RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520732.5

UBXN2B-202, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN2B, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-202ENST00000520732 CUL7Q14999 1698 aa28.65■■■□□ 2.18
UBXN2B-202ENST00000520732 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.63■■■□□ 2.17
UBXN2B-202ENST00000520732 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.6■■■□□ 2.17
UBXN2B-202ENST00000520732 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.59■■■□□ 2.17
UBXN2B-202ENST00000520732 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
UBXN2B-202ENST00000520732 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.36■■■□□ 2.13
UBXN2B-202ENST00000520732 PTPRGP23470 1445 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN2B-202ENST00000520732 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
UBXN2B-202ENST00000520732 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.3■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 IQGAP2Q13576 1575 aa28.3■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 MAPKBP1O60336 1514 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.27■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.27■■■□□ 2.12
UBXN2B-202ENST00000520732 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
UBXN2B-202ENST00000520732 DISP1Q96F81 1524 aa28.15■■■□□ 2.1
UBXN2B-202ENST00000520732 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.15■■■□□ 2.1
UBXN2B-202ENST00000520732 DIP2BQ9P265 1576 aa28.13■■■□□ 2.09
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCC2Q92887 1545 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN2B-202ENST00000520732 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
UBXN2B-202ENST00000520732 UACAQ9BZF9 1416 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN2B-202ENST00000520732 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
UBXN2B-202ENST00000520732 PRXQ9BXM0 1461 aa28.05■■■□□ 2.08
UBXN2B-202ENST00000520732 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.03■■■□□ 2.08
UBXN2B-202ENST00000520732 KIAA0556O60303 1618 aa28.02■■■□□ 2.08
UBXN2B-202ENST00000520732 ASXL2Q76L83 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
UBXN2B-202ENST00000520732 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28■■■□□ 2.07
UBXN2B-202ENST00000520732 GOLGA3Q08378 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
UBXN2B-202ENST00000520732 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.97■■■□□ 2.07
UBXN2B-202ENST00000520732 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.96■■■□□ 2.07
UBXN2B-202ENST00000520732 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
UBXN2B-202ENST00000520732 TSPOAP1O95153 1857 aa27.93■■■□□ 2.06
UBXN2B-202ENST00000520732 GLI2P10070 1586 aa27.91■■■□□ 2.06
UBXN2B-202ENST00000520732 KDM6BO15054 1643 aa27.88■■■□□ 2.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBXN2B-202ENST00000520732 EEA1Q15075 1411 aa27.84■■■□□ 2.05
UBXN2B-202ENST00000520732 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCA8O94911 1581 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN2B-202ENST00000520732 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN2B-202ENST00000520732 P3H3Q8IVL6 736 aa27.74■■■□□ 2.03
UBXN2B-202ENST00000520732 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
UBXN2B-202ENST00000520732 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.73■■■□□ 2.03
UBXN2B-202ENST00000520732 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.72■■■□□ 2.03
UBXN2B-202ENST00000520732 KCNH8Q96L42 1107 aa27.69■■■□□ 2.02
UBXN2B-202ENST00000520732 SAMD9Q5K651 1589 aa27.63■■■□□ 2.01
UBXN2B-202ENST00000520732 CD109Q6YHK3 1445 aa27.61■■■□□ 2.01
UBXN2B-202ENST00000520732 ATP10BO94823 1461 aa27.59■■■□□ 2.01
UBXN2B-202ENST00000520732 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
UBXN2B-202ENST00000520732 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.58■■■□□ 2.01
UBXN2B-202ENST00000520732 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.57■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 ARID3CA6NKF2 412 aa27.57■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.57■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.53■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 KIF21BO75037 1637 aa27.52■■■□□ 2
UBXN2B-202ENST00000520732 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
UBXN2B-202ENST00000520732 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
UBXN2B-202ENST00000520732 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.51■■□□□ 1.99
UBXN2B-202ENST00000520732 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.46■■□□□ 1.99
UBXN2B-202ENST00000520732 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
UBXN2B-202ENST00000520732 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.43■■□□□ 1.98
UBXN2B-202ENST00000520732 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
UBXN2B-202ENST00000520732 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN2B-202ENST00000520732 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.4■■□□□ 1.98
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.38■■□□□ 1.97
UBXN2B-202ENST00000520732 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.36■■□□□ 1.97
UBXN2B-202ENST00000520732 ADGRL1O94910 1474 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN2B-202ENST00000520732 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.33■■□□□ 1.97
UBXN2B-202ENST00000520732 NEO1Q92859 1461 aa27.28■■□□□ 1.96
UBXN2B-202ENST00000520732 FMN1Q68DA7 1419 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN2B-202ENST00000520732 RAPGEF3O95398 923 aa27.2■■□□□ 1.94
UBXN2B-202ENST00000520732 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
UBXN2B-202ENST00000520732 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN2B-202ENST00000520732 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
UBXN2B-202ENST00000520732 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 AKNAQ7Z591 1439 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 HECW1Q76N89 1606 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 FANCAO15360 1455 aa27.1■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN2B-202ENST00000520732 PLCH2O75038 1416 aa27.04■■□□□ 1.92
UBXN2B-202ENST00000520732 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.04■■□□□ 1.92
UBXN2B-202ENST00000520732 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.01■■□□□ 1.92
UBXN2B-202ENST00000520732 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
UBXN2B-202ENST00000520732 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN2B-202ENST00000520732 RICTORQ6R327 1708 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN2B-202ENST00000520732 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
UBXN2B-202ENST00000520732 CLIP1P30622 1438 aa26.95■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.93■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.92■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 KIF14Q15058 1648 aa26.91■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN2B-202ENST00000520732 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms