RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	CUL7	Q14999	1698 aa		42.96	■■■■■ 4.47
TTC13-208	ENST00000522399	IGF1R	P08069	1367 aa		42.96	■■■■■ 4.47
TTC13-208	ENST00000522399	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.8	■■■■■ 4.44
TTC13-208	ENST00000522399	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.71	■■■■■ 4.43
TTC13-208	ENST00000522399	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.52	■■■■■ 4.4
TTC13-208	ENST00000522399	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.48	■■■■■ 4.39
TTC13-208	ENST00000522399	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.47	■■■■■ 4.39
TTC13-208	ENST00000522399	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.43	■■■■■ 4.38
TTC13-208	ENST00000522399	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TTC13-208	ENST00000522399	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.4	■■■■■ 4.38
TTC13-208	ENST00000522399	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.36	■■■■■ 4.37
TTC13-208	ENST00000522399	PTPRG	P23470	1445 aa		42.36	■■■■■ 4.37
TTC13-208	ENST00000522399	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.33	■■■■■ 4.37
TTC13-208	ENST00000522399	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.3	■■■■■ 4.36
TTC13-208	ENST00000522399	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TTC13-208	ENST00000522399	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
TTC13-208	ENST00000522399	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.22	■■■■■ 4.35
TTC13-208	ENST00000522399	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.16	■■■■■ 4.34
TTC13-208	ENST00000522399	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TTC13-208	ENST00000522399	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.11	■■■■■ 4.33
TTC13-208	ENST00000522399	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.06	■■■■■ 4.32
TTC13-208	ENST00000522399	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.05	■■■■■ 4.32
TTC13-208	ENST00000522399	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.04	■■■■■ 4.32
TTC13-208	ENST00000522399	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.02	■■■■■ 4.32
TTC13-208	ENST00000522399	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
TTC13-208	ENST00000522399	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.95	■■■■■ 4.31
TTC13-208	ENST00000522399	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.95	■■■■■ 4.31
TTC13-208	ENST00000522399	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.94	■■■■■ 4.3
TTC13-208	ENST00000522399	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.94	■■■■■ 4.3
TTC13-208	ENST00000522399	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.87	■■■■■ 4.29
TTC13-208	ENST00000522399	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TTC13-208	ENST00000522399	KDM6B	O15054	1643 aa		41.84	■■■■■ 4.29
TTC13-208	ENST00000522399	GLI2	P10070	1586 aa		41.81	■■■■■ 4.28
TTC13-208	ENST00000522399	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
TTC13-208	ENST00000522399	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.69	■■■■■ 4.26
TTC13-208	ENST00000522399	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.68	■■■■■ 4.26
TTC13-208	ENST00000522399	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
TTC13-208	ENST00000522399	ABCA8	O94911	1581 aa		41.62	■■■■■ 4.25
TTC13-208	ENST00000522399	EEA1	Q15075	1411 aa		41.6	■■■■■ 4.25
TTC13-208	ENST00000522399	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.59	■■■■■ 4.25
TTC13-208	ENST00000522399	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.58	■■■■■ 4.25
TTC13-208	ENST00000522399	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
TTC13-208	ENST00000522399	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.5	■■■■■ 4.23
TTC13-208	ENST00000522399	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.45	■■■■■ 4.23
TTC13-208	ENST00000522399	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.42	■■■■■ 4.22
TTC13-208	ENST00000522399	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.34	■■■■■ 4.21
TTC13-208	ENST00000522399	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.34	■■■■■ 4.21
TTC13-208	ENST00000522399	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.31	■■■■■ 4.2
TTC13-208	ENST00000522399	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.3	■■■■■ 4.2
TTC13-208	ENST00000522399	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.26	■■■■■ 4.2
TTC13-208	ENST00000522399	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.26	■■■■■ 4.2
TTC13-208	ENST00000522399	ATP10B	O94823	1461 aa		41.26	■■■■■ 4.2
TTC13-208	ENST00000522399	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TTC13-208	ENST00000522399	KIF21B	O75037	1637 aa		41.24	■■■■■ 4.19
TTC13-208	ENST00000522399	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.24	■■■■■ 4.19
TTC13-208	ENST00000522399	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
TTC13-208	ENST00000522399	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.12	■■■■■ 4.17
TTC13-208	ENST00000522399	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.08	■■■■■ 4.17
TTC13-208	ENST00000522399	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.08	■■■■■ 4.17
TTC13-208	ENST00000522399	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.08	■■■■■ 4.17
TTC13-208	ENST00000522399	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.05	■■■■■ 4.16
TTC13-208	ENST00000522399	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.05	■■■■■ 4.16
TTC13-208	ENST00000522399	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.04	■■■■■ 4.16
TTC13-208	ENST00000522399	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.02	■■■■■ 4.16
TTC13-208	ENST00000522399	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TTC13-208	ENST00000522399	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
TTC13-208	ENST00000522399	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.9	■■■■■ 4.14
TTC13-208	ENST00000522399	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TTC13-208	ENST00000522399	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.85	■■■■■ 4.13
TTC13-208	ENST00000522399	NEO1	Q92859	1461 aa		40.82	■■■■■ 4.12
TTC13-208	ENST00000522399	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.72	■■■■■ 4.11
TTC13-208	ENST00000522399	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.69	■■■■■ 4.1
TTC13-208	ENST00000522399	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
TTC13-208	ENST00000522399	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.66	■■■■■ 4.1
TTC13-208	ENST00000522399	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.65	■■■■■ 4.1	2e-7	■■■■□ 26.2
TTC13-208	ENST00000522399	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.64	■■■■■ 4.1
TTC13-208	ENST00000522399	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.61	■■■■■ 4.09
TTC13-208	ENST00000522399	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
TTC13-208	ENST00000522399	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TTC13-208	ENST00000522399	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TTC13-208	ENST00000522399	FANCA	O15360	1455 aa		40.58	■■■■■ 4.09
TTC13-208	ENST00000522399	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.54	■■■■■ 4.08
TTC13-208	ENST00000522399	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
TTC13-208	ENST00000522399	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
TTC13-208	ENST00000522399	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.47	■■■■■ 4.07
TTC13-208	ENST00000522399	PLCH2	O75038	1416 aa		40.41	■■■■■ 4.06
TTC13-208	ENST00000522399	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.4	■■■■■ 4.06
TTC13-208	ENST00000522399	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.39	■■■■■ 4.06
TTC13-208	ENST00000522399	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.37	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.36	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	KIF14	Q15058	1648 aa		40.35	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.34	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.33	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	CLIP1	P30622	1438 aa		40.33	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.32	■■■■■ 4.05
TTC13-208	ENST00000522399	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TTC13-208	ENST00000522399	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.27	■■■■■ 4.04
TTC13-208	ENST00000522399	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.26	■■■■■ 4.04

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