RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520166.5

TSNARE1-205, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-205ENST00000520166 CEP162Q5TB80 1403 aa27.37■■□□□ 1.97
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TSNARE1-205ENST00000520166 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-205ENST00000520166 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-205ENST00000520166 HECW1Q76N89 1606 aa26.53■■□□□ 1.84
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TSNARE1-205ENST00000520166 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-205ENST00000520166 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1-205ENST00000520166 KCNH8Q96L42 1107 aa26.22■■□□□ 1.79
TSNARE1-205ENST00000520166 NCOA2Q15596 1464 aa26.21■■□□□ 1.79
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TSNARE1-205ENST00000520166 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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TSNARE1-205ENST00000520166 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-205ENST00000520166 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-205ENST00000520166 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1-205ENST00000520166 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-205ENST00000520166 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-205ENST00000520166 MIA2Q96PC5 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
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TSNARE1-205ENST00000520166 PLCH2O75038 1416 aa25.86■■□□□ 1.73
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