RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517979.1

CCDC25-202, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC25, Length 877 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-202ENST00000517979 MSH5O43196 834 aa23.75■■□□□ 1.39
CCDC25-202ENST00000517979 CEP170Q5SW79 1584 aa23.73■■□□□ 1.39
CCDC25-202ENST00000517979 NUP160Q12769 1436 aa23.72■■□□□ 1.39
CCDC25-202ENST00000517979 KIF27Q86VH2 1401 aa23.68■■□□□ 1.38
CCDC25-202ENST00000517979 IGF1RP08069 1367 aa23.59■■□□□ 1.37
CCDC25-202ENST00000517979 CUL7Q14999 1698 aa23.58■■□□□ 1.37
CCDC25-202ENST00000517979 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC25-202ENST00000517979 SHROOM2Q13796 1616 aa23.57■■□□□ 1.36
CCDC25-202ENST00000517979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC25-202ENST00000517979 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCDC25-202ENST00000517979 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC25-202ENST00000517979 JPH4Q96JJ6 628 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC25-202ENST00000517979 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC25-202ENST00000517979 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.42■■□□□ 1.34
CCDC25-202ENST00000517979 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
CCDC25-202ENST00000517979 IQGAP2Q13576 1575 aa23.27■■□□□ 1.32
CCDC25-202ENST00000517979 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC25-202ENST00000517979 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.16■■□□□ 1.3
CCDC25-202ENST00000517979 PTPRGP23470 1445 aa23.15■■□□□ 1.3
CCDC25-202ENST00000517979 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CCDC25-202ENST00000517979 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.14■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 PRXQ9BXM0 1461 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 DISP1Q96F81 1524 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC25-202ENST00000517979 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.07■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 MAPKBP1O60336 1514 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 KIAA0556O60303 1618 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.03■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 EEA1Q15075 1411 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.02■■□□□ 1.28
CCDC25-202ENST00000517979 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 UACAQ9BZF9 1416 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 ABCC2Q92887 1545 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 GOLGA3Q08378 1498 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 DIP2BQ9P265 1576 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC25-202ENST00000517979 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC25-202ENST00000517979 ASXL2Q76L83 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC25-202ENST00000517979 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC25-202ENST00000517979 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC25-202ENST00000517979 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC25-202ENST00000517979 KIF21BO75037 1637 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 ABCA8O94911 1581 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 P3H3Q8IVL6 736 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 TSPOAP1O95153 1857 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 SAMD9Q5K651 1589 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC25-202ENST00000517979 GLI2P10070 1586 aa22.76■■□□□ 1.23
CCDC25-202ENST00000517979 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CCDC25-202ENST00000517979 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CCDC25-202ENST00000517979 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.72■■□□□ 1.23
CCDC25-202ENST00000517979 KDM6BO15054 1643 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.69■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 KCNA4P22459 653 aa22.67■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.66■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 ARID3CA6NKF2 412 aa22.65■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.64■■□□□ 1.22
CCDC25-202ENST00000517979 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 ATP10BO94823 1461 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 KCNH8Q96L42 1107 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.59■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CCDC25-202ENST00000517979 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.55■■□□□ 1.2
CCDC25-202ENST00000517979 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCDC25-202ENST00000517979 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCDC25-202ENST00000517979 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCDC25-202ENST00000517979 CD109Q6YHK3 1445 aa22.53■■□□□ 1.2
CCDC25-202ENST00000517979 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCDC25-202ENST00000517979 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.49■■□□□ 1.19
CCDC25-202ENST00000517979 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC25-202ENST00000517979 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCDC25-202ENST00000517979 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC25-202ENST00000517979 FMN1Q68DA7 1419 aa22.42■■□□□ 1.18
CCDC25-202ENST00000517979 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 HECW1Q76N89 1606 aa22.38■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCDC25-202ENST00000517979 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC25-202ENST00000517979 NEO1Q92859 1461 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC25-202ENST00000517979 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC25-202ENST00000517979 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.162e-7■■■■□ 26.2
CCDC25-202ENST00000517979 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CLIP1P30622 1438 aa22.25■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 ADGRL1O94910 1474 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC25-202ENST00000517979 FANCAO15360 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC25-202ENST00000517979 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms