RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519363.1

PABPC1-210, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 4

Gene PABPC1, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-210ENST00000519363 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 IQGAP2Q13576 1575 aa23.82■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 CEP170Q5SW79 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 NUP160Q12769 1436 aa23.79■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.78■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.77■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 SAMD9Q5K651 1589 aa23.77■■□□□ 1.4
PABPC1-210ENST00000519363 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PABPC1-210ENST00000519363 ARAP1Q96P48 1450 aa23.75■■□□□ 1.39
PABPC1-210ENST00000519363 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.71■■□□□ 1.39
PABPC1-210ENST00000519363 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.7■■□□□ 1.38
PABPC1-210ENST00000519363 FBLN2P98095 1184 aa23.64■■□□□ 1.37
PABPC1-210ENST00000519363 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PABPC1-210ENST00000519363 KIAA0556O60303 1618 aa23.59■■□□□ 1.37
PABPC1-210ENST00000519363 SHROOM2Q13796 1616 aa23.57■■□□□ 1.36
PABPC1-210ENST00000519363 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.57■■□□□ 1.36
PABPC1-210ENST00000519363 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.56■■□□□ 1.36
PABPC1-210ENST00000519363 DISP1Q96F81 1524 aa23.55■■□□□ 1.36
PABPC1-210ENST00000519363 FMN1Q68DA7 1419 aa23.52■■□□□ 1.36
PABPC1-210ENST00000519363 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PABPC1-210ENST00000519363 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.48■■□□□ 1.35
PABPC1-210ENST00000519363 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.46■■□□□ 1.35
PABPC1-210ENST00000519363 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.45■■□□□ 1.34
PABPC1-210ENST00000519363 JPH4Q96JJ6 628 aa23.44■■□□□ 1.34
PABPC1-210ENST00000519363 MAP3K1Q13233 1512 aa23.43■■□□□ 1.34
PABPC1-210ENST00000519363 P3H3Q8IVL6 736 aa23.42■■□□□ 1.34
PABPC1-210ENST00000519363 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.41■■□□□ 1.34
PABPC1-210ENST00000519363 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PABPC1-210ENST00000519363 HECW1Q76N89 1606 aa23.37■■□□□ 1.33
PABPC1-210ENST00000519363 TIAM1Q13009 1591 aa23.36■■□□□ 1.33
PABPC1-210ENST00000519363 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.33■■□□□ 1.33
PABPC1-210ENST00000519363 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.32■■□□□ 1.32
PABPC1-210ENST00000519363 APLP2Q06481 763 aa23.31■■□□□ 1.32
PABPC1-210ENST00000519363 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.29■■□□□ 1.32
PABPC1-210ENST00000519363 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.27■■□□□ 1.32
PABPC1-210ENST00000519363 OSCARQ8IYS5 282 aa23.26■■□□□ 1.31
PABPC1-210ENST00000519363 ABCA8O94911 1581 aa23.26■■□□□ 1.31
PABPC1-210ENST00000519363 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PABPC1-210ENST00000519363 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.21■■□□□ 1.31
PABPC1-210ENST00000519363 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PABPC1-210ENST00000519363 PTPRGP23470 1445 aa23.19■■□□□ 1.3
PABPC1-210ENST00000519363 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.18■■□□□ 1.3
PABPC1-210ENST00000519363 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.15■■□□□ 1.3
PABPC1-210ENST00000519363 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC2Q92887 1545 aa23.11■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 UACAQ9BZF9 1416 aa23.1■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
PABPC1-210ENST00000519363 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PABPC1-210ENST00000519363 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.07■■□□□ 1.28
PABPC1-210ENST00000519363 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PABPC1-210ENST00000519363 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.04■■□□□ 1.28
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGEF11O15085 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 ADCY10Q96PN6 1610 aa23■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 ATP10BO94823 1461 aa23■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 NCOA2Q15596 1464 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.96■■□□□ 1.27
PABPC1-210ENST00000519363 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.94■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.92■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 KIF14Q15058 1648 aa22.9■■□□□ 1.26
PABPC1-210ENST00000519363 ARID3CA6NKF2 412 aa22.89■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.87■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.85■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.83■■□□□ 1.25
PABPC1-210ENST00000519363 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.81■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.79■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 MIA2Q96PC5 1412 aa22.79■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.77■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.77■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PABPC1-210ENST00000519363 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.73■■□□□ 1.23
PABPC1-210ENST00000519363 PREX2Q70Z35 1606 aa22.72■■□□□ 1.23
PABPC1-210ENST00000519363 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PABPC1-210ENST00000519363 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.71■■□□□ 1.23
PABPC1-210ENST00000519363 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.69■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 ASXL2Q76L83 1435 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 MAPKBP1O60336 1514 aa22.66■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.65■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.64■■□□□ 1.22
PABPC1-210ENST00000519363 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.63■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.6■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PABPC1-210ENST00000519363 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.9 ms