RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523211.5

NKAIN3-202, Transcript of sodium/potassium transporting ATPase interacting 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NKAIN3, Length 1,988 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3-202ENST00000523211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.63■■■■□ 3.61
NKAIN3-202ENST00000523211 CEP162Q5TB80 1403 aa37.61■■■■□ 3.61
NKAIN3-202ENST00000523211 CEP170Q5SW79 1584 aa37.52■■■■□ 3.6
NKAIN3-202ENST00000523211 CLIP1P30622 1438 aa37.47■■■■□ 3.59
NKAIN3-202ENST00000523211 NUP160Q12769 1436 aa37.45■■■■□ 3.59
NKAIN3-202ENST00000523211 IQGAP2Q13576 1575 aa37.41■■■■□ 3.58
NKAIN3-202ENST00000523211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.39■■■■□ 3.58
NKAIN3-202ENST00000523211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.3■■■■□ 3.56
NKAIN3-202ENST00000523211 P3H3Q8IVL6 736 aa37.24■■■■□ 3.55
NKAIN3-202ENST00000523211 ARAP1Q96P48 1450 aa37.19■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.19■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.18■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 SAMD9Q5K651 1589 aa37.17■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 JPH4Q96JJ6 628 aa37.15■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.13■■■■□ 3.54
NKAIN3-202ENST00000523211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.13■■■■□ 3.53
NKAIN3-202ENST00000523211 OSCARQ8IYS5 282 aa37.08■■■■□ 3.53
NKAIN3-202ENST00000523211 DISP1Q96F81 1524 aa37.07■■■■□ 3.53
NKAIN3-202ENST00000523211 KIAA0556O60303 1618 aa37.04■■■■□ 3.52
NKAIN3-202ENST00000523211 SHROOM2Q13796 1616 aa37.02■■■■□ 3.52
NKAIN3-202ENST00000523211 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.02■■■■□ 3.52
NKAIN3-202ENST00000523211 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
NKAIN3-202ENST00000523211 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.95■■■■□ 3.51
NKAIN3-202ENST00000523211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
NKAIN3-202ENST00000523211 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.9■■■■□ 3.5
NKAIN3-202ENST00000523211 FMN1Q68DA7 1419 aa36.85■■■■□ 3.49
NKAIN3-202ENST00000523211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
NKAIN3-202ENST00000523211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
NKAIN3-202ENST00000523211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.71■■■■□ 3.47
NKAIN3-202ENST00000523211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
NKAIN3-202ENST00000523211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.69■■■■□ 3.46
NKAIN3-202ENST00000523211 PTPRGP23470 1445 aa36.67■■■■□ 3.46
NKAIN3-202ENST00000523211 APLP2Q06481 763 aa36.65■■■■□ 3.46
NKAIN3-202ENST00000523211 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.64■■■■□ 3.46
NKAIN3-202ENST00000523211 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.61■■■■□ 3.45
NKAIN3-202ENST00000523211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.59■■■■□ 3.45
NKAIN3-202ENST00000523211 HECW1Q76N89 1606 aa36.57■■■■□ 3.44
NKAIN3-202ENST00000523211 ARID3CA6NKF2 412 aa36.55■■■■□ 3.44
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCA8O94911 1581 aa36.53■■■■□ 3.44
NKAIN3-202ENST00000523211 TIAM1Q13009 1591 aa36.5■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 ARHGEF11O15085 1522 aa36.5■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.48■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 UACAQ9BZF9 1416 aa36.45■■■■□ 3.43
NKAIN3-202ENST00000523211 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 MAP3K1Q13233 1512 aa36.42■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.41■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.39■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.39■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.39■■■■□ 3.42
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCC2Q92887 1545 aa36.36■■■■□ 3.41
NKAIN3-202ENST00000523211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
NKAIN3-202ENST00000523211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
NKAIN3-202ENST00000523211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.33■■■■□ 3.41
NKAIN3-202ENST00000523211 ATP10BO94823 1461 aa36.28■■■■□ 3.4
NKAIN3-202ENST00000523211 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.27■■■■□ 3.4
NKAIN3-202ENST00000523211 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.26■■■■□ 3.4
NKAIN3-202ENST00000523211 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.26■■■■□ 3.4
NKAIN3-202ENST00000523211 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.25■■■■□ 3.39
NKAIN3-202ENST00000523211 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.2■■■■□ 3.39
NKAIN3-202ENST00000523211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.16■■■■□ 3.38
NKAIN3-202ENST00000523211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
NKAIN3-202ENST00000523211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
NKAIN3-202ENST00000523211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.14■■■■□ 3.38
NKAIN3-202ENST00000523211 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.07■■■■□ 3.37
NKAIN3-202ENST00000523211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
NKAIN3-202ENST00000523211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
NKAIN3-202ENST00000523211 NCOA2Q15596 1464 aa36.02■■■■□ 3.36
NKAIN3-202ENST00000523211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
NKAIN3-202ENST00000523211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.99■■■■□ 3.35
NKAIN3-202ENST00000523211 KIF14Q15058 1648 aa35.98■■■■□ 3.35
NKAIN3-202ENST00000523211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
NKAIN3-202ENST00000523211 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.9■■■■□ 3.34
NKAIN3-202ENST00000523211 KCNH8Q96L42 1107 aa35.88■■■■□ 3.33
NKAIN3-202ENST00000523211 ASXL2Q76L83 1435 aa35.86■■■■□ 3.33
NKAIN3-202ENST00000523211 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.84■■■■□ 3.33
NKAIN3-202ENST00000523211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.83■■■■□ 3.33
NKAIN3-202ENST00000523211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.81■■■■□ 3.32
NKAIN3-202ENST00000523211 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.79■■■■□ 3.32
NKAIN3-202ENST00000523211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.78■■■■□ 3.32
NKAIN3-202ENST00000523211 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.75■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.75■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.71■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 MAPKBP1O60336 1514 aa35.7■■■■□ 3.31
NKAIN3-202ENST00000523211 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
NKAIN3-202ENST00000523211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.69■■■■□ 3.3
NKAIN3-202ENST00000523211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.64■■■■□ 3.3
NKAIN3-202ENST00000523211 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 MIA2Q96PC5 1412 aa35.62■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.61■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.6■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 PREX2Q70Z35 1606 aa35.59■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.58■■■■□ 3.29
NKAIN3-202ENST00000523211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
NKAIN3-202ENST00000523211 ITGAEP38570 1179 aa35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms