RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-208ENST00000522399 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.51■■■■■ 7.44
TTC13-208ENST00000522399 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.14■■■■■ 6.42
TTC13-208ENST00000522399 ABCC9O60706 1549 aa54.83■■■■■ 6.37
TTC13-208ENST00000522399 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.36■■■■■ 5.97
TTC13-208ENST00000522399 NACADO15069 1562 aa52.06■■■■■ 5.92
TTC13-208ENST00000522399 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.81■■■■■ 5.88
TTC13-208ENST00000522399 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.43■■■■■ 5.82
TTC13-208ENST00000522399 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.16■■■■■ 5.78
TTC13-208ENST00000522399 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.12■■■■■ 5.77
TTC13-208ENST00000522399 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.06■■■■■ 5.76
TTC13-208ENST00000522399 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
TTC13-208ENST00000522399 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.86■■■■■ 5.73
TTC13-208ENST00000522399 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.75■■■■■ 5.71
TTC13-208ENST00000522399 SCRIBQ14160 1630 aa50.22■■■■■ 5.63
TTC13-208ENST00000522399 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.2■■■■■ 5.63
TTC13-208ENST00000522399 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.56■■■■■ 5.52
TTC13-208ENST00000522399 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
TTC13-208ENST00000522399 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.38■■■■■ 5.5
TTC13-208ENST00000522399 NCAPD3P42695 1498 aa48.03■■■■■ 5.28
TTC13-208ENST00000522399 SMARCA4P51532 1647 aa47.95■■■■■ 5.27
TTC13-208ENST00000522399 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.91■■■■■ 5.26
TTC13-208ENST00000522399 SMARCA2P51531 1590 aa47.83■■■■■ 5.25
TTC13-208ENST00000522399 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.77■■■■■ 5.24
TTC13-208ENST00000522399 HMGXB3Q12766 1538 aa47.72■■■■■ 5.23
TTC13-208ENST00000522399 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
TTC13-208ENST00000522399 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
TTC13-208ENST00000522399 ERCC6Q03468 1493 aa47.38■■■■■ 5.17
TTC13-208ENST00000522399 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.37■■■■■ 5.17
TTC13-208ENST00000522399 CUX2O14529 1486 aa47.2■■■■■ 5.15
TTC13-208ENST00000522399 NESP48681 1621 aa47.15■■■■■ 5.14
TTC13-208ENST00000522399 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.94■■■■■ 5.11
TTC13-208ENST00000522399 WIZO95785 1651 aa46.84■■■■■ 5.09
TTC13-208ENST00000522399 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.83■■■■■ 5.09
TTC13-208ENST00000522399 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
TTC13-208ENST00000522399 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.66■■■■■ 5.06
TTC13-208ENST00000522399 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.6■■■■■ 5.05
TTC13-208ENST00000522399 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.58■■■■■ 5.05
TTC13-208ENST00000522399 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
TTC13-208ENST00000522399 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.29■■■■■ 5
TTC13-208ENST00000522399 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.22■■■■■ 4.99
TTC13-208ENST00000522399 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.11■■■■■ 4.97
TTC13-208ENST00000522399 WDR62O43379 1518 aa46.1■■■■■ 4.97
TTC13-208ENST00000522399 CFTRP13569 1480 aa46.1■■■■■ 4.97
TTC13-208ENST00000522399 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.06■■■■■ 4.96
TTC13-208ENST00000522399 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.74■■■■■ 4.91
TTC13-208ENST00000522399 PRDM2Q13029 1718 aa45.73■■■■■ 4.91
TTC13-208ENST00000522399 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
TTC13-208ENST00000522399 TOPBP1Q92547 1522 aa45.21■■■■■ 4.83
TTC13-208ENST00000522399 ABCC8Q09428 1581 aa45.19■■■■■ 4.82
TTC13-208ENST00000522399 IFT140Q96RY7 1462 aa45.17■■■■■ 4.82
TTC13-208ENST00000522399 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.09■■■■■ 4.81
TTC13-208ENST00000522399 OSCARQ8IYS5 282 aa45.08■■■■■ 4.81
TTC13-208ENST00000522399 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
TTC13-208ENST00000522399 TRIM41Q8WV44 630 aa44.89■■■■■ 4.78
TTC13-208ENST00000522399 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
TTC13-208ENST00000522399 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
TTC13-208ENST00000522399 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
TTC13-208ENST00000522399 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.66■■■■■ 4.74
TTC13-208ENST00000522399 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
TTC13-208ENST00000522399 SOGA1O94964 1423 aa44.58■■■■■ 4.73
TTC13-208ENST00000522399 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.56■■■■■ 4.72
TTC13-208ENST00000522399 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.52■■■■■ 4.72
TTC13-208ENST00000522399 CUX1P39880 1505 aa44.5■■■■■ 4.71
TTC13-208ENST00000522399 CHD1O14646 1710 aa44.46■■■■■ 4.71
TTC13-208ENST00000522399 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.45■■■■■ 4.71
TTC13-208ENST00000522399 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.45■■■■■ 4.71
TTC13-208ENST00000522399 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.45■■■■■ 4.71
TTC13-208ENST00000522399 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
TTC13-208ENST00000522399 WDR97A6NE52 1622 aa44.42■■■■■ 4.7
TTC13-208ENST00000522399 FBLN2P98095 1184 aa44.35■■■■■ 4.69
TTC13-208ENST00000522399 ARHGEF11O15085 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
TTC13-208ENST00000522399 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.23■■■■■ 4.67
TTC13-208ENST00000522399 GRIN2BQ13224 1484 aa44.17■■■■■ 4.66
TTC13-208ENST00000522399 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
TTC13-208ENST00000522399 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
TTC13-208ENST00000522399 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.04■■■■■ 4.64
TTC13-208ENST00000522399 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.04■■■■■ 4.64
TTC13-208ENST00000522399 PBRM1Q86U86 1689 aa44.03■■■■■ 4.64
TTC13-208ENST00000522399 SYNJ2O15056 1496 aa44■■■■■ 4.63
TTC13-208ENST00000522399 SYNJ1O43426 1573 aa43.98■■■■■ 4.63
TTC13-208ENST00000522399 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.98■■■■■ 4.63
TTC13-208ENST00000522399 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.95■■■■■ 4.63
TTC13-208ENST00000522399 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.93■■■■■ 4.62
TTC13-208ENST00000522399 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.93■■■■■ 4.62
TTC13-208ENST00000522399 TOP2BQ02880 1626 aa43.9■■■■■ 4.62
TTC13-208ENST00000522399 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.9■■■■■ 4.62
TTC13-208ENST00000522399 ARAP1Q96P48 1450 aa43.89■■■■■ 4.62
TTC13-208ENST00000522399 ADAMTS12P58397 1594 aa43.61■■■■■ 4.57
TTC13-208ENST00000522399 GRIN2AQ12879 1464 aa43.59■■■■■ 4.57
TTC13-208ENST00000522399 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.52■■■■■ 4.56
TTC13-208ENST00000522399 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.5■■■■■ 4.55
TTC13-208ENST00000522399 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
TTC13-208ENST00000522399 NUP160Q12769 1436 aa43.42■■■■■ 4.54
TTC13-208ENST00000522399 CEP170Q5SW79 1584 aa43.41■■■■■ 4.54
TTC13-208ENST00000522399 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.23■■■■■ 4.51
TTC13-208ENST00000522399 SHROOM2Q13796 1616 aa43.22■■■■■ 4.51
TTC13-208ENST00000522399 KIF27Q86VH2 1401 aa43.06■■■■■ 4.48
TTC13-208ENST00000522399 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
TTC13-208ENST00000522399 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.99■■■■■ 4.47
TTC13-208ENST00000522399 JPH4Q96JJ6 628 aa42.98■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms