■ 4.51
RPS6KA1-212ENST00000526040 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAPGEF3O95398 923 aa43.11■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 FANCAO15360 1455 aa43.11■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.08■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.07■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 AKNAQ7Z591 1439 aa43.07■■■■■ 4.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADGRL1O94910 1474 aa43.06■■■■■ 4.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF14Q15058 1648 aa43.04■■■■■ 4.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.04■■■■■ 4.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLCH2O75038 1416 aa43.04■■■■■ 4.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.99■■■■■ 4.47
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.99■■■■■ 4.47
RPS6KA1-212ENST00000526040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEP162Q5TB80 1403 aa42.93■■■■■ 4.46
RPS6KA1-212ENST00000526040 RICTORQ6R327 1708 aa42.93■■■■■ 4.46
RPS6KA1-212ENST00000526040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.89■■■■■ 4.46
RPS6KA1-212ENST00000526040 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.87■■■■■ 4.45
RPS6KA1-212ENST00000526040 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.82■■■■■ 4.45
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms