RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520732.5

UBXN2B-202, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN2B, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-202ENST00000520732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.09■■■■■ 4.17
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UBXN2B-202ENST00000520732 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.94■■■■□ 3.18
UBXN2B-202ENST00000520732 NACADO15069 1562 aa34.76■■■■□ 3.16
UBXN2B-202ENST00000520732 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.7■■■■□ 3.15
UBXN2B-202ENST00000520732 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.37■■■■□ 3.09
UBXN2B-202ENST00000520732 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.16■■■■□ 3.06
UBXN2B-202ENST00000520732 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
UBXN2B-202ENST00000520732 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
UBXN2B-202ENST00000520732 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.04■■■■□ 3.04
UBXN2B-202ENST00000520732 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.99■■■■□ 3.03
UBXN2B-202ENST00000520732 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.84■■■■□ 3.01
UBXN2B-202ENST00000520732 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.5■■■□□ 2.95
UBXN2B-202ENST00000520732 SCRIBQ14160 1630 aa33.46■■■□□ 2.95
UBXN2B-202ENST00000520732 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.04■■■□□ 2.88
UBXN2B-202ENST00000520732 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
UBXN2B-202ENST00000520732 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.96■■■□□ 2.87
UBXN2B-202ENST00000520732 NCAPD3P42695 1498 aa32.11■■■□□ 2.73
UBXN2B-202ENST00000520732 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32■■■□□ 2.71
UBXN2B-202ENST00000520732 SMARCA4P51532 1647 aa31.97■■■□□ 2.71
UBXN2B-202ENST00000520732 SMARCA2P51531 1590 aa31.94■■■□□ 2.7
UBXN2B-202ENST00000520732 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
UBXN2B-202ENST00000520732 HMGXB3Q12766 1538 aa31.84■■■□□ 2.69
UBXN2B-202ENST00000520732 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
UBXN2B-202ENST00000520732 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.69■■■□□ 2.66
UBXN2B-202ENST00000520732 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.62■■■□□ 2.65
UBXN2B-202ENST00000520732 ERCC6Q03468 1493 aa31.6■■■□□ 2.65
UBXN2B-202ENST00000520732 CUX2O14529 1486 aa31.5■■■□□ 2.63
UBXN2B-202ENST00000520732 NESP48681 1621 aa31.44■■■□□ 2.62
UBXN2B-202ENST00000520732 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.33■■■□□ 2.61
UBXN2B-202ENST00000520732 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.31■■■□□ 2.6
UBXN2B-202ENST00000520732 WIZO95785 1651 aa31.23■■■□□ 2.59
UBXN2B-202ENST00000520732 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.2■■■□□ 2.59
UBXN2B-202ENST00000520732 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.16■■■□□ 2.58
UBXN2B-202ENST00000520732 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
UBXN2B-202ENST00000520732 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
UBXN2B-202ENST00000520732 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.03■■■□□ 2.56
UBXN2B-202ENST00000520732 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
UBXN2B-202ENST00000520732 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.84■■■□□ 2.53
UBXN2B-202ENST00000520732 CFTRP13569 1480 aa30.81■■■□□ 2.52
UBXN2B-202ENST00000520732 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.77■■■□□ 2.52
UBXN2B-202ENST00000520732 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.75■■■□□ 2.51
UBXN2B-202ENST00000520732 WDR62O43379 1518 aa30.74■■■□□ 2.51
UBXN2B-202ENST00000520732 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.57■■■□□ 2.48
UBXN2B-202ENST00000520732 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
UBXN2B-202ENST00000520732 PRDM2Q13029 1718 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCC8Q09428 1581 aa30.24■■■□□ 2.43
UBXN2B-202ENST00000520732 OSCARQ8IYS5 282 aa30.19■■■□□ 2.42
UBXN2B-202ENST00000520732 TOPBP1Q92547 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
UBXN2B-202ENST00000520732 IFT140Q96RY7 1462 aa30.17■■■□□ 2.42
UBXN2B-202ENST00000520732 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
UBXN2B-202ENST00000520732 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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UBXN2B-202ENST00000520732 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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UBXN2B-202ENST00000520732 SOGA1O94964 1423 aa29.81■■■□□ 2.36
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UBXN2B-202ENST00000520732 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
UBXN2B-202ENST00000520732 CUX1P39880 1505 aa29.7■■■□□ 2.34
UBXN2B-202ENST00000520732 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
UBXN2B-202ENST00000520732 FBLN2P98095 1184 aa29.67■■■□□ 2.34
UBXN2B-202ENST00000520732 WDR97A6NE52 1622 aa29.64■■■□□ 2.34
UBXN2B-202ENST00000520732 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
UBXN2B-202ENST00000520732 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
UBXN2B-202ENST00000520732 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.6■■■□□ 2.33
UBXN2B-202ENST00000520732 CHD1O14646 1710 aa29.59■■■□□ 2.33
UBXN2B-202ENST00000520732 ARHGEF11O15085 1522 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN2B-202ENST00000520732 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
UBXN2B-202ENST00000520732 GRIN2BQ13224 1484 aa29.5■■■□□ 2.31
UBXN2B-202ENST00000520732 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.5■■■□□ 2.31
UBXN2B-202ENST00000520732 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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UBXN2B-202ENST00000520732 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.42■■■□□ 2.3
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.41■■■□□ 2.3
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UBXN2B-202ENST00000520732 SYNJ2O15056 1496 aa29.37■■■□□ 2.29
UBXN2B-202ENST00000520732 SYNJ1O43426 1573 aa29.34■■■□□ 2.29
UBXN2B-202ENST00000520732 PBRM1Q86U86 1689 aa29.31■■■□□ 2.28
UBXN2B-202ENST00000520732 TOP2BQ02880 1626 aa29.3■■■□□ 2.28
UBXN2B-202ENST00000520732 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.29■■■□□ 2.28
UBXN2B-202ENST00000520732 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.28■■■□□ 2.28
UBXN2B-202ENST00000520732 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.27■■■□□ 2.28
UBXN2B-202ENST00000520732 ARAP1Q96P48 1450 aa29.26■■■□□ 2.27
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UBXN2B-202ENST00000520732 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.07■■■□□ 2.24
UBXN2B-202ENST00000520732 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.06■■■□□ 2.24
UBXN2B-202ENST00000520732 ADAMTS12P58397 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
UBXN2B-202ENST00000520732 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
UBXN2B-202ENST00000520732 NUP160Q12769 1436 aa29■■■□□ 2.23
UBXN2B-202ENST00000520732 CEP170Q5SW79 1584 aa28.93■■■□□ 2.22
UBXN2B-202ENST00000520732 SHROOM2Q13796 1616 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN2B-202ENST00000520732 KIF27Q86VH2 1401 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN2B-202ENST00000520732 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.8■■■□□ 2.2
UBXN2B-202ENST00000520732 JPH4Q96JJ6 628 aa28.8■■■□□ 2.2
UBXN2B-202ENST00000520732 IGF1RP08069 1367 aa28.76■■■□□ 2.2
UBXN2B-202ENST00000520732 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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