RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.61■■■■■ 8.09
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.55■■■■■ 6.96
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC9O60706 1549 aa57.81■■■■■ 6.85
RPS6KA1-212ENST00000526040 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.37■■■■■ 6.45
RPS6KA1-212ENST00000526040 NACADO15069 1562 aa55.18■■■■■ 6.42
RPS6KA1-212ENST00000526040 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.12■■■■■ 6.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.65■■■■■ 6.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.52■■■■■ 6.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.24■■■■■ 6.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.16■■■■■ 6.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.96■■■■■ 6.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.71■■■■■ 6.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.57■■■■■ 6.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SCRIBQ14160 1630 aa53.39■■■■■ 6.14
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.04■■■■■ 6.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.34■■■■■ 5.97
RPS6KA1-212ENST00000526040 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.28■■■■■ 5.96
RPS6KA1-212ENST00000526040 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.99■■■■■ 5.91
RPS6KA1-212ENST00000526040 SMARCA4P51532 1647 aa51.02■■■■■ 5.76
RPS6KA1-212ENST00000526040 NCAPD3P42695 1498 aa50.93■■■■■ 5.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.88■■■■■ 5.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.88■■■■■ 5.74
RPS6KA1-212ENST00000526040 SMARCA2P51531 1590 aa50.78■■■■■ 5.72
RPS6KA1-212ENST00000526040 HMGXB3Q12766 1538 aa50.61■■■■■ 5.69
RPS6KA1-212ENST00000526040 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.56■■■■■ 5.68
RPS6KA1-212ENST00000526040 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.51■■■■■ 5.68
RPS6KA1-212ENST00000526040 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 WIZO95785 1651 aa50.02■■■■■ 5.6
RPS6KA1-212ENST00000526040 NESP48681 1621 aa49.88■■■■■ 5.58
RPS6KA1-212ENST00000526040 ERCC6Q03468 1493 aa49.85■■■■■ 5.57
RPS6KA1-212ENST00000526040 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.79■■■■■ 5.56
RPS6KA1-212ENST00000526040 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.66■■■■■ 5.54
RPS6KA1-212ENST00000526040 CUX2O14529 1486 aa49.5■■■■■ 5.51
RPS6KA1-212ENST00000526040 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.42■■■■■ 5.5
RPS6KA1-212ENST00000526040 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
RPS6KA1-212ENST00000526040 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.35■■■■■ 5.49
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.28■■■■■ 5.48
RPS6KA1-212ENST00000526040 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
RPS6KA1-212ENST00000526040 CFTRP13569 1480 aa49■■■■■ 5.44
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.86■■■■■ 5.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.86■■■■■ 5.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.85■■■■■ 5.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.83■■■■■ 5.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR62O43379 1518 aa48.72■■■■■ 5.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.64■■■■■ 5.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRDM2Q13029 1718 aa48.63■■■■■ 5.37
RPS6KA1-212ENST00000526040 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 TOPBP1Q92547 1522 aa48.02■■■■■ 5.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC8Q09428 1581 aa47.98■■■■■ 5.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.91■■■■■ 5.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 IFT140Q96RY7 1462 aa47.82■■■■■ 5.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.56■■■■■ 5.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
RPS6KA1-212ENST00000526040 CUX1P39880 1505 aa47.46■■■■■ 5.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
RPS6KA1-212ENST00000526040 OSCARQ8IYS5 282 aa47.41■■■■■ 5.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.4■■■■■ 5.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 SOGA1O94964 1423 aa47.39■■■■■ 5.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.39■■■■■ 5.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.36■■■■■ 5.172e-7■■■■■ 45.4
RPS6KA1-212ENST00000526040 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR97A6NE52 1622 aa47.09■■■■■ 5.13
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHD1O14646 1710 aa46.99■■■■■ 5.11
RPS6KA1-212ENST00000526040 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.96■■■■■ 5.11
RPS6KA1-212ENST00000526040 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.92■■■■■ 5.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 TOP2BQ02880 1626 aa46.91■■■■■ 5.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 FBLN2P98095 1184 aa46.91■■■■■ 5.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.89■■■■■ 5.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYNJ1O43426 1573 aa46.88■■■■■ 5.1
RPS6KA1-212ENST00000526040 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.88■■■■■ 5.09
RPS6KA1-212ENST00000526040 GRIN2BQ13224 1484 aa46.87■■■■■ 5.09
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRIM41Q8WV44 630 aa46.84■■■■■ 5.09
RPS6KA1-212ENST00000526040 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.82■■■■■ 5.09
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 PBRM1Q86U86 1689 aa46.77■■■■■ 5.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.75■■■■■ 5.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYNJ2O15056 1496 aa46.62■■■■■ 5.05
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF11O15085 1522 aa46.61■■■■■ 5.05
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.43■■■■■ 5.02
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADAMTS12P58397 1594 aa46.33■■■■■ 5.01
RPS6KA1-212ENST00000526040 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.32■■■■■ 5.01
RPS6KA1-212ENST00000526040 GRIN2AQ12879 1464 aa46.27■■■■■ 5
RPS6KA1-212ENST00000526040 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.26■■■■■ 5
RPS6KA1-212ENST00000526040 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.24■■■■■ 4.99
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARAP1Q96P48 1450 aa46.19■■■■■ 4.99
RPS6KA1-212ENST00000526040 NUP160Q12769 1436 aa46.08■■■■■ 4.97
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEP170Q5SW79 1584 aa46.06■■■■■ 4.96
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF27Q86VH2 1401 aa46.03■■■■■ 4.96
RPS6KA1-212ENST00000526040 IGF1RP08069 1367 aa45.92■■■■■ 4.94
RPS6KA1-212ENST00000526040 CUL7Q14999 1698 aa45.8■■■■■ 4.92
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHROOM2Q13796 1616 aa45.8■■■■■ 4.92
RPS6KA1-212ENST00000526040 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.77■■■■■ 4.92
RPS6KA1-212ENST00000526040 JPH4Q96JJ6 628 aa45.66■■■■■ 4.9
RPS6KA1-212ENST00000526040 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.65■■■■■ 4.9
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